| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,477 | G→T | 18.2% | intergenic (+289/‑642) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,477 | 0 | G→T | 18.2% | 127.5 ‑1.8 0.0 | 284 | intergenic (+289/‑642) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/32): ref base (116/116): total (136/148) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.67e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
GCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCC > NC_014034/1395377‑1395577
|
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg > 1:3857868/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCggg > 2:3548410/1‑100 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTc < 2:3137470/101‑1 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc < 2:537328/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 2:4015583/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 1:4188883/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACa > 2:4778598/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg > 1:90282/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 1:2928791/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGAGCGGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTTGACAgg < 2:866079/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt > 2:3342227/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 2:4148152/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg < 1:2880644/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 2:1218574/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 1:2146742/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:3716115/101‑1 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCCGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa > 1:149226/1‑101 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 2:4406506/101‑1 (MQ=255)
gcccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.g < 1:638658/98‑1 (MQ=255)
gcccccGCGGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.g < 2:639599/98‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCCACAGGCTGGTAAC.g > 2:1554630/1‑101 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTCAC.gt < 2:167720/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTc > 1:1097574/1‑101 (MQ=255)
cccTGTCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCg < 2:2532249/99‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCg < 2:1097460/101‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCAGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCg < 2:2211804/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTcccc > 2:1791523/1‑98 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCt < 2:1932288/101‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTc > 2:3934627/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcc > 1:3254709/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGATGGTAAC.GTGTCGCTcc > 2:719928/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTCATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcc > 1:725385/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccc < 2:444843/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccc > 2:4610795/1‑101 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTccccc > 1:2344285/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccccc < 1:3042657/101‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCcg < 1:4857107/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:3056649/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:2653659/1‑101 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:3499439/101‑1 (MQ=255)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:1700424/92‑1 (MQ=2)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGtcgca < 2:1393762/101‑5 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGtcgca > 1:1393888/1‑97 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:4939415/93‑1 (MQ=0)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:4009993/93‑1 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:2869411/8‑101 (MQ=2)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 1:1616646/8‑101 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:3378767/1‑101 (MQ=255)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1045936/101‑1 (MQ=255)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:3134655/7‑101 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 2:2327372/95‑1 (MQ=2)
tcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:4267358/1‑101 (MQ=255)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:505163/5‑101 (MQ=2)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:1582642/97‑1 (MQ=2)
cggggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:2283641/98‑1 (MQ=2)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 2:2135945/1‑101 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GCGTCGCTCCCCCCGCCGGGGCGTGGATCGcaaaa > 1:1992925/3‑99 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 1:2754232/99‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:3455829/3‑101 (MQ=2)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 2:4873420/101‑1 (MQ=255)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:1736651/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:4175733/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:2059217/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:2289729/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:1218691/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgct < 2:3647129/101‑1 (MQ=2)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgct < 1:815995/101‑1 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt < 2:2102259/101‑3 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:2560976/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt < 1:4939491/101‑3 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:392142/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAccttt > 2:2042668/1‑99 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGCCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:4659003/1‑99 (MQ=0)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCgg < 2:2502345/101‑1 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa > 1:3411170/1‑96 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 1:360359/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 2:4350643/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACGCCGGGGCTCTGGTC.AC.GGTTTGTGACGGTGTCGCACCCCCCGCGGGGGCGTGGACCGAAACAgctttcaatggg < 1:2471888/101‑10 (MQ=2)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGt < 2:67312/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc < 2:1292297/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt < 2:951424/101‑1 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTc > 1:222972/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAA.GTGTTGGTCCCCCCGCGGGGGGGGGGGTCGAAACACCTCGGTGCCCTCGCTc > 1:454161/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCg > 1:5012315/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGt < 2:3676538/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAATATCTCGGTGCCGTCGCTCGTc < 1:3727499/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGc > 2:3615592/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGcc > 2:3794918/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGcc > 2:2400467/1‑101 (MQ=255)
gAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:3227081/1‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt > 2:151340/1‑101 (MQ=255)
aaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:4768524/101‑1 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt > 2:1498374/1‑101 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt > 2:2980976/1‑101 (MQ=255)
aTCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGCCCAGCCGGCCTGCtc > 1:1076904/1‑101 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt > 2:2645470/1‑101 (MQ=255)
gcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCt > 1:3657427/1‑101 (MQ=255)
gcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGACTGCTCTTCGcc > 2:4214950/1‑100 (MQ=255)
cTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGCCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc > 1:1832802/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccc > 1:1677328/1‑101 (MQ=255)
|
GCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCC > NC_014034/1395377‑1395577
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|