| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_014034 | 1395500 = | 156 (1.000) | 91 (0.580) | 41/128 | 5.3 | 0.41 | intergenic (+312/‑619) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| ? | NC_014034 | = 1397797 | 108 (0.440) | intergenic (+101/+1797) | RCAP_rcc01307/RCAP_rcc01309 | hypothetical protein/IS66 family transposase | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 375 total aligned reads displayed.
CCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCA > NC_014034/1395401‑1395600
|
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.gtgt < 1:2263058/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGc > 2:1677873/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcc > 1:3254709/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GGGTCGCTcc > 2:1100560/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGATGGTAAC.GTGTCGCTcc > 2:719928/1‑101 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTccc < 1:2291375/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccc > 2:1893571/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCcg < 1:4857107/101‑1 (MQ=255)
gcgggtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCcgc > 1:2879930/4‑101 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:1387923/1‑101 (MQ=255)
gctgggcgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:2367564/92‑1 (MQ=0)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGtcgca > 1:1393888/1‑97 (MQ=255)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1045936/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:4755427/101‑1 (MQ=255)
accgggggTCGCCCCCCCCGCGGGGGGGGGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:1257018/95‑1 (MQ=38)
tcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:747863/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:400864/101‑1 (MQ=255)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:505163/5‑101 (MQ=2)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:2355247/97‑1 (MQ=2)
cgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:1693482/98‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:2191811/99‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:3455829/3‑101 (MQ=2)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:4175733/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:2059217/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:1218691/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgct < 1:4569955/101‑1 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:2560976/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAccttt > 2:2042668/1‑99 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc < 1:4907255/101‑4 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:34010/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 1:2899007/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 2:4340145/101‑5 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 2:308916/101‑5 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 2:2125428/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat < 2:322082/101‑7 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg > 2:656064/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTCGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg > 2:4564505/1‑101 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 1:642294/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 1:4796121/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACGCCGGGGCTCTGGTC.AC.GGTTTGTGACGGTGTCGCACCCCCCGCGGGGGCGTGGACCGAAACAgctttcaatggg < 1:2471888/101‑10 (MQ=2)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTc < 2:1569565/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGGGCCGTCg > 2:419310/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 2:2515044/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.t < 2:3676538/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAATATCTCGGTGCCGTCGCTCG.Tc < 1:3727499/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.Tcc < 2:3931898/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCa < 2:1526942/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAg > 2:4909123/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGc > 2:2635514/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCCCG.Tccctc > 2:4713014/1‑98 (MQ=255)
gATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGc.c > 2:2400467/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGc.c > 2:3794918/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.Cg < 1:3654304/101‑1 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGGCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.c > 2:1765393/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.c > 2:3641671/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCt > 2:1498374/1‑101 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCtcgt > 2:336874/1‑101 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCtcgt < 1:875652/101‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTccc < 1:2999629/101‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCCCTccc > 1:4972627/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTccccc > 2:4443925/1‑101 (MQ=255)
gCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTcccccc < 2:2148512/101‑1 (MQ=255)
gCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTcccccc < 2:581116/101‑1 (MQ=255)
gtgtggataGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCcg < 2:401108/93‑1 (MQ=255)
ggTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCcgc > 2:2762534/1‑101 (MQ=255)
aCAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:3094561/1‑101 (MQ=255)
aCAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:2910156/1‑101 (MQ=255)
aCAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:351413/1‑101 (MQ=255)
cAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGGCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:1608815/1‑101 (MQ=255)
aGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 1:1599982/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 1:4611117/101‑1 (MQ=255)
cTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:107815/1‑101 (MQ=255)
ggTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:4017875/101‑1 (MQ=255)
ccctcgcacgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGA.CGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:1817183/92‑1 (MQ=2)
gTAAC.GTTTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:2247891/1‑101 (MQ=255)
gTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:5048612/101‑1 (MQ=255)
gTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:2212397/1‑101 (MQ=255)
gTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 2:2830023/1‑101 (MQ=255)
tAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGGTCg > 2:929179/1‑101 (MQ=255)
gccggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTC.TGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:1988851/94‑1 (MQ=2)
tcgcccgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGA.CGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:2141665/95‑1 (MQ=2)
gcggcggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAAAAAGCCGCCGACAAACGCGGCAAC.CGG.CCC.G.GCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:3585850/95‑1 (MQ=2)
ccggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTC.TGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3778561/95‑1 (MQ=2)
aaC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:3342490/101‑1 (MQ=255)
ctgcggtCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAAAAAGCCGCCGACAAACGCGGCAAC.CGG.CCC.G.GCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:1754332/96‑1 (MQ=2)
cgcacgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGA.CGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:392385/96‑1 (MQ=2)
aC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 1:1038922/1‑101 (MQ=255)
ggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGGGCCGCAGCGAG.TGCGTC.TGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:1945034/5‑101 (MQ=2)
c.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCT.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:1535899/1‑101 (MQ=255)
gtggtCGCACCCCCAGCGGGGGCGTGGATCGAACCA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTC.TGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:4361551/98‑1 (MQ=0)
cgcgtCGCCCCCCCCGGGGGGGCGTGGATCGAAACACCCCGAACCTGTCG.GCG.GCGAACACCG.ATA.CCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:2752067/98‑1 (MQ=2)
gtgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAac > 1:3693590/1‑101 (MQ=255)
ggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTC.TGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAact < 1:3451392/100‑2 (MQ=2)
ggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTC.TGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAact > 1:4161174/2‑100 (MQ=2)
cgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAGCAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGC.CGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAact < 1:1650046/100‑2 (MQ=2)
gtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGCTCGAAacca > 2:3888596/1‑101 (MQ=255)
gtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAacca > 1:3591251/1‑101 (MQ=255)
gtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGCCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAaaca > 1:4443691/1‑101 (MQ=255)
gtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGATGATCAAATCCGCA.ATCGGC.CGG.GCTCGATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAacg < 2:3020265/101‑2 (MQ=2)
gtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAAAAAGCCGCCGACAAACGCGGCAAC.CGG.CCC.G.GCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAaccc < 2:3134417/101‑2 (MQ=2)
|
CCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGC.CGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCA > NC_014034/1395401‑1395600
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|