Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 97.4 | 195 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (116/48): ref base (1/30): total (117/78) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.25e-13 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.50e-02 |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGC > NC_014034/1823640‑1823832
|
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.Ca.a > 2:2317496/1‑101 (MQ=255)
ctATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.Ca.a > 2:180795/1‑101 (MQ=255)
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c > 1:2235213/1‑101 (MQ=255)
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c < 1:2601023/101‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c.c > 2:3752098/1‑101 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c.c < 1:2049986/101‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c.c > 1:613256/1‑101 (MQ=255)
ggAGCAAGCGGTTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGAGATCAAGCTGTTAAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c.c.ccg < 2:1175631/100‑3 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.c.c.ccg < 1:1791098/101‑3 (MQ=255)
cAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTg > 1:2931763/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTgcc > 1:806045/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTgcc < 1:3086021/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTgccg > 2:4393073/1‑101 (MQ=255)
gggTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTgccgcc > 1:4116021/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCgg > 1:2562271/1‑101 (MQ=255)
gTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCgg > 1:1368764/1‑101 (MQ=255)
tGGGCGGGGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGt < 1:503059/101‑1 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGtt > 2:5000880/1‑101 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTc < 2:1557561/101‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGTGGGGGG.GA.A.CGC.C..CACTGTCGCCGGCTCg > 2:2526581/1‑101 (MQ=255)
gcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCg > 2:2112708/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.GA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg > 1:2056435/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCgg > 1:2918922/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGGCGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt < 1:4334880/101‑1 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCggc > 2:3455428/1‑100 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt < 2:3291093/101‑1 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 1:2866568/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 1:371334/1‑101 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGGTCGCCGGt > 2:4929182/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgg > 1:4964522/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGATGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgg > 2:4733802/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcggg < 2:1931632/101‑1 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGGTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggc > 2:1081827/1‑101 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggc > 2:559409/1‑101 (MQ=255)
cGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcggg < 2:3649254/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:890017/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc < 1:2262724/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc < 1:4470074/101‑1 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCAGGTCgggcgggc > 1:1995259/1‑101 (MQ=255)
tttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc > 2:3049646/1‑101 (MQ=255)
ttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgggcggggggg > 1:3547548/1‑97 (MQ=255)
tCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgg > 1:1690779/1‑101 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt < 1:1503425/101‑1 (MQ=255)
gcgAGCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc < 2:4194507/101‑1 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc > 2:796915/1‑101 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg > 2:771587/1‑101 (MQ=255)
tCAAGCTGTTGAAGTTTGCAGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGc > 2:2059361/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc > 1:2374234/1‑101 (MQ=255)
cAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGcc < 2:4916250/101‑1 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:11251/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCg > 1:1604384/1‑101 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt > 2:1435549/1‑101 (MQ=255)
cttttaaggTTTGCCGCCTGGAAAGGGGGGGAGAGGGGGCGGGGGA.CA.C.C.C.CG.GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg < 1:969987/93‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg > 2:2888885/1‑101 (MQ=255)
gtggAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc < 1:3838869/98‑1 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:3686750/1‑101 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:3434985/1‑101 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt < 2:4338884/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa > 2:2435044/1‑101 (MQ=255)
tGAAGTTGGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:4425176/101‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg > 1:3191055/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 2:1896636/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAGCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc < 1:3621/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCCAGCTGctc > 2:131830/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc > 2:1512962/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 1:4737086/101‑1 (MQ=255)
ccgccTCGGATCGGGGGGGGAAGGGGCGGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc < 2:1582828/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAGCGGGCGGGGAAGGGGGCGGGGG.CACC.C.C.C..GTCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 1:4398053/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc > 2:3148132/1‑101 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc > 1:1250230/1‑101 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 1:3049884/101‑1 (MQ=255)
cccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 1:180811/100‑1 (MQ=255)
cTCGTAACGGGGGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 1:532894/101‑1 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CAGC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 1:1637018/101‑1 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc < 1:4536011/101‑1 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc > 1:1038404/1‑101 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc > 2:1395494/1‑101 (MQ=255)
gTAAGGGGCGGTGAAGGGGCGGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 1:1815506/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc > 1:274819/1‑101 (MQ=255)
gTAACGGGCGGGGAAGGGGCCGGGGG.TA.C.C.CGC..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 1:1658270/101‑1 (MQ=255)
tAACGGGGGGGGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg < 2:4151137/101‑1 (MQ=255)
tAACGGGCGGTGAGGGGGCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccg < 1:4283394/101‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtccca > 2:2076961/1‑99 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 2:4852748/1‑101 (MQ=255)
aCGGGCGGGGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAg < 1:4870565/101‑1 (MQ=255)
gggCGGTGAGGGGCCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 2:3508102/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTgg < 1:247952/101‑1 (MQ=255)
ggCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCCAGTgc > 2:168779/1‑100 (MQ=255)
gCGGTGAGGGGGCGGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGc < 1:3482117/101‑1 (MQ=255)
ggTGAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCgg < 1:771689/101‑1 (MQ=255)
ggaGGGGCGGGGGGCCC.C.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGc < 2:929802/99‑1 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGGGc > 1:4200270/1‑101 (MQ=255)
gAAGGGGCCGGGGG.CA.A.CAC.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGGGGCGGGGc > 2:246834/1‑101 (MQ=255)
ggggCGGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggg < 1:1553010/101‑1 (MQ=255)
gggCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgggg > 2:4103933/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGGGG.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGt > 2:3607390/1‑101 (MQ=255)
cGGGGG.CC.A.C.C.CCGGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 1:1896773/101‑1 (MQ=255)
cGGGGG.CACC.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 2:2886997/101‑1 (MQ=255)
ggggg.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGGCTgc > 1:39049/1‑101 (MQ=255)
ggggg.CA.ACC.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGCGGCGGTGCGGGGTCTgc > 2:4486910/1‑101 (MQ=255)
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CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGG.CA.A.C.C.C..GGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGC > NC_014034/1823640‑1823832
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
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