| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,003,050 | +G | 2.3% | coding (356/738 nt) | pssA → | CDP‑diacylglycerol‑‑serine O‑phosphatidyltransferase |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,003,050 | 1 | .→G | 2.3% | 4.8 ‑3.6 ‑0.1 | 171 | coding (356/738 nt) | pssA | CDP‑diacylglycerol‑‑serine O‑phosphatidyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/0): ref base (66/101): total (70/101) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.67e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.86e-01 | ||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GTCGCGCCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCGCTGCTGCCGGTC > NC_014034/1002950‑1003150
|
gTCGCGCCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCt < 1:4782333/101‑1 (MQ=255)
tCGCGCCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.g < 1:3052094/101‑1 (MQ=255)
acgcgCCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.g < 1:3983740/100‑1 (MQ=255)
gcgcCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.ggg > 1:631501/1‑100 (MQ=255)
gcCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGccc < 1:1620098/101‑1 (MQ=255)
gcCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGccc < 2:1284486/101‑1 (MQ=255)
gcCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGccc < 2:4237483/101‑1 (MQ=255)
cccGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.ggggcg > 2:3258314/1‑97 (MQ=255)
cccGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCg < 2:3952478/101‑1 (MQ=255)
cGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGGGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.gggcgggg > 1:2033871/1‑95 (MQ=255)
cGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.ggggcggg > 1:440173/1‑95 (MQ=255)
ggggTTCTTGGCTATCCCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGtt < 2:3573645/101‑1 (MQ=255)
ggggTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.ggggcgggg > 2:1968954/1‑94 (MQ=255)
ggggTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.ggggcgggg > 1:3803638/1‑94 (MQ=255)
gggTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.ggggcggggc > 2:2996425/1‑93 (MQ=255)
gggTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCGCgggtg > 1:166995/1‑98 (MQ=255)
ggTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCa < 1:3087146/101‑1 (MQ=255)
tCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.g < 1:4832898/101‑1 (MQ=255)
cGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCCGGGCAA.CCT.Ga > 2:1953172/1‑101 (MQ=255)
cGTCTATCGCTTCGCGAGGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.Ga < 1:3532290/101‑1 (MQ=255)
gTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCTGGGCCCgggtaacagggc > 1:569393/1‑91 (MQ=255)
gTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCaaaggggc > 1:1031662/1‑95 (MQ=255)
gTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GAc < 2:254823/101‑1 (MQ=255)
gTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GAc < 1:1107540/101‑1 (MQ=255)
tCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GAcc < 2:3619670/101‑1 (MQ=255)
aTCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCTGGGCCGGGTTCAC.CG..GACCCgg > 2:4688322/1‑101 (MQ=255)
aTCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCgg < 1:1998727/101‑1 (MQ=255)
tCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGAGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCggg < 2:4729763/101‑1 (MQ=255)
cGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGGCGGGTCGA.CGT.GGcccccgg > 2:1313708/1‑97 (MQ=255)
gCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGc < 2:4466066/101‑1 (MQ=255)
gCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGc < 1:3828894/101‑1 (MQ=255)
cTTCGCGATGGGCGATGGGAATGCGCTGGGCTTGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GTCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCg < 2:1279417/101‑1 (MQ=255)
tCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCgag < 2:1386124/101‑1 (MQ=255)
cgcgATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCgagg < 1:1965180/101‑1 (MQ=255)
cgATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCgaggag < 2:2398844/101‑1 (MQ=255)
gATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGGCGGGTCGA.CGG.GGCCCCGGGGGgggagg > 2:4013504/1‑101 (MQ=255)
aTGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAggg < 1:3212479/101‑1 (MQ=255)
gggCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTTGA.AGT.GGCCCGGGGGGGGGGggggg > 1:3553278/1‑99 (MQ=255)
ggCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGgcgc < 2:1988237/101‑1 (MQ=255)
gCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGcgcg < 2:3679744/101‑1 (MQ=255)
aGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGc < 2:1689212/101‑1 (MQ=255)
aGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGc < 2:3522269/101‑1 (MQ=255)
gggAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCaa < 1:3696640/101‑1 (MQ=255)
ggAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAg < 1:3920293/101‑1 (MQ=255)
gAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGGCAACCGG.GCCCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCaga > 1:149509/1‑99 (MQ=255)
gAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGa < 2:1870782/101‑1 (MQ=255)
aaTGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CCG.GACCCCGGGCGGGGAGGGGGGgggggaggc > 1:4868152/1‑95 (MQ=255)
tGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGCCAAGAccc < 1:1528685/101‑1 (MQ=255)
nnnnnnnggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGAccc < 1:2522522/94‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCCA.CGT.GGCCCCGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGAGAcccc > 1:3513431/1‑100 (MQ=255)
gcgcTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGGCAA.CGC.GAGCCCGGGCGCGGGGGGGGCgggggacagcca > 2:1593364/1‑92 (MQ=255)
cgcTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCAt < 2:2191605/101‑1 (MQ=255)
gctgggctggGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCAtt < 1:2698419/101‑1 (MQ=255)
ctgggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCCA.CGG.GACCCCGGGCGCGGGGGGCGCGGGGAAGAccccatt > 2:2014676/1‑97 (MQ=255)
ctgggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCAttt < 2:4781556/101‑1 (MQ=255)
tgggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CCT.GACCCCGGGGGGGGGGGGGGCGGGGAAGAccccattc > 2:3963943/1‑96 (MQ=255)
gggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTTAA.CGTGGACCCGGGG.GGGGGGGGGGGGGGGGAGACCCCtttta > 1:4604226/1‑99 (MQ=255)
gggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCGA.AGA.GAGACCGGGCGGGGGGGGCGGGGGGGAGGCCCCttttt > 1:1581053/1‑99 (MQ=255)
gggctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCCA.CCC.GGCCCCGGGGGGGGGGGGGGCGGGCAAGAACCCTTTcc > 1:1207949/1‑100 (MQ=255)
ctgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTTCA.CGC.GGCCCGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGAAGACACAATTCTccc > 2:486993/1‑100 (MQ=255)
tgggTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GACCCCGGGGGAGGGGGGGGCGGGGGAGAACCCCTTCAcccg > 2:4439188/1‑99 (MQ=255)
ttttCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.Gtt < 2:3368935/101‑1 (MQ=255)
tttCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGGTCAA.CGT.GACCCCGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCAAACCCATTTTACCCGC.GGTc > 2:1849343/1‑101 (MQ=255)
ttCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTcc < 1:4978727/101‑1 (MQ=255)
tCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCg < 2:4534952/101‑1 (MQ=255)
tCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCCGGTCAA.CGT.GACCCCGGGGGGGGAGGGCGCGGGGCAGAACCATTTTACCGGC.GGTCCg > 2:2159487/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGGGGGGGCGGGCGAGACCCATTTCACCCGC.GTCCCgg > 1:2379997/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GACCCCGGGCGGGGGGGGGGCGGGCAAGACCCATTTCACCCGC.GTTCCgg > 1:3291810/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.AGT.GACCCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAAGAACCCCTTTACCCGC.GCTCCgg > 1:1414567/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCCGGTCAA.CGT.GACCCCGGGCGGGGAGGGGGCGGGGAAGACCCACTTCACCGGC.GTTcccg > 2:4292339/1‑99 (MQ=255)
tGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCTGGGCCGGGTTAAA.CG..GGCCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCAGACCCATTTCTCCCGC.GTTCTGGcc > 1:740653/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGGCGGGTCCA.CGT.GACCCCGGGCGAGGGGGGGGGGGGGGAGACCCCTTTTCCCCGC.GGTCCGGcc > 1:786160/1‑100 (MQ=255)
tGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCCGCTTAA.AGG.GACCCGCGGGGAGGGGGGGGCGGGGGAGACCCCATTTACCCGC.GGTCCGGCa > 2:3773116/1‑101 (MQ=255)
cTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GGCCCCGGGGGGGGAGGGGGCGGGGCAGACCCCTTTCACCCGC.GCTCCCGGAcc > 2:1418430/1‑101 (MQ=255)
cTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCAcc < 2:217735/101‑1 (MQ=255)
gATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCCA.CGT.GACCCGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGAAGACCCCTTTCACCGGC.GTTCCTGCAcccg > 2:335661/1‑99 (MQ=255)
gATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GACCCCGGGCGGGGGGGGCGCGGGGAAAACCCATTTCCCCCGC.GCTCCGGCAcccg > 2:577520/1‑99 (MQ=255)
gATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACcgg < 2:688946/101‑1 (MQ=255)
gATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCCGGTCCA.CCC.GGCCCGGGGCGGGGGGGGCGGGGGGGAGGGCCCTTTTACCGGC.GGTCCCGCACcgg > 2:2460331/1‑101 (MQ=255)
aTCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACcggc < 1:1953309/101‑1 (MQ=255)
tATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTTAA.CCT.GACCCCGGGCGAGGGGGGGGCGGGGAAGACCCATTTCACCCGG.GTTCCGGGAACGGCggg > 1:1078901/1‑101 (MQ=255)
tATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GACCCGGGGCGGGGGGGGGGCGGGGAAGACCCATTTTACCGGC.GTTCCCGCACCCGCggg > 2:4982066/1‑101 (MQ=255)
tATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCAA.CGT.GACCCCGGGGGGGGGGGGGGCGGGGAAGAACCCCTTCACCCGC.GGTCCGGCCCCGGGggg > 1:4278652/1‑101 (MQ=255)
aTGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCGGGTCTA.CGT.GACCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGACCCACTTTTCCGGCGGTCCCGGCA.CGGCgggg > 2:332297/1‑101 (MQ=255)
aTGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGGCCCGGTCAA.CGT.GACCCCGGGGGGGGGGGGCGGGGGGAAGACCCATTTCACCCGG.GTTTCGGCACCCGCgggg > 2:1054841/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGc < 2:4900156/101‑1 (MQ=255)
gccTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGAt < 2:2677693/101‑1 (MQ=255)
gccTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGAt < 1:4938293/101‑1 (MQ=255)
ccTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGAtt < 2:1235023/101‑1 (MQ=255)
ccTCGGCCTGTCTGCGGCT.GATCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGAGGGCAAGACCCATTGCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCAAtt < 2:1536579/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTc < 1:647065/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGGTCAA.CGT.GAGCCGGGGGGGGGGGGGGGCGGGGAAGACCCATTTTACCCGC.GTTCCGGCACCGGCgggggggggtc > 1:4750992/1‑95 (MQ=255)
cTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGgcgc < 1:1969098/101‑1 (MQ=255)
gTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCgctg < 1:3264928/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCgctgc < 1:4806315/101‑1 (MQ=255)
cTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCCCCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCgctgct < 2:1350720/101‑1 (MQ=255)
cGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGGAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCCGCACCGGCGGGGGGGGTTCTGGGGCGGCTGcc > 2:3920171/1‑101 (MQ=255)
gCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCGCTGCTGCCgg < 1:1806580/101‑1 (MQ=255)
cT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCGCTGCTGCCGGt < 1:4439507/101‑1 (MQ=255)
t.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCGCTGCTGCCgggc > 1:94378/1‑99 (MQ=255)
|
GTCGCGCCCGGGGTGCTCGTCTATCGCTTCGCGATGGGCGAGGGGAATGCGCTGGGCTGGGTTTTCGTGCTGATCTATGCCGCCTCGGCCTGTCTGCGGCT.GGCCCGGTTCAA.CGT.GACCCGGGGCGAGGAGGGCGCGGGCAAGACCCATTTCACCGGC.GTTCCGGCACCGGCGGGGGCGATTCTGGCGCTGCTGCCGGTC > NC_014034/1002950‑1003150
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|