Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,402 | C→G | 5.2% | intergenic (+214/‑717) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,402 | 0 | C→G | 5.2% | 20.7 ‑1.4 ‑0.2 | 244 | intergenic (+214/‑717) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (9/4): ref base (115/116): total (124/120) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.55e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.29e-01 |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
ACAAGCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTC > NC_014034/1395303‑1395502
|
cAAGCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCg < 2:4030913/101‑1 (MQ=255)
aGCACCTTCGCCCCCCCAGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCt < 2:1486938/101‑1 (MQ=255)
aGCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCGCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCt > 1:4350960/1‑101 (MQ=255)
gCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTg > 1:1585278/1‑101 (MQ=255)
ccTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGcc < 1:3087228/101‑1 (MQ=255)
cTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGccc < 1:1745609/101‑1 (MQ=255)
cTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGccc < 1:1714047/101‑1 (MQ=255)
ttCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCt < 1:2539965/101‑1 (MQ=255)
ttCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCt > 1:3864539/1‑101 (MQ=255)
tCGGACCACGGGAGCAATTTACACCGGCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTg < 1:2786366/101‑1 (MQ=38)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGcc < 2:4588757/101‑1 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGcc < 1:3376779/101‑1 (MQ=255)
caccacCGGAGCAATTTACACGGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcg > 1:3716393/1‑101 (MQ=255)
ccaccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggt < 2:2807900/101‑1 (MQ=255)
ccaccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCACCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGAcggg > 2:1944473/1‑100 (MQ=255)
caccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtg < 2:1842893/101‑1 (MQ=255)
accGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCCCGGGGGCGTCGATCGAAACTGCACCCCCCGGCCCCGCcgggga > 1:4376390/1‑101 (MQ=37)
cGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatc < 2:1892528/101‑1 (MQ=255)
ggAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcg > 2:2186697/1‑101 (MQ=255)
aGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggt > 2:820647/1‑101 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 1:537407/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at > 2:164066/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at > 1:1636769/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at > 1:2435580/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggggatcgggg.at > 1:902195/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggcgatcggtg.at > 2:522397/1‑101 (MQ=255)
aaTTTACACCGTCTGGGCAGCGGGTTACGAAACGGCAGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at < 1:3591544/101‑1 (MQ=255)
aTTTACGCCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 2:3844140/101‑1 (MQ=255)
tttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 1:2230667/101‑1 (MQ=255)
tttAAACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa > 2:1226659/1‑101 (MQ=255)
tACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGc < 2:1296915/101‑1 (MQ=255)
cacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCgg > 1:1376203/1‑101 (MQ=255)
acCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGt < 1:4832032/101‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc < 1:1966755/101‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTc > 1:2455524/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc < 2:263749/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc > 2:4092344/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc < 2:4531187/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc < 2:692301/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.CTCAGCGGTCGCGccc > 2:3589437/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCCGCGGTCGCTccc > 2:1008494/1‑101 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccccc > 1:4873747/1‑101 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccccc < 2:4301920/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcccccc > 2:638569/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg < 1:3452953/101‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg > 2:2983726/1‑101 (MQ=255)
cGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcgcg > 1:3969472/1‑101 (MQ=255)
ggTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggg > 2:1717411/1‑101 (MQ=255)
ttACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:4444235/1‑101 (MQ=255)
ttACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:1157339/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:3499169/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:875550/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCCCGGGGGc > 2:4819848/1‑101 (MQ=255)
cGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 1:967467/101‑1 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:67322/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 2:2291211/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:3955551/1‑101 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:4452978/101‑1 (MQ=255)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:10638/8‑101 (MQ=2)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:1277868/94‑1 (MQ=2)
caacactgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:1785175/8‑101 (MQ=2)
aaCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGAG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 1:4311281/1‑101 (MQ=255)
gcGGCCGGCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:1429315/100‑1 (MQ=38)
aCGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTACCGGTGATTGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 2:4017572/1‑101 (MQ=255)
cGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:3750291/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:5050779/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 1:1932425/1‑101 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.AGCAGCGGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:4389555/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAActc < 1:4575325/101‑3 (MQ=2)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACa > 1:2482010/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:787531/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc < 2:3242635/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc < 2:1587377/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 2:2880431/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgcc > 1:2082614/1‑101 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt < 1:2987644/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt < 1:3829105/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 2:3032144/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 1:3137390/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 2:4940518/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTgg > 1:1483847/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:3270904/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 2:4768201/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc < 2:3137470/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 1:2327862/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 1:4188883/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 1:2928791/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg < 1:1157456/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt > 2:3342227/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 1:5048942/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 1:2146742/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:3716115/101‑1 (MQ=255)
aCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 1:3270020/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 2:1690843/1‑101 (MQ=255)
cTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 2:2455350/101‑1 (MQ=255)
tGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 2:4243897/101‑1 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:638658/98‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg < 1:2589447/101‑1 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt < 2:4811535/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc > 1:1097574/1‑101 (MQ=255)
|
ACAAGCACCTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTC > NC_014034/1395303‑1395502
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|