New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221956 =272 (1.170)142 (0.630) 22/190 18.2 0.28 coding (701/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222081 441 (1.860)coding (576/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 380 total aligned reads displayed.

TTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGG  >  NC_014034/221856‑222056
                                                                                                     |                                                                                                    
  cGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCgga                                                                                                    <  2:3753074/101‑1 (MQ=255)
   gCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggat                                                                                                   <  2:4181362/101‑1 (MQ=255)
     cGGTGCCCGACCCCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCCCGGTAggatcg                                                                                                 <  2:399242/101‑1 (MQ=255)
              acacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtcc                                                                                        <  1:3605290/101‑1 (MQ=255)
                 ccGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtg                                                                                     <  1:583452/101‑1 (MQ=255)
                  cGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCACCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGGGgggtcggtcggggccgtgg                                                                                    >  1:4600603/1‑101 (MQ=255)
                   gTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGCGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccggggg                                                                                   >  1:2890939/1‑101 (MQ=255)
                     cGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                 >  1:653551/1‑101 (MQ=255)
                      gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                <  2:2702923/101‑1 (MQ=255)
                      gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                <  2:4257433/101‑1 (MQ=255)
                       ccGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                               <  1:3776132/101‑1 (MQ=255)
                       ccGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                               <  2:983931/101‑1 (MQ=255)
                         gAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                             >  1:3522456/1‑101 (MQ=255)
                          aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                            <  1:3113131/101‑1 (MQ=255)
                             cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                         >  1:420818/1‑101 (MQ=255)
                                gggTGTTTGGGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                      <  1:3391851/100‑1 (MQ=255)
                                   tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                   <  2:1409775/101‑1 (MQ=255)
                                     ttGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                 >  2:1342834/1‑101 (MQ=255)
                                         tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                             <  2:4591181/101‑1 (MQ=255)
                                             cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                         <  2:4075373/101‑1 (MQ=255)
                                              aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                        <  1:306261/101‑1 (MQ=255)
                                                 gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                     <  1:1144811/101‑1 (MQ=255)
                                                 gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                     >  1:1537472/1‑101 (MQ=255)
                                                  tCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgcccac                                                    <  2:856123/101‑6 (MQ=255)
                                                   cGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                   >  1:2294911/1‑101 (MQ=255)
                                                     ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                 <  1:2423714/101‑1 (MQ=255)
                                                       ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                               <  1:3248745/101‑1 (MQ=255)
                                                       ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                               >  1:192308/1‑101 (MQ=255)
                                                        gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                              >  1:1303145/1‑101 (MQ=255)
                                                          tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                            <  2:1814117/101‑1 (MQ=255)
                                                          gcgcgCTCATCGGCGGTGGTCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                            <  2:2075617/100‑1 (MQ=255)
                                                           cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                           >  2:3201915/1‑101 (MQ=255)
                                                            gcgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                          <  1:2090600/101‑1 (MQ=255)
                                                             cgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                         >  1:4427529/1‑101 (MQ=255)
                                                              gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                        <  2:1228745/101‑1 (MQ=255)
                                                               cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                       >  2:4367339/1‑101 (MQ=255)
                                                               cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                       >  1:1373265/1‑101 (MQ=255)
                                                                   tCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                   <  2:1099600/101‑1 (MQ=255)
                                                                     gACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                 >  2:1036200/1‑101 (MQ=255)
                                                                       cGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                               >  2:573512/1‑101 (MQ=255)
                                                                            gtctgtggATGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                           <  2:4690586/95‑1 (MQ=11)
                                                                               gTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                       <  2:3083794/101‑1 (MQ=255)
                                                                                tCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                      >  1:3942536/1‑101 (MQ=255)
                                                                                 cGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                     >  1:138446/1‑101 (MQ=255)
                                                                                  ggATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                    <  1:2581837/101‑1 (MQ=255)
