| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,496 | A→C | 17.7% | intergenic (+308/‑623) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,496 | 0 | A→C | 17.7% | 133.3 ‑1.6 ‑0.1 | 282 | intergenic (+308/‑623) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (19/31): ref base (113/119): total (132/150) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.11e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.78e-01 | ||||||||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
CTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAA > NC_014034/1395396‑1395596
|
cTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 2:2455350/101‑1 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCCGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa > 1:149226/1‑101 (MQ=255)
tGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc < 2:4243897/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaagg > 1:679051/1‑99 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.g > 1:3891483/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCCACAGGCTGGTAAC.g > 2:1554630/1‑101 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.gtgt < 1:3228443/101‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCg < 2:1097460/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGc > 2:1677873/1‑101 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTc > 2:3934627/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcc > 2:4438311/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcc < 1:275460/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccc > 2:1893571/1‑101 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTcccccc < 2:3854401/101‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCcg < 1:4857107/101‑1 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 1:4410603/1‑101 (MQ=255)
tgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:642205/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:581195/1‑101 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:1635762/101‑1 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:3499439/101‑1 (MQ=255)
gctgggcgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:2367564/92‑1 (MQ=0)
gctggacgtggTCGTTCCCCCCGCGGTGGCGTGGATCGAATCTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:5027267/92‑1 (MQ=0)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGtcgca < 2:1393762/101‑5 (MQ=255)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:1902821/101‑1 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCACCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:3685569/9‑101 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 1:219245/8‑101 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:3378767/1‑101 (MQ=255)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1045936/101‑1 (MQ=255)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:2654035/101‑1 (MQ=255)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:3085772/7‑101 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:4931009/7‑101 (MQ=2)
ggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGCGGATCGa > 2:4506418/7‑101 (MQ=2)
tcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:747863/101‑1 (MQ=255)
gacgtggTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:579059/96‑1 (MQ=2)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:400864/101‑1 (MQ=255)
acgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:1582642/97‑1 (MQ=2)
cgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:2721238/98‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:2191811/99‑1 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:493847/3‑101 (MQ=2)
gtggTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:3582553/99‑1 (MQ=2)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:1736651/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:1983638/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:1218691/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:2059217/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAAAt > 2:2088410/1‑101 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc < 2:3659068/101‑1 (MQ=255)
cccaccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCTCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 2:4154969/97‑1 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt > 1:2560976/1‑99 (MQ=2)
cGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACCCCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgcttt < 1:3674651/101‑3 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 1:2899007/101‑1 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 2:308916/101‑5 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCgg > 1:3615483/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa > 1:3411170/1‑96 (MQ=2)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGt < 2:3428540/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACACCGGGGCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACG.GAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat < 2:322082/101‑7 (MQ=0)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGc < 1:3521024/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 2:4350643/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTACGCCGGGGCTCTGGTC.AC.GGTTTGTGACGGTGTCGCACCCCCCGCGGGGGCGTGGACCGAAACAgctttcaatggg < 1:2471888/101‑10 (MQ=2)
cgGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc < 2:1292297/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt > 2:2515044/1‑101 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAATATCTCGGTGCCGTCGCTCGTc < 1:3727499/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCCCGTccctc > 2:4713014/1‑98 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGGCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 2:1765393/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 2:3641671/1‑101 (MQ=255)
cGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGc > 2:680381/1‑101 (MQ=255)
gAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc > 2:2132770/1‑101 (MQ=255)
aaaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt > 2:151340/1‑101 (MQ=255)
aaCATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:4768524/101‑1 (MQ=255)
cATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCt > 2:1498374/1‑101 (MQ=255)
cgccgcTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt < 1:875652/101‑1 (MQ=255)
cgcTTTGGCGGTCCACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATTGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGc < 1:1554760/101‑1 (MQ=255)
cTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc > 1:2256477/1‑101 (MQ=255)
tttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc < 2:4860298/101‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccc > 2:2302729/1‑101 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccc < 2:787429/101‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccc < 1:2999629/101‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCCCTccc > 1:4972627/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccc > 1:1677328/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccccc > 1:2287441/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccccc > 2:4185892/1‑101 (MQ=255)
gCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcccccc < 1:1388049/101‑1 (MQ=255)
gtgtggataGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCcg < 2:401108/93‑1 (MQ=255)
ggTCGGCGGGCTGGTAAC.GTGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCcgc < 1:3934919/101‑1 (MQ=255)
cGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCggg > 2:2620783/1‑101 (MQ=255)
aCAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCggggg > 2:2910156/1‑101 (MQ=255)
ggCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCgg > 2:2986118/1‑100 (MQ=255)
gCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 1:4611117/101‑1 (MQ=255)
cTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:4234010/1‑101 (MQ=255)
cTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:107815/1‑101 (MQ=255)
tGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 2:2372520/101‑1 (MQ=255)
ggTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:4017875/101‑1 (MQ=255)
ggTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGACGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGCCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:1636637/101‑1 (MQ=255)
ggTAAC.GTGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:1795421/101‑1 (MQ=255)
gTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:5048612/101‑1 (MQ=255)
gTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATc > 2:2830023/1‑101 (MQ=255)
tAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGGTCg > 2:929179/1‑101 (MQ=255)
tAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:3358588/1‑101 (MQ=255)
aaC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATcaa > 2:2212785/1‑99 (MQ=255)
aC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:2293623/101‑1 (MQ=255)
aC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 1:1038922/1‑101 (MQ=255)
|
CTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAC.GTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAA > NC_014034/1395396‑1395596
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 16 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|