New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 222019 =1161 (4.890)66 (0.280) 3/194 28.2 0.09 coding (638/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222126 235 (0.960)coding (531/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 2072 total aligned reads displayed.

CTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGG  >  NC_014034/221919‑222119
                                                                                                    |                                                                                                    
 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                     >  1:4682588‑M1/37‑101 (MQ=255)
 ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                     >  1:74347‑M1/37‑101 (MQ=255)
   atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGt                                                                                                   <  2:1042118‑M1/67‑1 (MQ=255)
    tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                  >  1:1572893‑M1/34‑101 (MQ=255)
     gcgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                 >  1:3755557‑M1/33‑101 (MQ=255)
     cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                 >  2:4846033‑M1/33‑101 (MQ=255)
      ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                                >  2:3051721‑M1/32‑101 (MQ=255)
      ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                                >  2:4298858‑M1/32‑101 (MQ=255)
         gggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                                             >  2:3460898/8‑99 (MQ=11)
         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                             <  1:2786304‑M1/73‑1 (MQ=255)
          gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                            >  2:1655832‑M1/28‑101 (MQ=255)
           ggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                           >  1:4144233‑M1/27‑101 (MQ=255)
             tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                         <  1:2448932‑M1/77‑1 (MQ=255)
              ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                        <  1:3477608‑M1/78‑1 (MQ=255)
                gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                      <  2:2846809‑M1/80‑1 (MQ=255)
                       gCGTGGGCTCGGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                               <  2:1221517/101‑1 (MQ=255)
                        ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                              <  2:2376339‑M1/88‑1 (MQ=255)
                            ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                          >  2:4663107/10‑101 (MQ=11)
                              gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGAACCGTGGGAt                                                                        >  1:2157639/8‑101 (MQ=11)
                              gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                        <  2:3708140/97‑1 (MQ=11)
                               tcgggggggtcggtggggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                       <  1:18811/92‑1 (MQ=11)
                               gccgtggggtcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                       <  2:3166255/92‑1 (MQ=11)
                                ccctcggcgcggtcggggcccttggagcggccgggcccctgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                                                                      <  2:836883/92‑2 (MQ=2)
                                  gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTGGGATCCGGGGGGtcggt                                                                    >  2:2174399/10‑101 (MQ=11)
                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTggggtggggg                                                                   >  2:3524893/3‑94 (MQ=11)
                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGgggcgcggcg                                                                   >  1:2087040/3‑94 (MQ=11)
                                   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcggtg                                                                   >  2:4746835/3‑100 (MQ=11)
                                   tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                   >  1:149035‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                    gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                  <  1:141266‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                    gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcg                                                                  <  2:2002970‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                     gggccgggcgggtccgtgggagcggtggggtccgtgggagCGGTCGCGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgg                                                                 <  1:948782/97‑1 (MQ=11)
                                     ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGTtcgggagg                                                                 >  2:491795/1‑97 (MQ=11)
                                      gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCggg                                                                >  1:3370278/1‑101 (MQ=11)
                                        tcggtcgggtccgtgggatcggtccggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc                                                              <  2:2568682/101‑1 (MQ=11)
                                         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                             >  1:4908647/1‑101 (MQ=14)
                                         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                             >  2:583967/1‑101 (MQ=11)
                                         cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                             <  2:2742895/101‑1 (MQ=11)
                                         cggtccgttccgtgagatcggtcgggtccgcgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                             <  2:4113265/101‑1 (MQ=11)
                                          gttcggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                            <  2:3622558/99‑1 (MQ=11)
                                          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGGGATGGGACGGGTGCg                                                            >  2:4194990/1‑101 (MQ=11)
                                           ggcgggtccgtgggttgggtcgggtccttgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                           <  1:2877821/99‑1 (MQ=11)
                                            tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggTCGGGTCCGTGGGGAAGGGCGGGTCCGTGGGCTCGGGCGGGTTCGTGGGCTCGGTCGGTTTCGtg                                                          >  1:3523152/1‑100 (MQ=2)
                                            tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGCTCGGGCGGGTCGGGGGGATCGGTCGGGCCCGtg                                                          >  1:2535958/1‑100 (MQ=11)
                                            tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGCCGGCGCCGTGGGATCGGGCGGTCCCGtg                                                          >  1:836985/1‑100 (MQ=11)
                                             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                         <  2:141250/101‑3 (MQ=11)
                                              gggtccgtgggatctgtcaggtccgtgggatcggtcGAATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                        <  2:3370330/101‑1 (MQ=14)
                                              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                        <  2:174852/101‑1 (MQ=11)
                                              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGTCCGTGgg                                                        >  1:601151/1‑101 (MQ=11)
                                              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGACGCGTCTGTGCGCTCGACCGGGCCCGtgga                                                        >  1:1964793/1‑98 (MQ=2)
                                               gggacgtgggctcggtctggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                       <  2:653232/97‑1 (MQ=11)
                                                 tccgtgggattggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                     <  1:3687281/101‑1 (MQ=14)
                                                   cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                                                   <  1:4768914‑M2/101‑9 (MQ=255)
                                                    gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                  <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)