                                                                                    gtGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                  <  1:3649937/100‑1 (MQ=255)
                                                                                    atcc.GTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcgggt                  <  1:4530219/98‑3 (MQ=1)
                                                                                    aTGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                  <  1:1352937/101‑1 (MQ=255)
                                                                                    aTGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                  >  1:996551/1‑101 (MQ=255)
                                                                                      gC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                <  2:1999038/101‑1 (MQ=11)
                                                                                      ctggcgggGTCGGTGGGGTCGGCCGGGGCCGTGGGATAGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                 <  1:344523/96‑1 (MQ=11)
                                                                                      cc.GTGGGATCGTTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                <  2:294770/100‑1 (MQ=1)
                                                                                       gtttGGGATCTGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                <  1:1952836/98‑1 (MQ=11)
                                                                                       cggTGGGATCGGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                <  1:10081/99‑1 (MQ=11)
                                                                                        ggTGGGGTCGGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg               <  1:2322773/100‑1 (MQ=11)
                                                                                         gTGGGGTCCGGCGGAGCGGGCGGTTCGGGGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt              <  1:173033/101‑1 (MQ=11)
                                                                                         gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg              >  1:278965/1‑100 (MQ=11)
                                                                                          tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg             <  1:1036279/101‑1 (MQ=255)
                                                                                          tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg             >  2:2058830/1‑101 (MQ=255)
                                                                                          tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGtcggtcggggccggg             >  2:3425017/1‑94 (MQ=14)
                                                                                           gggGTCGGGTGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg            <  1:2052917/101‑3 (MQ=11)
                                                                                           gggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGg            <  2:651949‑M2/101‑2 (MQ=255)
                                                                                           gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg            >  2:901517/1‑99 (MQ=1)
                                                                                           gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg            <  2:2898036/101‑3 (MQ=11)
                                                                                            ggCTCCGTCGGATCGGTCGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg           <  2:3307885/101‑1 (MQ=11)
                                                                                             ggtccggaggatccgtcggctcagtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa          <  2:2421331/93‑1 (MQ=11)
                                                                                              gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt         >  1:3343089/5‑101 (MQ=14)
                                                                                              cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt         <  1:939392/101‑1 (MQ=255)
                                                                                              atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCCTGGGATCGGACGGATACGTggatt         >  1:547116/8‑98 (MQ=11)
                                                                                               tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc        <  2:1537371/101‑1 (MQ=255)
                                                                                               tccgtgggatcggtcgggacagtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc        <  2:2601779/95‑1 (MQ=11)
                                                                                               tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc        <  2:2394722/98‑1 (MQ=11)
                                                                                               tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGCCCGGAGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATAGATCGGGTCAGTGGGAta        >  2:2333490/4‑100 (MQ=11)
                                                                                               tccgggggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc        <  2:1741241/95‑1 (MQ=11)
                                                                                                tcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg       <  1:4752546/96‑1 (MQ=11)
                                                                                                cggtcggGTCCGTCGGTTCCTTTGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg       <  2:366152/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg       <  1:4147902/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                ccgttggatcggtggggtccctgggctcggtcgggtccgtaGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg       <  2:3512555/96‑1 (MQ=11)
                                                                                                ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg       >  2:69181/3‑101 (MQ=11)
                                                                                                 cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTGCCGCGGGAccgg      >  2:2778984/5‑101 (MQ=11)
                                                                                                 cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcgg      >  1:2170271/2‑101 (MQ=11)
                                                                                                 cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtccgagccg      >  2:3946207/2‑93 (MQ=11)
                                                                                                  gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGAGGGAtcagt     >  2:4391855/4‑101 (MQ=11)
                                                                                                  gtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgt     <  2:3394505‑M2/101‑9 (MQ=255)
                                                                                                  gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGAtcggg     >  1:722214/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                  gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgag     >  1:4305873/1‑99 (MQ=255)
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                                                                                                     |                                                                                                    
TTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGG  >  NC_014034/221856‑222056

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG