| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 901,415 | +G | 2.2% | coding (458/1170 nt) | ftsW → | cell division protein FtsW |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 901,415 | 1 | .→G | 2.2% | 4.6 ‑3.7 ‑0.0 | 180 | coding (458/1170 nt) | ftsW | cell division protein FtsW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/0): ref base (69/107): total (73/107) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.57e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.80e-01 | ||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
TGGATCTCGCTCGGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCCTCTTT > NC_014034/901315‑901515
|
ggATCTCGCTCGGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.g > 2:1705000/1‑101 (MQ=255)
ggATCTCGCTCGGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGGGGC.g > 1:576529/1‑101 (MQ=255)
ctcgctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.c < 1:3564529/101‑1 (MQ=255)
ctcgctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.c < 1:1638782/101‑1 (MQ=255)
tcgctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.cc < 2:1524703/101‑1 (MQ=255)
tcgctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.cc < 2:2169486/101‑1 (MQ=255)
tcgctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.cc < 2:4405756/101‑1 (MQ=255)
gctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.gggggcgc > 2:3456328/1‑96 (MQ=255)
gctcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgg.cccc > 1:704222/1‑99 (MQ=255)
ctcgGCTTCGCCTCTTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.ccg.cc < 2:4755540/101‑1 (MQ=255)
tcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.ccg.ccc < 2:1258137/101‑1 (MQ=255)
tcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.ccg.ccc < 1:935425/101‑1 (MQ=255)
tcgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.ccg.ccc < 1:3306884/101‑1 (MQ=255)
gatctttCGCCTCGTTCCAGCCTACGTAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.ccg.ccc < 2:4719772/96‑1 (MQ=255)
cgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgg.ccc.cccc > 1:1313790/1‑100 (MQ=255)
cgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgg.ccc.cccc > 2:2013462/1‑100 (MQ=255)
cgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgg.ccc.cccc > 1:4038751/1‑100 (MQ=255)
cgGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGgc.ccg.cccc > 2:2442951/1‑100 (MQ=255)
ggCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.gg < 1:3646025/101‑1 (MQ=255)
ttCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.Cggc.g > 2:856553/1‑101 (MQ=255)
tCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCC.ACC.Cggc.gg > 1:2016249/1‑101 (MQ=255)
cGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCC.Cggg.ggg > 2:3019142/1‑100 (MQ=255)
cTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCttt < 1:1648377/101‑1 (MQ=255)
gTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.Cggc.gggcttttt > 1:3148253/1‑94 (MQ=255)
gTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCC.CCC.AGGG.GGCGTTTtt > 2:1371195/1‑101 (MQ=255)
gTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGCGGC.GGGCGCCC.CCC.GGGG.GGCtttgt > 1:1190609/1‑99 (MQ=255)
ttCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTc < 1:1095554/101‑1 (MQ=255)
ccAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCC.CCC.Cggc.ggggctttttct > 2:3781871/1‑91 (MQ=255)
cAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCtt < 2:1928103/101‑1 (MQ=255)
cAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCtt < 2:240313/101‑1 (MQ=255)
aGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGCGGGGC.CCC.CCC.GGGG.GGGTTTTTTCTtt > 1:1031029/1‑101 (MQ=255)
ccTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.CGGC.GGCCTTTTTTCttttt > 1:2382896/1‑98 (MQ=255)
ccTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCAt < 2:3428170/101‑1 (MQ=255)
cTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATc < 1:329438/101‑1 (MQ=255)
tcgtatttCCTCATGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCTCCTCGCTTGAAGTTGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCt < 2:1622843/95‑1 (MQ=255)
tCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.CGGC.GGGTTTATTctcttctccc > 2:4078775/1‑92 (MQ=255)
tCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCt < 2:1428718/101‑1 (MQ=255)
tCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCt < 2:1510359/101‑1 (MQ=255)
cGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCCGGGGG.GGCTTTTTTCTTTCTTctc > 1:4887768/1‑99 (MQ=255)
ggAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGCGGGGC.CCC.CCC.GGGG.GGGTTT.TTCCtttctccccc > 2:3543502/1‑93 (MQ=255)
ggAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCGCCCC.GGGG.GGCTTTTTTCTttttcctca > 2:3741802/1‑94 (MQ=255)
ggAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCa < 2:3272473/101‑1 (MQ=255)
ggAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.GCC.CGGC.GGCGTTTTTCCttttttcctc > 2:4126521/1‑93 (MQ=255)
gAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGC.GGCCTTTTTTCTTTATcccccc > 1:4895430/1‑97 (MQ=255)
aaTTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.GGGC.GGGGTTATTTCtttcccctcccc > 1:2893552/1‑91 (MQ=255)
aaTTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.CGGG.GGGGTTTTTTCTTCCTTCTCAcc > 2:1784603/1‑101 (MQ=255)
aaGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGAt < 1:1265883/101‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGCGGGGC.CCC.CCC.GGCG.GGCTTTTTTCTTTC.TCCTCCCCCCCCTGGtc > 2:3685773/1‑101 (MQ=255)
aGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGAtc < 1:856655/101‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGAtc < 1:68002/101‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGAtc < 2:3914020/101‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGAtc < 2:1790261/101‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCC.GGGG.GGCGTTTTTTCTTCCTTCCCACCccgccggtc > 2:4990242/1‑96 (MQ=255)
cccGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGAtcgt < 2:189586/101‑1 (MQ=255)
ccGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGG.GGCGTTTTTTCTTTATCCTCCCCCCCCCGAtcggc > 1:1048963/1‑99 (MQ=255)
ccGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGCGGGCTTTTTCTCTTC.TCCTCACCCCGCTGAtcggc > 2:1192274/1‑99 (MQ=255)
gCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.CGGG.GGGGTTTTTTCTTTTTCCTCCCCCCGCCGCTCgtcgtc > 2:1059892/1‑101 (MQ=255)
cTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCa < 1:3456593/101‑1 (MQ=255)
ttCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.CGGC.GGCGTTTTTCCTTCCTCCTCCCCCCCCCGGTCGTCGTCAc > 2:4516704/1‑101 (MQ=255)
tCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCAcc < 1:1905205/101‑1 (MQ=255)
cGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCAccc < 2:3652637/101‑1 (MQ=255)
gTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCGCCCC.GGGG.GGCTTT.TTTCTTCATTCCCACCCCCCCCATCGTCGCCAcccc > 1:2142890/1‑100 (MQ=255)
gTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCATCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCt < 1:4473531/101‑1 (MQ=255)
cATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCGCCCC.GGGG.GGCTTT.TTCCTTCATCCCCACCCCGCCGATCGCCGGCCCCCCgg > 2:2731632/1‑101 (MQ=255)
cATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCG.CCC.CGGC.GGGTTTTTTTCTTCCTCCTCACCCCGCTGATCGTCGTCAcccccg > 2:4227888/1‑98 (MQ=255)
cATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCC.CCC.GCGG.CGCTTTATTCCCTTATCCTCACCCCGCGCGTCGTCGTCACCCTgg > 2:3031233/1‑101 (MQ=255)
cATCGTCTCGGCCTGGGTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGG.CCC.CCC.CGGC.GGCTTTTTTTCTTCATCCTCACCCCCCCGGTCGTCGCCCCCCCgg > 1:4413133/1‑101 (MQ=255)
aTCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGc < 2:2843534/101‑1 (MQ=255)
tCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCa < 2:704133/101‑1 (MQ=255)
tCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCa < 1:972821/101‑1 (MQ=255)
cGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCAc < 1:2598188/101‑1 (MQ=255)
cGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGC.GGCGTTATTTCTTCAACCCCACCCCCCTCCTCCTCGTCCCCCTGGCAc > 1:1800853/1‑101 (MQ=255)
cGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCC.CGGC.GGCTTTATTTCTTCATCCTCCCCCCCCCGATCGTCGTCACCCCGGCAc > 1:3343862/1‑101 (MQ=255)
tctcGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTg < 2:4558851/101‑1 (MQ=255)
tctcGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGC.GGCGTTTTTTCTTCATCCTCCCCCCGCTGATCGTCGGCACCCCGGCCCTg > 1:46356/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGGGTTTTTTCTTTTTCCTCACCCCGCTGATCGTTGTCCCCCCCGCAcccccg > 1:746502/1‑96 (MQ=255)
ggCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGC.GGGGTTATTCCTTCATCCTCCCCCCGCTGCTCGTCGTCACCCTGGCACTGCacc > 2:2529736/1‑99 (MQ=255)
ccTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCC.GGGC.GGCTTTTTTTCTTCATTCTCCCCGCGCTGGTCGGGGTGCCCCCGGCACTCCAGccc > 1:2690290/1‑101 (MQ=255)
ggTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGAc < 1:4397951/101‑1 (MQ=255)
ggTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.CGGC.GGGTTTTTTTCTTTATCCTCACCCCGCCGATCGTCGTCACCCCGGCCCTGCAGCCCgcc > 1:2547090/1‑99 (MQ=255)
gTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACt < 1:3661938/101‑1 (MQ=255)
tCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTc < 1:3782156/101‑1 (MQ=255)
tCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTc < 1:2246474/101‑1 (MQ=255)
aTGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCC.GGGC.GGCTTTTTTTCTTTATCCTCACCCCGCCGATCGTCGTCACCCCGGCACTGCAGCCCCACTTccg > 1:4921952/1‑99 (MQ=255)
ccgccgCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAg < 2:573936/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAg < 1:3608102/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTTTTTCTTCATCCTCCCCCCGCTGATCGTCGGCCCCCCGGGCCTGCCGCCCGCCTTCGGCCCGGc > 2:668597/1‑101 (MQ=255)
ccgcGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCTGGcc < 2:4275632/101‑1 (MQ=255)
ccgcGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCC.CCC.CCGC.GGCTTTGTTCCTTTCTTCTTCCCGCGCTGGTCCGCGTGACCATCGCCCTGCAATCCGACCTTGGccccgcc > 1:475234/1‑96 (MQ=255)
cgcgCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCt < 2:2313264/101‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTc < 1:1742179/101‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTc < 2:4891802/101‑1 (MQ=255)
cgcTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGGTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCg > 2:4203664/1‑101 (MQ=255)
tGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCCCCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTg < 1:1435842/101‑1 (MQ=255)
aaGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATc < 1:4517024/101‑1 (MQ=255)
tGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCctc < 1:3273258/101‑1 (MQ=255)
ggC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATGCTCGGCGCGCTGATCGTCGTCCCCCTGGCACTGCGGCCCGAGTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCctct < 2:5017961/101‑1 (MQ=255)
ggC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCctct > 1:1524802/1‑101 (MQ=255)
ggC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCctct > 2:779141/1‑101 (MQ=255)
c.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCCTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCCTCttt < 1:181742/101‑1 (MQ=255)
|
TGGATCTCGCTCGGCTTCGCCTCGTTCCAGCCTTCGGAATTCCTCAAGCCCGGCTTCGTCATCGTCTCGGCCTGGTTCATGGCCGCCGCGCTGGAAGTGGC.GGGC.CCG.CCC.GGGC.GGCTTTATTCCTTCATCCTCACCGCGCTGATCGTCGTCACCCTGGCACTGCAGCCCGACTTCGGCCAGGCCTCGCTGATCCTCTTT > NC_014034/901315‑901515
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 21 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|