cmonkey.meme
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meme.py - cMonkey meme suite integration
These are functions and classes to conveniently call the needed
commands of the MEME suite in order to find motifs
 
This file is part of cMonkey Python. Please see README and LICENSE for
more information and licensing details.

 
Modules
       
xml.etree.ElementTree
collections
logging
os
re
shutil
cmonkey.seqtools
subprocess
tempfile
cmonkey.util

 
Functions
       
read_meme_output(output_text, num_motifs)
Reads meme output file into a list of MotifInfo objects

 
Data
        __all__ = ['read_meme_output']