BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,087	C→G	11.3%	T190T (ACG→ACC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,087	0	C→G	11.3%	75.6 0.0 ‑0.2	308	T190T (ACG→ACC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (18/17): ref base (136/137): total (154/154)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.39e-01

Only 100 of 513 total aligned reads displayed.


CCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAC  >  NC_014034/221987‑222187


cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgggtcc                                                                                                      <  2:2630733‑M1/69‑1 (MQ=255)


ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCgtggggtccgtcggggcc                                                                                                      >  2:774839/1‑101 (MQ=11)


ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggccc                                                                                                      >  1:4068714/1‑101 (MQ=11)


  gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                                                                                    >  2:3469792/1‑101 (MQ=14)


  gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTcgggaccgtggggtccgt                                                                                                    >  1:2325489/1‑101 (MQ=11)


   tggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtcggtc                                                                                                   >  2:4116307/1‑100 (MQ=11)


    gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                                                  <  1:2238764/101‑1 (MQ=11)


    cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGTAGGATCGGTCGCGTCCGTCGGGTCCGGgg                                                                                                  >  1:3930411/11‑101 (MQ=11)


     gggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                                                                                 <  2:3009424‑M1/74‑1 (MQ=255)


        tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtc                                                                                              <  2:3522244/101‑1 (MQ=11)


        tccggcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                                                              <  1:1142687/96‑1 (MQ=11)


        ccgtccggATCGGGTGGATCGGCCGGATTCGTGGGGTCGGTCGGATCTGGGGGATAGGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAtc                                                                                              <  2:3353066/96‑1 (MQ=9)


         ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc                                                                                             <  1:2628884/99‑2 (MQ=11)


          ggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgggggccg                                                                                            >  2:2025386/1‑96 (MQ=11)


          cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccg                                                                                            >  2:2267088/2‑99 (MQ=11)


           gtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGgtcggg                                                                                           <  2:2120756‑M1/80‑2 (MQ=255)


           gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggg                                                                                           >  2:4330624/1‑100 (MQ=14)


           gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgg                                                                                           >  1:3697852/1‑98 (MQ=11)


           gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgg                                                                                           >  2:2730970/1‑98 (MQ=11)


            tgggctccgtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                          >  2:626364‑M1/21‑101 (MQ=255)


            tgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGAtgggtc                                                                                          <  1:2175895‑M1/81‑1 (MQ=255)


            tgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGCCCGTGGGAtcggtc                                                                                          <  2:3100572‑M1/81‑1 (MQ=255)


             gggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgggatcgtgcg                                                                                         <  2:1863264‑M1/82‑5 (MQ=255)


             cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                                                         >  1:3312242/1‑99 (MQ=11)


             cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                                                         >  2:683660/1‑99 (MQ=11)


             cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                                                                                         >  1:1449835/1‑99 (MQ=11)


             cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATAGGTCGGAtccgtgg                                                                                         >  1:4344723/1‑99 (MQ=11)


              gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                        >  2:569602/4‑101 (MQ=14)


              ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg                                                                                        >  1:1203830/1‑101 (MQ=11)


               ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcggg                                                                                       >  2:1046563/3‑100 (MQ=14)


               gatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                                                       <  1:3097827‑M1/84‑1 (MQ=255)


               gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgggc                                                                                       >  2:2052796/1‑100 (MQ=11)


                aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      >  1:299378/1‑101 (MQ=11)


                aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      >  2:2598640/1‑101 (MQ=11)


                 tcggtgggatccgtgGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                     >  1:3734863‑M1/16‑101 (MQ=255)


                 tcggtgggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                     >  1:3550023‑M1/16‑101 (MQ=255)


                 tcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                     <  1:1049475‑M1/86‑1 (MQ=255)


                  cggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                    <  1:4200575‑M1/87‑1 (MQ=255)


                   cGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                   <  1:3788163/101‑1 (MQ=14)


                     ttggAGCGGTTGGGTGCGTGGGTTCGGTCGGCTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                 <  1:3501039/99‑1 (MQ=14)


                     tcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                 >  2:3809617‑M1/12‑101 (MQ=255)


                         gtcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCCGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                             <  2:1595083/100‑1 (MQ=14)


                            ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                                                          >  2:3745033/1‑101 (MQ=14)


                             gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt                                                                         >  1:366191/1‑101 (MQ=14)


                              tgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                        <  1:3390565‑M1/99‑1 (MQ=255)


                              tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                                                                        <  1:3614349/101‑1 (MQ=14)


                               gggctCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg                                                                       <  2:2505595/97‑1 (MQ=11)


