| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,979 | 0 | G→C | 6.1% | 71.9 ‑3.4 ‑3.0 | 655 | T226T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/13): ref base (303/310): total (332/323) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.31e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.11e-03 | ||||||||||
Only 100 of 1764 total aligned reads displayed.
CCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGG > NC_014034/221879‑222083
|
cGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:1567890/1‑101 (MQ=255)
aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 2:4012253/101‑1 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagat < 1:3017300‑M1/30‑5 (MQ=255)
tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGCTCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg < 2:847576/101‑1 (MQ=255)
ttGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 1:4638630/1‑101 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga < 1:2900059‑M1/39‑1 (MQ=255)
tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg > 2:2867401/1‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcgg < 1:4899009‑M1/43‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 2:251537‑M1/58‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc < 1:4433456‑M1/45‑1 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtctgtcgggtccgtgggatcggtcg < 2:4306646‑M1/46‑1 (MQ=255)
gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:3767863‑M1/47‑1 (MQ=255)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:385676‑M1/47‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:957174‑M1/51‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg < 1:1345135‑M1/52‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcagtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:1406813‑M1/52‑1 (MQ=255)
gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 2:2191448/101‑1 (MQ=255)
ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:169117/1‑101 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTgg < 2:1910660‑M1/55‑1 (MQ=255)
cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:212985/1‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg > 1:4978642‑M1/46‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg > 1:266027‑M1/46‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:2297750‑M1/56‑1 (MQ=255)
cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:3199065/1‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 1:1692383‑M1/60‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:3613150‑M1/62‑1 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg < 2:2978477‑M1/66‑1 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggg < 2:2029485‑M1/67‑2 (MQ=255)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc > 2:5030897‑M1/34‑98 (MQ=255)
gcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:1055934‑M1/34‑101 (MQ=255)
gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:220675‑M1/71‑1 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:750516‑M1/31‑101 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 1:4729846‑M1/30‑101 (MQ=255)
cggttccgtgggatcggtcggttccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:1780607‑M1/29‑101 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:4409892‑M1/29‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:3883834‑M1/25‑101 (MQ=255)
gccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:613186‑M1/25‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 2:3524278‑M1/79‑1 (MQ=255)
gcagtgtcgggATCCGTCGCAACGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGATCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:2284463/93‑1 (MQ=11)
tcggtgtccTCGGTGGGCTCGGTCGTGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:1047287/93‑1 (MQ=11)
gCGTGGGCTCGGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:1221517/101‑1 (MQ=255)
tcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 1:531930‑M1/90‑1 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg < 2:592236/101‑3 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:2730048/11‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgagGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGAAGCCAACGTGGTATCGGACGGTTCGGTGGGa > 1:409787/9‑101 (MQ=2)
gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:3708140/97‑1 (MQ=11)
cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAACCGTGGGag > 2:923653/1‑100 (MQ=255)
tcgggggggtcggtggggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:18811/92‑1 (MQ=11)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 1:4254786‑M1/7‑101 (MQ=255)
ccggcggATCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:4744983/97‑1 (MQ=11)
gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt < 2:3391471/92‑1 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:3491397‑M1/98‑1 (MQ=255)
gggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 1:1776896/98‑1 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:2413948‑M1/3‑101 (MQ=255)
gggtcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:3527732/98‑1 (MQ=11)
ggatccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 2:4188742/101‑1 (MQ=14)
ggaacggtcggggccgtgggatgggtcgggtccgtcGGATCAGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGAGTCCGTCGGAtcggtcgg < 1:3691083/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGGCCGAGGGACCGGCCGGGCTCGTGGGAGCGGACggg > 1:4364462/1‑101 (MQ=11)
gtctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 1:1568596/97‑3 (MQ=14)
gtccgtcggttccgtgggatcggtcggctccgtcggatcgGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:1310571/97‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:2594119/101‑1 (MQ=11)
gccgccgggtccgtgggatcggtagggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:4823231/96‑1 (MQ=14)
cggtccgttccgtgagatcggtcgggtccgcgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:4113265/101‑1 (MQ=11)
cgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:722874/101‑1 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:3077558/101‑1 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTACGTGGGGAGCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCTTGGGGACGGTCGGATCCg > 2:1118475/1‑101 (MQ=14)
ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:3975612/1‑101 (MQ=11)
gtcgggtccgtggtatcggtcgggtccgggggatccGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGt < 2:2755405/101‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCCGGTGGGTCCGt > 1:662047/1‑101 (MQ=11)
gtcggatccgtggtatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:3616070/101‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGccctg > 1:2833192/1‑98 (MQ=11)
gcgtggccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTa < 2:665355/95‑1 (MQ=11)
gcgggtgcgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 1:824924/100‑2 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:4473456‑M2/101‑3 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 1:3409668/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:3462219‑M2/1‑99 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg < 1:1141956/101‑3 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTGGGGTCCGTGgg > 2:3298188/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg < 1:3125997/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGACGCGTCTGTGCGCTCGACCGGGCCCGtgga > 1:1964793/1‑98 (MQ=2)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg > 2:4451843/4‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCgg < 1:3316895/98‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGCGGGGGCGGTCGCATCGGCGGGCTCGCTCGGGGCCgcgccgc > 2:2694685/1‑95 (MQ=9)
ggacgtgggagcggtggggtccgtggggtgagtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2515932/98‑1 (MQ=11)
acccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 2:1432790/99‑1 (MQ=11)
tccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:1473594/101‑1 (MQ=14)
gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGTGAtcggc > 2:2144962/1‑100 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt > 1:1246404‑M2/1‑92 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt < 1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)
tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtggggc > 2:4914652/1‑99 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 2:4628444‑M2/101‑12 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 1:2054153‑M2/101‑12 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 1:4178656‑M2/101‑12 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg < 1:89966‑M2/101‑13 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg < 2:2593938‑M2/101‑13 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggat < 1:4822183‑M2/101‑15 (MQ=255)
atcggtcggggccgtggggtccggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat < 2:3772001/101‑3 (MQ=11)
cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc > 1:2427144/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc > 2:3176530‑M2/1‑85 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCAGGGGGATCGgtcgggtccg > 2:453301/1‑101 (MQ=11)
|
CCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGG > NC_014034/221879‑222083
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|