| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,474 | T→G | 18.5% | intergenic (+286/‑645) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,474 | 0 | T→G | 18.5% | 143.4 ‑1.5 ‑0.1 | 281 | intergenic (+286/‑645) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/32): ref base (111/118): total (131/150) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.19e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.72e-01 | ||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
CCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCC > NC_014034/1395374‑1395574
|
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCt < 1:2987644/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTg < 1:2049402/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 1:3857868/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:3270904/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 2:4768201/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc < 2:3137470/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTTTTCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCg > 2:1676202/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 2:2527687/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 1:4188883/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGAGCGGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTTGACAgg < 2:866079/101‑1 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 2:3597497/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:3733854/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 2:1690843/1‑101 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCCGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa > 1:149226/1‑101 (MQ=255)
tGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 2:4243897/101‑1 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.g < 1:638658/98‑1 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.g < 2:4082931/98‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCCACAGGCTGGTAAC.g > 2:1554630/1‑101 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.gtgt < 1:2263058/101‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.gtgt < 1:3228443/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTc > 1:1097574/1‑101 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGGCGc > 2:2293459/1‑101 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCt < 2:1932288/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTCATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcc > 1:725385/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccc > 2:4610795/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccc < 2:444843/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTccccc > 1:3297734/1‑101 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTccccc > 1:2344285/1‑101 (MQ=255)
gcgggtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCcgc > 1:2879930/4‑101 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCcgc > 1:2125576/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:1387923/1‑101 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:3056649/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:1018746/1‑101 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:2653659/1‑101 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGtcgca > 1:1393888/1‑97 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:4009993/93‑1 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCCGGGGCGTGGAta < 1:2745391/93‑2 (MQ=2)
ctggacgtggTCGCTCCCACCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:3685569/9‑101 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:2869411/8‑101 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:3085772/7‑101 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:4931009/7‑101 (MQ=2)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:4755427/101‑1 (MQ=255)
accgggggTCGCCCCCCCCGCGGGGGGGGGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:1257018/95‑1 (MQ=38)
tcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:69978/1‑101 (MQ=255)
gacgtggTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:579059/96‑1 (MQ=2)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:505163/5‑101 (MQ=2)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:2355247/97‑1 (MQ=2)
cgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCCCGGGGGCGTGGATCGaaaa > 1:3510275/4‑100 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GCGTCGCTCCCCCCGCCGGGGCGTGGATCGcaaaa > 1:1992925/3‑99 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:2191811/99‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:493847/3‑101 (MQ=2)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:1736651/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:4576618/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:2289729/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:1218691/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgct < 1:815995/101‑1 (MQ=2)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc < 1:164082/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc < 2:3659068/101‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTAGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctt < 1:3729735/101‑2 (MQ=2)
cccaccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCTCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 2:4154969/97‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:392142/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:2560976/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAccttt > 2:2042668/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc > 2:4387371/1‑101 (MQ=255)
cGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACCCCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt < 1:3674651/101‑3 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:34010/1‑101 (MQ=255)
ccTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc < 2:3503762/100‑4 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 2:4340145/101‑5 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCgg > 1:3615483/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa > 1:2200852/1‑96 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 2:2125428/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 2:3428540/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTg > 2:656064/1‑101 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 1:4796121/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACGCCGGGGCTCTGGTC.AC.GGTTTGTGACGGTGTCGCACCCCCCGCGGGGGCGTGGACCGAAACAgctttcaatggg < 1:2471888/101‑10 (MQ=2)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGGGCCGTCg > 2:419310/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt < 2:951424/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 2:1074800/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTc < 2:1107056/101‑1 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAA.GTGTTGGTCCCCCCGCGGGGGGGGGGGTCGAAACACCTCGGTGCCCTCGCTc > 1:454161/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 1:5012315/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 2:3931898/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTcc < 2:247596/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 2:5029150/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGGCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 2:1765393/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 2:3641671/1‑101 (MQ=255)
gAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:3227081/1‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 2:1571890/101‑1 (MQ=255)
aaaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt > 2:151340/1‑101 (MQ=255)
aCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGc > 1:2908777/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt > 2:1498374/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt > 2:2980976/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt < 1:3444660/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGCCCAGCCGGCCTGCtc > 1:1076904/1‑101 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt > 2:2645470/1‑101 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt < 1:875652/101‑1 (MQ=255)
cgcTTTGGCGGTCCACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATTGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGc < 1:1554760/101‑1 (MQ=255)
cTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGCCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc > 1:1832802/1‑101 (MQ=255)
tttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 2:3948998/1‑101 (MQ=255)
tttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc < 2:4860298/101‑1 (MQ=255)
|
CCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCC > NC_014034/1395374‑1395574
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|