                                                       ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                               <  2:2276556‑M2/101‑13 (MQ=255)
                                                         gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                             >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)
                                                         atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                             <  1:2702138‑M2/101‑15 (MQ=255)
                                                           cggtcgggtccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                                           >  1:3962217‑M2/1‑85 (MQ=255)
                                                           cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtac                                           >  2:2098665/1‑99 (MQ=11)
                                                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc                                           <  1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)
                                                            ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                          <  1:2356957‑M2/101‑18 (MQ=255)
                                                            ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                          <  1:4410211‑M2/101‑18 (MQ=255)
                                                              gcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                        <  1:4312772/100‑2 (MQ=11)
                                                               cggatgcgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgtag                                       <  1:4583912/95‑3 (MQ=11)
                                                                gggggcgtggggttcgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                      <  1:3593690/96‑1 (MQ=11)
                                                                ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                      >  2:4007734/4‑101 (MQ=255)
                                                                ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                      >  2:2940424/4‑101 (MQ=11)
                                                                  gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                                    >  2:4561036‑M2/1‑78 (MQ=255)
                                                                  atcggtggggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggat                                    <  1:4828231/97‑3 (MQ=11)
                                                                   tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatc                                   <  1:3192344/101‑1 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                  <  1:1778199‑M2/101‑26 (MQ=255)
                                                                    ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg                                  >  1:1160963/1‑100 (MQ=255)
                                                                      gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt                                >  2:1307959/1‑101 (MQ=11)
                                                                       tgggatgggtcgcGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                               <  2:1110099/101‑2 (MQ=11)
                                                                       tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGAGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGAcggggccgcggggtccgtc                               >  1:653321/1‑100 (MQ=11)
                                                                        gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcg                              <  1:1062320‑M2/101‑30 (MQ=255)
                                                                        gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcg                              <  1:888517‑M2/101‑30 (MQ=255)
                                                                        gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                              >  2:5016845/1‑99 (MQ=11)
                                                                        cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGGgg                              >  1:2260910/11‑101 (MQ=11)
                                                                         gctgccgtcgtATCCGTCGGATCGGTCGGCTCCGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                             <  2:2669122/95‑1 (MQ=11)
                                                                           gcgcggaagATCCGTGGGGTAGGTGGGGTGCGTGGGAGGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                           <  1:2608537/93‑1 (MQ=2)
                                                                           atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt                           <  1:3295346/101‑1 (MQ=11)
                                                                             cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCAGTCGGATCGGTCGGAtcg                         >  2:3271322/1‑101 (MQ=11)
                                                                               gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                       >  2:1514056/4‑101 (MQ=14)
                                                                                tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                      <  1:520693/101‑1 (MQ=11)
                                                                                 cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcgggcg                     >  2:2462054/1‑101 (MQ=11)
                                                                                  ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                    <  1:1687410‑M2/101‑40 (MQ=255)
                                                                                   gATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                   >  2:1860607/1‑101 (MQ=17)
                                                                                    aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggag                  <  2:3925114‑M2/101‑42 (MQ=255)
                                                                                       cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg               <  2:903777‑M2/101‑45 (MQ=255)
                                                                                         tcggATCGGTGGGGTCCGGGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTAGGATCGGTCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg             <  1:421082/99‑1 (MQ=18)
                                                                                         tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc             <  2:3781738‑M2/101‑47 (MQ=255)
                                                                                             gtccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggat         >  2:4456432‑M2/2‑51 (MQ=255)
                                                                                              nccgtcggatcCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggncggatc        <  1:384141‑M2/98‑52 (MQ=255)
                                                                                              acggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatc        >  1:4456007‑M2/2‑50 (MQ=255)
                                                                                               cggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc       >  1:4066612‑M2/1‑49 (MQ=255)
                                                                                                 gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgt     <  1:3077796‑M2/101‑55 (MQ=255)
                                                                                                 gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt     >  1:1249286‑M2/1‑47 (MQ=255)
                                                                                                  tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg    <  1:2971776‑M2/101‑56 (MQ=255)
                                                                                                   cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgg   >  2:4398666‑M2/1‑45 (MQ=255)
                                                                                                    gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggg  >  1:4978642‑M2/1‑44 (MQ=255)
                                                                                                    |                                                                                                    
CTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGG  >  NC_014034/221919‑222119

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG