BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,016	Δ1 bp	0.4%	coding (641/2748 nt)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,016	0	G→.	0.4%	7.1 ‑1.3 ‑0.3	1659	coding (641/2748 nt)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (800/852): total (805/854)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.75e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.86e-01

Only 100 of 2049 total aligned reads displayed.


GCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221916‑222116


    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                  <  2:1776766‑M1/65‑1 (MQ=255)


       tcggtcgggtccgtgggatcggtctggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                               >  2:1053442‑M1/34‑101 (MQ=255)


        cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                              >  2:247811‑M1/33‑101 (MQ=255)


         gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                             <  2:3061190/101‑1 (MQ=255)


           tcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                           >  1:491860‑M1/30‑101 (MQ=255)


            cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                          >  2:1885623‑M1/29‑101 (MQ=255)


             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                         >  1:478227‑M1/28‑101 (MQ=255)


               gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                       <  1:538029‑M1/76‑1 (MQ=255)


                tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                      <  1:2448932‑M1/77‑1 (MQ=255)


                 ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                     >  1:2882660‑M1/24‑101 (MQ=255)


                 ccggctgATGCGTCTGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                     <  2:4414395/95‑1 (MQ=11)


                  cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                    >  2:2180937‑M1/23‑101 (MQ=255)


                   gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                   <  2:3407094‑M1/80‑1 (MQ=255)


                    tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                  >  1:4860652‑M1/21‑101 (MQ=255)


                          cggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                            <  1:2609599‑M1/87‑1 (MQ=255)


                               ggagccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                       <  2:4669518/95‑1 (MQ=11)


                                ggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGa                                                                      >  1:2790264/6‑101 (MQ=11)


                                 gtccgggggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                                     <  1:1676950/94‑1 (MQ=11)


                                  tcgggggggtcggtggggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                    <  1:18811/92‑1 (MQ=11)


                                   ccctcggcgcggtcggggcccttggagcggccgggcccctgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                                                                   <  2:836883/92‑2 (MQ=2)


                                    cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                                  >  1:3701608‑M1/5‑96 (MQ=255)


                                      tgggttcgttcgtgtccgtgttatcggtcgggtccgtcgtgCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                <  2:2282174/96‑1 (MQ=11)


                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGGGGGGtcggcg                                                                >  2:3543131/3‑99 (MQ=11)


                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGgggcgcggcg                                                                >  1:2087040/3‑94 (MQ=11)


                                       ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                               >  1:5005436/8‑101 (MQ=14)


                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCNTGGGATCGGCCGGGTCCGCGGGGccggtcg                                                               >  1:626167/2‑101 (MQ=11)


                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                               <  1:2702909‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                        gggtcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                              <  1:3527732/98‑1 (MQ=11)


                                        ggcttgttcgggacggtgggatcgctcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgg                                                              <  2:2952526/94‑1 (MQ=11)


                                        ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                              <  2:3948608/101‑1 (MQ=11)


                                          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGATCGGTGgggg                                                            >  1:40930/1‑100 (MQ=14)


                                          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGGCCGGGGGATCGGGGGGGTCGGGGGGAtcgtgggggc                                                            >  2:3728284/1‑94 (MQ=11)


                                           tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                           >  1:4162409/1‑101 (MQ=11)


                                           tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                           <  2:1240232/101‑1 (MQ=11)


                                            cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                          <  1:759189/101‑1 (MQ=14)


                                            cggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                          <  1:1568020/101‑1 (MQ=11)


                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGGTCGTGGGGTCGGGCGGGAcc                                                          >  2:4320269/1‑101 (MQ=11)


                                            cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATcg                                                          >  1:3771302/1‑100 (MQ=11)


                                            cgctcgggtccgtgagatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                          <  2:4141322/98‑1 (MQ=11)


                                             ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                         >  1:3975612/1‑101 (MQ=11)


                                              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                        >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                              gcgggttccgtggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                        <  1:4712208/95‑1 (MQ=11)


                                               tcggatccgtgggatctgtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                       <  2:4468521/101‑2 (MQ=11)


                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                      <  1:1474486‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCAGGTCCGTGGGGTCCTTCGGACCCGTGGGATCGGCCGGCTccctgg                                                      >  1:4242450/1‑97 (MQ=14)


