Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,961 | A→T | 2.2% | intergenic (+773/‑158) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,961 | 0 | A→T | 2.2% | 5.1 ‑1.7 ‑0.5 | 232 | intergenic (+773/‑158) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/4): ref base (122/102): total (123/109) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.85e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.32e-01 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
AACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAA > NC_014034/1395861‑1396061
|
aaCTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGa < 2:1020171/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGa < 2:3327301/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTgg < 2:2585300/101‑1 (MQ=255)
cgccgcCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGt < 2:3101028/101‑1 (MQ=255)
gccgccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTc < 2:4388267/101‑1 (MQ=255)
gccgccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTc < 2:3685649/101‑1 (MQ=255)
ccgccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGGCg > 2:2622865/1‑101 (MQ=255)
cgccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGc < 1:2010137/101‑1 (MQ=255)
cTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcc > 1:5029718/1‑101 (MQ=255)
cTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcc < 1:2857855/101‑1 (MQ=255)
aTCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcccc < 2:2878121/101‑1 (MQ=255)
aTCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcccc < 1:2928649/101‑1 (MQ=255)
aTCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcccc > 2:31217/1‑101 (MQ=255)
tCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTccccc > 1:3356076/1‑101 (MQ=255)
tCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTccccc < 1:3218710/101‑1 (MQ=255)
tCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTACCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGGCGCTccccc > 1:4492324/1‑101 (MQ=255)
cATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCcgc < 1:976344/101‑1 (MQ=255)
ccGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCggg > 1:3830483/1‑101 (MQ=255)
gAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGGGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCCGTGGCCTGGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCggg > 1:1194560/1‑99 (MQ=38)
gAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:1687840/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:1467214/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGgg > 1:1607112/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:3678662/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:4903467/101‑1 (MQ=255)
gaacaggatgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:4626638/92‑1 (MQ=2)
cgccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:2997020/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1840048/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:2784360/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:1140522/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:4399796/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:1402640/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGACCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:4366721/1‑101 (MQ=255)
ccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:2848561/101‑1 (MQ=255)
acaggatgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:2597771/94‑1 (MQ=2)
gcgcAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 2:29672/101‑1 (MQ=255)
catccatCGCCCCGCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:3500882/7‑101 (MQ=37)
ggatgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGGTCGaaa > 2:328716/5‑101 (MQ=2)
gcAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc > 1:4806706/1‑101 (MQ=255)
gcAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc > 2:2841088/1‑101 (MQ=255)
atgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGGTCGAAAcg > 1:2967903/3‑100 (MQ=2)
aggTCGCGCCACCCGGGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACt < 2:2258586/99‑1 (MQ=255)
tgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAcgg < 1:631125/100‑3 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCt > 2:369610/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCt > 2:464191/1‑101 (MQ=255)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCCCGGGGCCG.GGGTTGGAACCCGCCCTc > 2:1350029/1‑101 (MQ=37)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTGGGGCAGCGGACGGGTCGCCACCCCCGCGGGGGCGTCGATCGAAAGCCGcccac > 2:5027274/1‑99 (MQ=25)
gccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTc < 2:1687711/100‑1 (MQ=255)
cccccccGTGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTc < 1:4363598/100‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGCTCGAAACTCGCCCTCg > 1:837314/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCg > 1:4857594/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCg > 1:4211571/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCg < 1:726125/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgc > 1:2723576/1‑101 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgc > 1:2095565/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgcg > 2:1852836/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCt > 1:3607684/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGAAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCt > 2:4063597/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCtt < 1:2182988/101‑1 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGc < 1:1013914/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGcc > 2:2286639/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCt < 2:56780/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCa > 1:150255/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCAc > 2:3207779/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACg > 2:4415350/1‑101 (MQ=255)
tCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGc < 1:1041999/101‑1 (MQ=255)
gAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCt > 1:3080522/1‑101 (MQ=255)
gAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCt > 1:1292857/1‑101 (MQ=255)
aaaCGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTg > 2:4522897/1‑101 (MQ=255)
cGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCcg > 2:3073563/1‑101 (MQ=255)
gATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCcgc > 1:736143/1‑101 (MQ=255)
aTGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCcgct > 2:4951606/1‑100 (MQ=255)
aTGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCcgcg > 1:1973249/1‑101 (MQ=255)
tGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGt < 1:228689/101‑1 (MQ=255)
gCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTc < 1:4367512/101‑1 (MQ=255)
gCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTc > 1:1197788/1‑101 (MQ=255)
gCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTc < 2:1446199/101‑1 (MQ=255)
cGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCg > 2:544082/1‑101 (MQ=255)
cGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCg > 1:3027118/1‑101 (MQ=255)
gTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGc > 2:816159/1‑101 (MQ=255)
ttCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCt < 2:2017453/101‑1 (MQ=255)
aTGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTccc < 2:731998/101‑1 (MQ=255)
tGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcccc < 1:1766122/101‑1 (MQ=255)
tGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcccc < 1:1852969/101‑1 (MQ=255)
ggCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTccccc > 1:2956853/1‑101 (MQ=255)
ggCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTccccc < 2:4269668/101‑1 (MQ=255)
ggCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTccccc < 2:4211254/101‑1 (MQ=255)
gCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcccccc > 1:2371862/1‑101 (MQ=255)
gCCTACGTCGGGCAGGGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcccccc < 2:3459970/101‑1 (MQ=255)
ccTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCcg < 1:4007528/101‑1 (MQ=255)
ccTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCcg > 2:2674060/1‑101 (MQ=255)
cTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCcgc > 2:4433299/1‑101 (MQ=255)
tACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCcgcg > 1:661131/1‑101 (MQ=255)
cGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCggg > 2:2747184/1‑101 (MQ=255)
gggCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 2:388777/1‑101 (MQ=255)
gggCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg < 2:2166966/101‑1 (MQ=255)
gCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:1632106/1‑101 (MQ=255)
tGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:3501152/101‑1 (MQ=255)
tGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:456814/101‑1 (MQ=255)
tGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1678815/101‑1 (MQ=255)
gACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 1:1595402/101‑1 (MQ=255)
|
AACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAA > NC_014034/1395861‑1396061
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|