Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,412,228 | C→G | 6.2% | C534S (TGT→TCT) | RCAP_rcc01318 ← | outer membrane autotransporter barrel domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,412,228 | 0 | C→G | 6.2% | 25.2 ‑4.6 ‑0.1 | 219 | C534S (TGT→TCT) | RCAP_rcc01318 | outer membrane autotransporter barrel domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/12): ref base (106/99): total (108/111) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.04e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.57e-01 |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GCCCGCGATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGT > NC_014034/1412128‑1412328
|
gCCCGCGATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGac < 2:1657239/101‑1 (MQ=255)
ccGCGATCGGCGGGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGacac < 1:1384361/101‑1 (MQ=255)
ccGCGATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGacac > 2:415279/1‑101 (MQ=255)
gcgATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAg > 2:2497415/1‑101 (MQ=255)
cgATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAgg > 2:4569913/1‑101 (MQ=255)
cgATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAgg > 1:3938252/1‑101 (MQ=255)
tCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCg > 2:767378/1‑101 (MQ=255)
tCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCg > 1:1000303/1‑101 (MQ=255)
cGGCGGGGAGAGGTTTTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGt < 1:5050398/101‑1 (MQ=21)
gcggGGAGAAGGTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGtct < 1:382303/101‑1 (MQ=255)
gcgggtaaGGTCTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGGGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTTCCCGCAAGACACAGGCCGTCTcc < 2:2743945/95‑1 (MQ=21)
gggAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTccc < 1:2035575/100‑1 (MQ=255)
ggAGTAGGTGTTTACCCCCGCCAGGGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTAACCTGCGAAGGTGGTGGACGAAANACACAGGCGCTCTGCcg > 2:1951820/1‑101 (MQ=17)
ggAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCcg > 2:2554223/1‑101 (MQ=255)
gagaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCcgc > 1:3107649/1‑101 (MQ=255)
gagaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCcgc > 1:612905/1‑101 (MQ=255)
gagaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGGCTCCcgc > 1:426491/1‑101 (MQ=255)
agaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCcgcg > 1:3986647/1‑101 (MQ=255)
gaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACNCAGGCCgnnnnnnnnnn > 2:1495492/1‑91 (MQ=255)
gaAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCgg > 2:4781727/1‑101 (MQ=255)
ggTTTTTCCGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCAt < 1:4581705/101‑1 (MQ=255)
ggTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCAt > 2:3718741/1‑101 (MQ=255)
gTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATa > 2:2295294/1‑101 (MQ=255)
gTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATa > 1:1352730/1‑101 (MQ=255)
tCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAg < 2:1418572/101‑1 (MQ=255)
tCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAg > 2:2562437/1‑101 (MQ=255)
tttACGCCCGGCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCGCCCGCGGCATAggt > 1:4364241/1‑101 (MQ=255)
tttACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggt > 1:153210/1‑101 (MQ=255)
ttACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggtg > 2:1053580/1‑101 (MQ=255)
ttACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggtg > 1:3448767/1‑101 (MQ=255)
tACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAggtgg > 2:1312357/1‑101 (MQ=255)
ccccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGc < 2:3078639/100‑1 (MQ=255)
ccccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGc < 1:1946399/100‑1 (MQ=255)
ccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCCCCGCGGTGCCGTCAGCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGccc < 2:5046366/101‑1 (MQ=255)
ccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGccc < 1:2224965/101‑1 (MQ=255)
ccgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGccc < 1:1210012/101‑1 (MQ=255)
cgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCa > 2:4815154/1‑101 (MQ=255)
cgccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCa < 1:2417497/101‑1 (MQ=255)
ccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCAcc > 2:2173399/1‑101 (MQ=255)
ccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCAcc > 1:4677985/1‑101 (MQ=255)
ccAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCAcc < 2:1273697/101‑1 (MQ=255)
cAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACcg > 1:3536561/1‑101 (MQ=255)
gtgtCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCCTAGCTGGTGCCCACcgcg > 2:3371659/1‑101 (MQ=255)
gtgtCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACcgcg < 1:1053690/101‑1 (MQ=255)
gtCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGcc < 2:3198846/101‑1 (MQ=255)
tCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACGGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGccc < 1:39073/101‑1 (MQ=255)
tCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGccc < 2:120700/101‑1 (MQ=255)
tCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGccc < 1:4163904/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgc > 2:600311/1‑101 (MQ=255)
tGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgc < 1:403132/101‑1 (MQ=255)
tGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgc < 2:4403690/101‑1 (MQ=255)
gATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgcg < 2:3422644/101‑1 (MQ=255)
gATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCcgcg < 2:2847130/101‑1 (MQ=255)
aTCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGa > 1:3389058/1‑101 (MQ=255)
tCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGAc < 1:1839425/101‑1 (MQ=255)
cGCCCGAGGTGCGCCCCACGGTGCCGTCAACTGGGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACt < 1:2820620/101‑1 (MQ=255)
cGCCCGAGGTCCGCCCCGGGGTGCCTTAAACTGCGAGGGTGCTGCCCGAAAGACACAGGCCGCCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCCCCGCGCCCGCGACt < 2:1771574/101‑1 (MQ=17)
gCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACtt < 1:3660012/101‑1 (MQ=255)
gCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACtt < 2:1767611/101‑1 (MQ=255)
cccGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTg < 1:4469696/101‑1 (MQ=255)
gAGCTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGGGAAGGTGGTGGCCTCAAGACACAGGCCGTCGCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGc < 2:3992074/101‑1 (MQ=17)
gTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTc > 1:4415379/1‑101 (MQ=255)
tGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCa < 2:4872985/101‑1 (MQ=255)
gcgcACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCaa < 2:3795570/101‑1 (MQ=255)
ccacGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAg < 2:2994249/101‑1 (MQ=255)
cacGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAgg > 2:1365357/1‑101 (MQ=255)
ggTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCt > 2:4297770/1‑101 (MQ=255)
gTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCtt < 1:4570234/101‑1 (MQ=255)
gTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCtt < 2:2596738/101‑1 (MQ=255)
gTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCtt < 2:3634035/101‑1 (MQ=255)
tGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTc < 1:4062108/101‑1 (MQ=255)
tGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTc < 2:1352604/101‑1 (MQ=255)
gCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCg < 1:3402547/101‑1 (MQ=255)
gCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCg > 2:3537848/1‑101 (MQ=255)
gTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAgg > 2:1235080/1‑101 (MQ=255)
tCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGc > 2:3013860/1‑101 (MQ=255)
cAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGcc > 1:1084664/1‑101 (MQ=255)
cAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGcc > 2:2909080/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCa > 2:2212396/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGCCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCa < 2:2449325/101‑1 (MQ=255)
aCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCAc > 1:4912049/1‑101 (MQ=255)
aCTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCAc < 2:3449200/101‑1 (MQ=255)
tGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCt > 2:1672486/1‑101 (MQ=255)
tGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCt < 1:2478686/101‑1 (MQ=255)
gCGAAAGGGGTGCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTg < 2:267995/101‑1 (MQ=9)
cGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTgg > 1:431287/1‑101 (MQ=255)
gAAAGTGGTGCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGc < 2:671848/101‑1 (MQ=9)
aaGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGcc < 1:2695869/101‑1 (MQ=255)
aGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGccc > 2:2098231/1‑101 (MQ=255)
aGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGccc > 1:2915637/1‑101 (MQ=255)
tggtgCCCGCAAGAGACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGca < 1:1156821/101‑2 (MQ=17)
gtgCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAc > 2:4098667/1‑101 (MQ=255)
gtgCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAc > 1:4186795/1‑101 (MQ=255)
gCCCGCAAGACACAGGCCGTCCCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcgg < 1:4815481/101‑1 (MQ=255)
cccGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCCCCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggt < 1:158089/101‑1 (MQ=255)
ccGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtc < 2:437504/101‑1 (MQ=255)
gCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCAcggtcgg > 2:3880464/1‑101 (MQ=255)
aGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGc > 1:4387917/1‑101 (MQ=255)
gACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACAGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGcc < 1:3126981/101‑1 (MQ=255)
cacaGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGt < 1:3004672/101‑1 (MQ=255)
|
GCCCGCGATCGGCGCGGAGAAGGTCTTTACGCCCGCCAGTGTCTGATCGCCCGAGGTGCGCACCACGGTGCCGTCAACTGCGAAGGTGGTGCCCGCAAGACACAGGCCGTCTCCCGCGGCATAGGTGGTGCCCACCGCGCCCGCGACTTGGGCGTCAACATAGGCCTTCGAGGCCACCTGGCCCGCCACGGTCGGTGCCGT > NC_014034/1412128‑1412328
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 19 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|