Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,948,851 | +G | 89.3% | coding (1069/2472 nt) | quiP ← | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,948,851 | 1 | .→G | 89.3% | 68.6 ‑0.2 ‑0.9 | 215 | coding (1069/2472 nt) | quiP | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (90/102): ref base (10/13): total (100/115) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.27e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.27e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.CCC.ACCCTCGGGGCTGCGGTA.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
|
tGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.c < 2:2698683/101‑1 (MQ=255)
gATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.g > 2:1698814/1‑101 (MQ=255)
aTCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.gg > 1:278981/1‑100 (MQ=255)
aTCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.gg < 2:3450705/101‑2 (MQ=255)
ccGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcc < 1:3691325/101‑1 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gccca > 1:2473669/1‑99 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gccca < 2:1286208/101‑3 (MQ=255)
cGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcccaac > 1:1379456/1‑97 (MQ=255)
cGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcccaac > 1:1263323/1‑97 (MQ=255)
cGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcccaac < 2:4611780/101‑5 (MQ=255)
cGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcccaac < 1:4212856/101‑5 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcccaaccctc < 1:1745913/101‑9 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.gcccaaccctc < 1:2097028/101‑9 (MQ=255)
gcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCg < 1:3234804/101‑1 (MQ=255)
caCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCgg > 1:891698/1‑101 (MQ=255)
cGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGc < 2:3720718/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCt < 2:4222475/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCt < 2:2473495/101‑1 (MQ=255)
gCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGc < 1:4009027/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGt > 1:329772/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTa > 2:3307512/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTa < 1:4426304/101‑1 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTa < 2:1582993/101‑1 (MQ=255)
cGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagcgc < 2:2237847/101‑5 (MQ=255)
cGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTagcgc > 1:308470/1‑97 (MQ=255)
gTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTc > 2:2610776/1‑101 (MQ=255)
tCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCg < 2:652102/101‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCg > 2:4149575/1‑101 (MQ=255)
gccAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCg < 1:1000489/100‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCgg < 1:3263826/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCggg > 2:2957573/1‑101 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGc < 2:4286157/101‑1 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGc > 1:127913/1‑101 (MQ=255)
cgcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGt > 1:2880278/1‑101 (MQ=255)
gcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtt > 2:1105185/1‑101 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCAGGTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGttt < 2:2654663/101‑1 (MQ=255)
cAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGttt > 1:705431/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATTACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCTTCGGGGATGCGGTAGCGCTCGGGCGtatt > 2:833165/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt > 2:1751501/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt > 2:1982592/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGtttt < 1:979383/101‑1 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTc < 1:1560129/101‑1 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTc < 2:2790958/101‑1 (MQ=255)
gtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCgg < 1:3876489/101‑1 (MQ=255)
gtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCgg < 1:1968355/101‑1 (MQ=255)
gagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGAt < 2:3356562/101‑1 (MQ=255)
gagggggaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGGGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGTGTTTTCgggt > 1:2498736/1‑99 (MQ=255)
agggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATc > 1:2377867/1‑101 (MQ=255)
agggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATc > 2:1813348/1‑101 (MQ=255)
ggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCaa > 2:505754/1‑101 (MQ=255)
gtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAg > 1:1448359/1‑101 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt > 2:4591143/1‑101 (MQ=255)
aTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTc < 1:2957801/101‑1 (MQ=255)
tCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTcc < 2:4688081/101‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCt > 1:1352613/1‑101 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:2219586/101‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:2706783/101‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 2:2757845/101‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:499114/101‑1 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc > 1:3896134/1‑101 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:103039/101‑1 (MQ=255)
gcgcGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcg < 2:3674145/101‑1 (MQ=255)
tctggCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcga < 2:754933/98‑1 (MQ=255)
gcgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgac < 2:1641021/101‑1 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa < 2:4395037/101‑1 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGGAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGGCGaa > 2:1541023/1‑101 (MQ=255)
cATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAAc < 2:4198177/101‑1 (MQ=255)
cATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAAc > 2:4911078/1‑101 (MQ=255)
cATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAAc < 2:2498562/101‑1 (MQ=255)
aTCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACa > 1:4692071/1‑101 (MQ=255)
ttGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTc < 2:1506000/101‑1 (MQ=255)
ttGACCGTGACGATCAACTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCTGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTc < 1:833267/101‑1 (MQ=255)
gACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt > 1:3562746/1‑101 (MQ=255)
cGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACG.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGt < 1:2453773/101‑1 (MQ=255)
gTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTc > 1:3422434/1‑101 (MQ=255)
gTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTc < 1:3371045/101‑1 (MQ=255)
gTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTc < 1:2537965/101‑1 (MQ=255)
tGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa > 1:514493/1‑101 (MQ=255)
tGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa < 1:1698944/101‑1 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt < 1:1043209/101‑1 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt > 1:4901669/1‑101 (MQ=255)
cGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCg < 1:1484395/101‑1 (MQ=255)
cGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCg > 2:2760901/1‑101 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg > 1:3910217/1‑101 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg > 2:3881861/1‑101 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg > 2:2900795/1‑101 (MQ=255)
aTCACCTTGCGGGTGGTGAACG.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGc < 2:5012769/101‑1 (MQ=255)
cACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGa < 2:1348687/101‑1 (MQ=255)
cACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGa > 2:2419746/1‑101 (MQ=255)
cACCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGa < 1:4941749/101‑1 (MQ=255)
aCCTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGaa < 1:1114256/101‑1 (MQ=255)
cTTGCGGGTGGTGAACTAG.G.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGAGAAgg > 1:3596204/1‑101 (MQ=255)
cTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAgg > 1:3018969/1‑101 (MQ=255)
cTTGCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAgg < 1:744126/101‑1 (MQ=255)
gCGGGTGGTGAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcgg < 1:1637999/101‑1 (MQ=255)
tggtgAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTg > 2:1782651/1‑101 (MQ=255)
ggtgAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGa < 2:3197622/101‑1 (MQ=255)
tgAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATg < 2:3334054/101‑1 (MQ=255)
tgAACT.C.GTCCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATg < 1:483249/101‑1 (MQ=255)
gAACT.CGG.CCCAACCCTCGGGGCTGCGGTAGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGc < 2:2947884/101‑1 (MQ=255)
|
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACT.C.G.CCC.ACCCTCGGGGCTGCGGTA.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|