| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,033 | 0 | G→C | 7.5% | 231.8 ‑8.2 ‑0.2 | 1571 | T208T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (34/87): ref base (656/790): total (693/878) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.63e-04 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.31e-01 | ||||||||||
Only 100 of 2072 total aligned reads displayed.
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221933‑222133
|
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 2:3436902‑M1/36‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcgg > 2:1135205‑M1/35‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:1916960‑M1/68‑1 (MQ=255)
tggggttcGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:2789855/94‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:1214167‑M1/33‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:997474‑M1/77‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGatcggtcggg < 1:4175086‑M1/21‑2 (MQ=255)
atccGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcgggt < 1:4530219/98‑3 (MQ=1)
gcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:1126666‑M1/18‑101 (MQ=255)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:2526376/101‑1 (MQ=255)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 2:1537371/101‑1 (MQ=255)
ccgtgggagcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtcc < 1:816182/96‑2 (MQ=11)
ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 2:3254181/1‑101 (MQ=255)
tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:2869155/93‑1 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:2898211‑M1/66‑101 (MQ=255)
tcggATCGGTCGGGTCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:2689733/1‑101 (MQ=255)
gggggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:3562340‑M1/66‑101 (MQ=255)
ggggagctggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtc < 1:3399978/91‑1 (MQ=11)
ggggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:2124564‑M1/65‑101 (MQ=255)
ggggccgtcggggccgggggatcgggcgggtccgtggcatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:4010835/95‑1 (MQ=14)
gatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCcgg > 2:4359681/1‑101 (MQ=11)
gagaggtcgggtcggtgggattcggcgggtgcgtgtgatcGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg < 1:205989/97‑1 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatc > 1:4466897‑M2/1‑98 (MQ=255)
tccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:4309850‑M1/92‑1 (MQ=255)
tggtcgggtccgtgggggccgtcggagccgggggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:2333623/100‑1 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:733626/1‑101 (MQ=11)
ggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGTGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:546670‑M1/94‑1 (MQ=255)
gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:4223082/7‑101 (MQ=11)
tcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 2:2107653/101‑2 (MQ=14)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGACCGCCGGGGTCCGTGCGGtcggtcgagcacgtggg > 2:2542108/1‑91 (MQ=2)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:1725714/1‑101 (MQ=11)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga < 1:2186075‑M2/99‑11 (MQ=255)
tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtc > 1:1051201‑M1/52‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGAGCCGTGGGAtc > 2:2048519/1‑101 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc > 2:4551538‑M2/1‑89 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtg > 2:4650929/1‑100 (MQ=14)
ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:1002194/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGtcg > 2:2171910/1‑101 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 1:3097528/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggcgcggtccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:3505773/101‑1 (MQ=11)
cgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:1416111/98‑1 (MQ=14)
tgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:561544/101‑1 (MQ=14)
tgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:1627702/101‑1 (MQ=17)
ggggataggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:3941337/100‑1 (MQ=14)
ggggtcggtcgggtccgtgggagcgggaggGTCCGTGAGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:192336/101‑1 (MQ=11)
gggattggtcgtgttcgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:4716434/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGCCCGTGGGGtcggggg > 2:3599748/1‑98 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 2:1978896‑M2/1‑72 (MQ=255)
ggatcggccggatccgtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtcgg < 1:1846059/101‑1 (MQ=17)
ggatccgtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:722141/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggttgga < 2:475288‑M2/101‑20 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:3071331‑M2/1‑70 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGgtcgggtccg > 2:3159523/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 1:2594268/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGTGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg > 1:1352460/1‑101 (MQ=14)
ttcggatgcgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt < 2:2325356/100‑1 (MQ=14)
cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg > 1:1999155/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtccgtcgg > 1:3832542/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggga > 2:4157262‑M2/1‑73 (MQ=255)
ttccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:2744520‑M2/2‑72 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggggt < 1:4650731‑M2/101‑30 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggat > 1:4372920‑M2/2‑72 (MQ=255)
gccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc > 2:3878868‑M2/2‑60 (MQ=255)
cggtgggatctgtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 2:174463‑M2/3‑70 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtcc > 1:1180721‑M1/33‑101 (MQ=255)
ccgtgggttcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc < 2:3342887/101‑1 (MQ=11)
gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggggccgtggggtgcgg > 2:917942/1‑100 (MQ=11)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc < 1:331975‑M2/101‑35 (MQ=255)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:4073616‑M2/1‑67 (MQ=255)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtc < 1:3734620‑M2/101‑35 (MQ=255)
ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg > 2:2963085/1‑101 (MQ=11)
ctgttgcaTCGGTCGGATCGTTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:4304411/94‑1 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg < 2:1633465‑M2/101‑43 (MQ=255)
tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:1259275/101‑1 (MQ=14)
gggcgcgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 2:1050979‑M2/6‑56 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg > 2:3990420‑M2/1‑56 (MQ=255)
aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgggggat > 1:2989624/1‑93 (MQ=11)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgaccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg < 1:2426047‑M2/101‑51 (MQ=255)
gtaggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:638656/98‑1 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt < 1:2289522‑M2/101‑52 (MQ=255)
gcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:896513‑M1/12‑101 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg < 2:1447888‑M2/101‑54 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtcc < 2:2630733‑M2/101‑70 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg > 2:3745033/1‑101 (MQ=14)
ggcgggtCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt > 1:4092984‑M2/3‑41 (MQ=255)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggcagtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgg < 2:4440777‑M2/101‑74 (MQ=255)
cggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCTGGtcggtgg > 2:3669513/1‑99 (MQ=14)
ggTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtggga > 2:1294716‑M2/1‑26 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:2461961‑M2/1‑35 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgctcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 1:3483390‑M2/1‑35 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 1:3196817‑M2/1‑34 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTAGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTACGTGGGAtcggtcgcgacag > 2:2386843/1‑95 (MQ=14)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggnatnggt < 1:647375‑M2/101‑70 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:1528476/1‑101 (MQ=255)
gcggctcgggcggATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg < 2:2253517/96‑1 (MQ=14)
cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTgg > 2:1860473/2‑101 (MQ=17)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:4200329/101‑1 (MQ=255)
ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg < 2:795725‑M2/99‑74 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtg > 1:365605/1‑101 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggatccg < 2:1370445‑M2/101‑78 (MQ=255)
|
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221933‑222133
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|