                                                 gggtccgtgggtgcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                     <  2:2693521/101‑1 (MQ=11)


                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTGGGGTCCGTGgg                                                     >  2:3298188/1‑101 (MQ=11)


                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                     >  1:348084/1‑101 (MQ=11)


                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                     >  1:916030/1‑101 (MQ=11)


                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGACGCGTCTGTGCGCTCGACCGGGCCCGtgga                                                     >  1:1964793/1‑98 (MQ=2)


                                                  gggacgtgggctcggtctggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                    <  2:653232/97‑1 (MQ=11)


                                                   acccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                   <  2:1432790/99‑1 (MQ=11)


                                                    tgcgtgcggtcggtcgggcccgtgggatccgccggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                  <  2:2764922/99‑1 (MQ=11)


                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                  >  1:3083236/1‑101 (MQ=11)


                                                     ccgtgggttcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                 <  2:3477343/101‑1 (MQ=14)


                                                       gtggggtgggtcggacacgtgggatcggtcggCCCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                               <  2:2014376/101‑1 (MQ=11)


                                                       gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                               >  1:1246404‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                               <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                          ggatcggccgggtcggtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                            <  2:2108268/101‑1 (MQ=11)


                                                            gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                          >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)


                                                              cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                        >  2:3176530‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                              cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                        >  1:3399131‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                               ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                       <  1:2356957‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCCCTGGGAtcggtccgcaccgt                                      >  1:985633/1‑93 (MQ=11)


                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                      <  1:2537986‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                 tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                     <  1:2240310‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                  cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                                    <  1:849334‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                   gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                   >  1:4347724/1‑101 (MQ=11)


                                                                       ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg                               <  1:1778199‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                       ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcg                               <  2:1679913‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                        cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                              >  1:673417/1‑101 (MQ=14)


                                                                         gtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggtccgtcggatccgt                             >  2:4568572/1‑101 (MQ=11)


                                                                          tggggtccggcggACCCGTGTGATCGGTAGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTcggatccgtgggatcggtc                            <  2:576010/101‑2 (MQ=11)


                                                                           gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                           >  2:5016845/1‑99 (MQ=11)


                                                                           cggatcggtgggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                           <  1:3196086‑M2/100‑30 (MQ=255)


                                                                            gggttcctgggATCGGCGGGATCCCTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                          <  2:2854840/92‑1 (MQ=17)


                                                                             gagcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                         <  1:3604027/98‑1 (MQ=14)


                                                                              atctgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggt                        <  1:4418923‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                              atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggc                        >  2:4918604/1‑99 (MQ=11)


                                                                               tccgggggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                       <  1:1143651/95‑1 (MQ=14)


                                                                                cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc                      >  2:4756924‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                                ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                      <  2:89956/99‑2 (MQ=11)


                                                                                  gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtacgg                    <  2:1136382‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                                   tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtg                   >  2:484697/1‑100 (MQ=14)


                                                                                    cggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtgg                  <  2:3803088/101‑3 (MQ=11)


                                                                                    cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                  <  1:3300812/101‑3 (MQ=11)


                                                                                      ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggacggg                >  2:1334814/3‑100 (MQ=14)


                                                                                      ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                >  2:365174/3‑100 (MQ=14)


                                                                                       gtcCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat               <  1:2157469‑M2/100‑42 (MQ=255)


                                                                                           gTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggc           <  1:3869769‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                             cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCAGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg         >  2:2586806/2‑101 (MQ=18)


                                                                                             aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg         >  1:2982025/2‑99 (MQ=14)


                                                                                              ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg        <  2:4033623‑M2/101‑49 (MQ=255)


                                                                                               gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggcggg       >  2:1554230/1‑96 (MQ=17)


                                                                                                agcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt      <  1:1328518/99‑1 (MQ=17)


                                                                                                 tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGCCCTGGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     >  2:421017/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                  cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc    <  1:4600946‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                                                                  cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc    <  1:4473983‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                                                                   ggtcggGTCCGTGGGATCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg   <  1:1406813‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                                    gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcggt  >  2:2387860/1‑101 (MQ=14)


GCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221916‑222116

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG