Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 985,690 | Δ1 bp | 100% | intergenic (+29/‑55) | betB → / → betA | betaine‑aldehyde dehydrogenase/choline dehydrogenase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 985,690 | 0 | C→. | 100.0% | 72.3 | 160 | intergenic (+29/‑55) | betB/betA | betaine‑aldehyde dehydrogenase/choline dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (30/106): ref base (21/1): total (53/107) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.75e-11 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.59e-15 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CGCGATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGC.CGGTCCCCCCCCGGACCCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTCGGGCGG > NC_014034/985592‑985785
|
cgcgATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGACCCCCCCGGGccc > 2:1901989/1‑101 (MQ=255)
cgATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGAccccc < 2:475667/101‑1 (MQ=255)
gATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGAcccccc < 1:3096719/101‑1 (MQ=255)
gATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGAcccccc < 1:1709659/101‑1 (MQ=255)
gATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGAcccccc > 1:1398123/1‑101 (MQ=255)
gATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGACCCCCCCCGGAcccccc > 2:1424419/1‑101 (MQ=255)
gATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGCCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGGCCCCCCCCGGcccccc > 2:4209416/1‑101 (MQ=255)
aTCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGAccccccg < 1:1497966/101‑2 (MQ=255)
aTCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGAccccccg < 2:1598488/101‑2 (MQ=255)
cGAGCACAATACGCAGGCGAAGGCCGTCTATGCCGGCATGGGGCCGGACGAGAGCCCCGATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGTccccccggc < 2:2201389/101‑4 (MQ=255)
gAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTGTTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGGCCCCCCCgcg > 2:387817/1‑99 (MQ=255)
aGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGt < 1:2450648/101‑1 (MQ=255)
gCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTa < 2:375426/101‑1 (MQ=255)
caataaagcgaGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.GCCCCCGGCGTAt < 1:57436/91‑1 (MQ=255)
cACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTAt < 2:3265600/101‑1 (MQ=255)
aCTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTAtt < 2:3416665/101‑1 (MQ=255)
aCTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTAtt < 1:3766928/101‑1 (MQ=255)
aCTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCGGAccccccgccggatt > 2:4527471/1‑93 (MQ=255)
aCTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGGCCCCCCCgaacgga > 2:2721452/1‑95 (MQ=255)
cTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTAttt < 2:3389289/101‑1 (MQ=255)
cTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTAttt < 1:1305792/101‑1 (MQ=255)
cTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTAttt < 1:4184160/101‑1 (MQ=255)
tataCGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTg < 1:2840110/101‑1 (MQ=255)
tataCGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGACCCCCCC.GCGGATTTg > 1:666446/1‑101 (MQ=255)
ataCGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGGCCCCCCCCCCcccccccccgcgctttc > 1:3218265/1‑91 (MQ=255)
taCGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTgcg < 2:2823031/101‑1 (MQ=255)
cGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGACCCCCCC.GCGGATTTGCG.cc > 1:4158263/1‑101 (MQ=255)
cGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.cc < 2:3176692/101‑1 (MQ=255)
cGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCGGACCCCCCC.GCGCCTTTGCG.cc > 2:4354612/1‑101 (MQ=255)
gCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCa < 1:3952331/101‑1 (MQ=255)
gCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCa < 1:4456687/101‑1 (MQ=255)
gTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGTTCGAGAGCCCCTATTGAACCGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGaa < 2:3010690/101‑1 (MQ=38)
gTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGCCCCCCCCGCCG.ATTTGCG.CCCAGaa > 1:4528065/1‑101 (MQ=255)
gTGAAGCCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGaa < 2:944283/101‑1 (MQ=38)
gAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGaaaa < 1:4610647/101‑1 (MQ=255)
gAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCAG.CCCCCCCGGCCGATTTGCG.CCAAGaaaa > 2:755775/1‑101 (MQ=255)
gCCGTCTATGTGGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACa < 1:898987/101‑1 (MQ=37)
gCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGGCCCCCCC.GCGGATTTGCG.CCCAGAAAAAACa > 1:1277167/1‑101 (MQ=255)
cGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAgg < 2:4578828/101‑1 (MQ=255)
gTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAggg < 1:4650376/101‑1 (MQ=255)
gTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGGGTATTTGCG.CCAAGAAAAAAAAggg > 1:2670491/1‑101 (MQ=255)
tCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGt < 1:3147517/101‑1 (MQ=255)
tCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCGGGCCCCCCC.GCGGATTTGCG.CCCAGAAAAAACAgggg > 2:1128638/1‑100 (MQ=255)
ttATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGtt < 1:3552298/100‑1 (MQ=38)
cTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAggggt > 1:1566211/1‑99 (MQ=37)
cTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGtt < 2:226192/101‑1 (MQ=255)
cTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGGCCCCCCC.GCGGATTTGCG.CCAAGaaaaaaaaagggg > 1:4545928/1‑94 (MQ=255)
tATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTc < 1:1798248/101‑1 (MQ=255)
tATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTc < 2:3706104/101‑1 (MQ=255)
aTGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCa < 1:3457603/101‑1 (MQ=255)
tGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGACCCCCCC.GCGGATTTTCG.CCAAGAAAAAACAGGGGTCAg > 1:4308077/1‑101 (MQ=255)
tGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCCGCGGGGGCCCCCCCCCCGCCCCCCCGCGGGTTTTCCG.CCCAAAAAAAACacgcgac > 2:4003080/1‑95 (MQ=255)
gTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGGGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAgg < 1:4209663/101‑1 (MQ=255)
tCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGc < 2:4465705/101‑1 (MQ=255)
cGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCa < 2:3001719/101‑1 (MQ=255)
cGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCa < 1:387861/101‑1 (MQ=255)
gCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCaga < 1:163550/101‑1 (MQ=255)
gCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGGCCCCCCCCCGCCCCCCC.GCGGATTTGGGCCCCAGAAAAAAAGGGGtacggcggg > 1:402990/1‑93 (MQ=255)
aTGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCCGGCCCCCCC.GCGCATTTGCG.CCCAGAAAAAAAAGGGGTCAGGGCGAgg > 1:2041679/1‑101 (MQ=255)
ggggCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGt < 1:3642142/101‑1 (MQ=255)
ggggCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGt < 1:2984363/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTc < 2:675917/101‑1 (MQ=37)
gggCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTc < 2:65479/101‑1 (MQ=255)
ggCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTcg < 1:344646/101‑1 (MQ=255)
cagTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTcgcgc < 2:2636959/99‑1 (MQ=39)
ggTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGGCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGGTCAGGCAGAGGGGcgcgcg > 2:1532307/1‑101 (MQ=25)
cgTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTcgcgcg < 2:1929866/100‑1 (MQ=38)
gTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCga < 1:3322803/101‑1 (MQ=255)
gTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCga < 2:556047/101‑1 (MQ=255)
tCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGGTTAGGCAGAGGGTCGCGCgag > 2:1358055/1‑100 (MQ=37)
gagaGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTGGCGCggtgg > 2:2321378/1‑101 (MQ=38)
gagaGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCgatgg < 2:2860849/101‑1 (MQ=255)
agCCGCTGTTGCAACGCAGGCCGGG.GGGTTCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCgatggatg < 2:4301188/101‑1 (MQ=25)
agCCCTTATTGAACCCCAGGCCGG..GGGGCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGc < 2:2523017/101‑1 (MQ=37)
agCCCCTATTGAAACGCATGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCgatggatg < 1:1902101/101‑1 (MQ=37)
gCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGc < 1:1128724/101‑1 (MQ=255)
gCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGc < 2:2768497/101‑1 (MQ=255)
cccTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCgg < 1:2254885/101‑1 (MQ=255)
cTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCgatctgtcaggat < 2:4124354/101‑11 (MQ=37)
cTATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGAt < 1:1424513/101‑1 (MQ=255)
tATTGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGAtt < 2:3518809/101‑1 (MQ=255)
ttGAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTAt < 1:3491759/101‑1 (MQ=255)
gAAACGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCCGA.CCCCCCGGCGGATTTGCG.CCAAGAAAAAACAAGGGTCAGGCAGAGGGGCGCGCGATGGATGCGGATTAtgt > 2:4530944/1‑101 (MQ=255)
aaCGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGa < 2:2431296/101‑1 (MQ=255)
cGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATc < 1:2625314/101‑1 (MQ=255)
cGCAGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATc < 1:1994985/101‑1 (MQ=255)
aGGCCGGG.GGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGtt > 2:3103364/1‑101 (MQ=255)
ggccggg.gGGTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCCAGAAAAAACAGGGATCAGGCAGAGGGGCGCGCGATGGATGCGGCTTATGTGATCGTTg > 2:1230329/1‑101 (MQ=255)
ggggggTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGc < 2:3811350/97‑1 (MQ=255)
ggggggTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGc > 1:2348303/5‑101 (MQ=255)
gggggTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGttagatcg > 2:2031473/4‑95 (MQ=38)
gggggTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCa < 2:3961621/98‑1 (MQ=255)
gggggTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCa > 1:4227744/4‑101 (MQ=255)
ggTCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGc > 2:1871319/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCCCGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTc < 1:4011927/101‑1 (MQ=255)
ccccccccGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTCg < 1:1144645/101‑1 (MQ=255)
ccccccccCGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCGAGAAAAAACAGGGTTCCGGCAGAGGGGCGCGCGCTGGGTGCGGGTTATTTGGCCGTTGGGGCAGGGTCg > 2:630800/1‑101 (MQ=19)
cccccccGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTCgg > 1:2104647/1‑101 (MQ=255)
ccccccGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTCggg > 1:2922456/1‑101 (MQ=255)
cccccGGA.CCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTCGggc > 2:1236242/1‑101 (MQ=255)
|
CGCGATCGAGCACTATACGCAGGTGAAGGCCGTCTATGTCGGCATGGGGCCGGTCGAGAGCCCCTATTGAAACGCAGGCCGGC.CGGTCCCCCCCCGGACCCCCCCGGCGTATTTGCG.CCAAGAAAAAACAGGGTTCAGGCAGAGGGTCGCGCGATGGATGCGGATTATGTGATCGTTGGGGCAGGCTCGGGCGG > NC_014034/985592‑985785
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|