New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_014034 | 2747878 = | 16 (0.070) | 14 (0.060) | 6/192 | 27.9 | 0.13 | intergenic (‑210/+83) | RCAP_rcc02553/RCAP_rcc02554 | hypothetical protein/NmrA family protein |
? | NC_014034 | 2945110 = | 178 (0.750) | intergenic (+87/+357) | RCAP_rcc02755/RCAP_rcc02756 | metallo‑beta‑lactamase/hypothetical protein | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
CAGCCCGCACCACAGAGGGCAGCGCCCGG.CCC.GCGGCCGAGAAGCGCCCGCC.GGCCGGCTGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGCGCCGCCC > NC_014034/2747818‑2747977
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cAGCCCGCACCACAGAGGGCAGCGCCCGG.CCCGGCGGGCGAGAAGCCCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGCGGTCACAGGAc > 1:2035637/1‑101 (MQ=17)
gggCACCGCCCGG.CCCGGCGGGCGAGACGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGc < 2:359905/101‑1 (MQ=17)
gcggcccccggcccc.GCGGCCGAGACGCCGCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCa < 2:503121/95‑1 (MQ=18)
ccgg.cccgGCGGGGGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGAt < 2:2035516/101‑1 (MQ=18)
cgg.cccgGCGGGCGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATg > 1:2063779/1‑101 (MQ=18)
cgg.cccgGCGGGCGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATg > 2:3401351/1‑101 (MQ=18)
gg.cccgGCGGGCGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATgg > 2:975865/1‑101 (MQ=18)
cccggcgGGCGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGcc > 1:1009587/5‑101 (MQ=18)
ccggcgGGCGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCt > 2:3416581/4‑101 (MQ=21)
ccggcgGGCGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAACACGATGGCCt > 2:1058617/4‑101 (MQ=21)
cggcgGGCGAGAAGCGCCCACCGGGCCCGGAGCTACCCGAGGGCCTTTGGGCCCGCGGGGGCCACAGGACCTCGGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCtt > 2:3020093/3‑101 (MQ=21)
gggcGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGcc > 1:2686359/4‑101 (MQ=21)
cGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAg > 1:4282448/1‑101 (MQ=21)
cGAGAAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAg > 1:1438350/1‑101 (MQ=21)
gagaAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAgg > 1:2949674/1‑101 (MQ=21)
agaAGCGCCCGCCGGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGt > 2:2454760/1‑101 (MQ=21)
cccgccgGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCa > 1:1425880/1‑101 (MQ=21)
ccgccgGGCCGGGCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCAt > 2:909916/1‑101 (MQ=21)
ccgggccgggCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGcc > 1:4564666/4‑101 (MQ=255)
cgggccgggCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCa > 1:427054/3‑101 (MQ=255)
ggccgggCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAgc > 1:2822466/1‑101 (MQ=255)
ggccgggCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAgc > 2:1616485/1‑101 (MQ=255)
ggccgggCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAgc > 2:734163/1‑101 (MQ=255)
gccgggCGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAgcg > 1:3570294/1‑101 (MQ=255)
cgggcgctgcCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGcgcc > 2:3804491/6‑101 (MQ=255)
cgggcgctgcCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGcgcc > 2:844284/6‑101 (MQ=255)
cgggcgctgcCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGCCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGcgcc > 2:434736/6‑101 (MQ=255)
gggcgctgcCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGcgccg < 2:1438256/97‑1 (MQ=255)
gcgctgcCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCTAGGCGATGGCCTTGGCCCAGGTCGGCTCATGCCAGCgccgcc > 2:4110666/3‑101 (MQ=255)
cgctgcCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGCGccgccc > 2:1591557/2‑101 (MQ=255)
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CAGCCCGCACCACAGAGGGCAGCGCCCGG.CCC.GCGGCCGAGAAGCGCCCGCC.GGCCGGCTGCTGCCCGAGGGCCTTTGGGCCCTCGGGGGTCACAGGACCTCTGTGACGCATGGCCAAGGCGATGGCCTTGGCCAAGGTCAGCTCATGCCAGCGCCGCCC > NC_014034/2747818‑2747977
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
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