                                ggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGGCCGCAGAAtcggtccg                                                                      >  2:485224/4‑99 (MQ=17)


                                GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                      <  2:1964477‑M1/101‑1 (MQ=255)


                                   tCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                   <  1:773331/101‑1 (MQ=255)


                                     cGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                 <  2:4285317/101‑1 (MQ=17)


                                     cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTAGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTACGTGGGAtcggtcgcgacag                                                                 >  2:2386843/1‑95 (MQ=14)


                                     cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGGCGGGTCCGTTGGGTCGGTCGGGTCGGTCGGGTCGGGCGGGGCCg                                                                 >  2:3226486/1‑101 (MQ=9)


                                      gtcggATCGGTCGGATGCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTGCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                <  1:2099285/98‑1 (MQ=14)


                                       tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                               >  1:294804/3‑101 (MQ=18)


                                       tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                               >  1:2426455/3‑101 (MQ=17)


                                       gcggATCGGTCGGAGCCGGGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                               <  2:3892230/99‑1 (MQ=17)


                                        gggacgtgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCTTAGGATCGGCCTGGTCAGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                              <  2:1886096/94‑1 (MQ=17)


                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                              >  2:3659022/1‑101 (MQ=255)


                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                              >  2:4635985/1‑101 (MQ=255)


                                        cggttcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                              <  1:2051041/97‑1 (MQ=14)


                                        cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                              >  1:2869331/2‑101 (MQ=17)


                                        cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGCTCGGGCGGCGCCGTgg                                                              >  2:1819438/2‑101 (MQ=14)


                                           aagagtcggGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGc                                                           <  1:4472518/97‑1 (MQ=255)


                                                  gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTggg                                                    >  2:871123/4‑101 (MQ=255)


                                                   ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                                                   >  1:1000596/3‑101 (MQ=255)


                                                   ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                                                   >  2:1226083/3‑101 (MQ=255)


                                                    aTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTggggg                                                  >  2:1297150/1‑99 (MQ=14)


                                                     tCCTTGGGATCCGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc                                                 <  2:4436193/101‑1 (MQ=255)


                                                       cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtagg                                               >  1:4711662/1‑101 (MQ=255)


                                                         tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGGtcggtc                                             >  1:55383/1‑101 (MQ=255)


                                                           ggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcgg                                           >  1:4551279/1‑101 (MQ=255)


                                                             aTCGGTGGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAc                                         <  2:2227678/101‑1 (MQ=255)


                                                                ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc                                      >  1:27091/1‑101 (MQ=255)


                                                                 gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCt                                     >  2:2917159/1‑101 (MQ=255)


                                                                   cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGCCCGCTGt                                   >  2:1412030/1‑101 (MQ=255)


                                                                   cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt                                   >  1:2016305/1‑101 (MQ=255)


                                                                   cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAGCGCTGt                                   >  2:4538872/1‑101 (MQ=255)


                                                                    gggTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTc                                  >  1:1738001/1‑101 (MQ=255)


                                                                        cgggcagATCGGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccg                              <  1:1504602/95‑1 (MQ=25)


                                                                             aagtcggtcggGTCCGGCGGCTCCGTGGGATTGGTCAGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCgccgccgcc                         <  2:4711406/98‑1 (MQ=37)


                                                                               ctcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCgg                       <  2:2332860/100‑1 (MQ=255)


                                                                                tcggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGa                      >  1:1279246/1‑101 (MQ=255)


                                                                                 cggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGAc                     <  1:1904082/101‑1 (MQ=255)


                                                                                 cggtcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGAc                     <  2:3322580/101‑1 (MQ=255)


                                                                                  ggtcggGTCTGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACa                    <  1:1550564/101‑1 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                <  2:4192721/101‑1 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                <  2:3406623/101‑1 (MQ=255)


                                                                                        gtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCa              >  1:3248954/1‑101 (MQ=255)


                                                                                        gtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCa              >  1:274617/1‑101 (MQ=255)


                                                                                         tccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAg             >  2:2792620/1‑101 (MQ=255)


                                                                                           cgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggc           >  1:895764/1‑101 (MQ=255)


                                                                                              cggatccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgg        <  1:994935‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                               gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc       >  2:3989050/1‑101 (MQ=255)


                                                                                               gggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggc       >  2:4100750/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                ggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccggcc      <  2:1146103/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                 gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa     <  1:188202/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                 gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa     <  1:4603089/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                 gtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCa     >  2:1513368/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                   ccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGa   <  2:1103814/101‑1 (MQ=255)


CCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAC  >  NC_014034/221987‑222187

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG