BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	221,985	G→A	12.3%	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,985	0	G→A	12.3%	191.9 ‑0.6 0.0	665	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (39/43): ref base (299/284): total (338/327)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.57e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1815 total aligned reads displayed.


CTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221885‑222084


gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggggccgtgggatcggtcggg                                                                                                     <  2:4568721‑M1/30‑1 (MQ=255)


    ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                                                                 <  2:2042121‑M1/34‑1 (MQ=255)


       cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcgg                                                                                              <  2:2195739‑M1/37‑4 (MQ=255)


       cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg                                                                                              <  2:2856757‑M1/37‑1 (MQ=255)


        ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggg                                                                                             <  2:3780467‑M1/38‑1 (MQ=255)


          gaccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                           <  1:466489‑M1/40‑1 (MQ=255)


            tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                         >  2:121753/1‑101 (MQ=255)


            ccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                         <  1:3906230‑M1/42‑1 (MQ=255)


            ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                         <  1:4447087‑M1/42‑1 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggttacgt                                                                                       <  2:4129725‑M1/44‑7 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                       <  1:816225‑M1/44‑1 (MQ=255)


                gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                     >  2:4768591‑M1/56‑101 (MQ=255)


                gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                     <  1:497459‑M1/46‑1 (MQ=255)


                 ggatcggtcgggaccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                    <  1:2740576‑M1/47‑1 (MQ=255)


                   gtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                  >  2:3456127‑M1/53‑101 (MQ=255)


                         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                            >  2:920139‑M1/47‑101 (MQ=255)


                          gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                           >  1:266027‑M1/46‑101 (MQ=255)


                           gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                          <  1:1594880/101‑1 (MQ=255)


                               cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                      <  2:1111764‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGatcggc                                                                     <  1:1885760‑M1/62‑2 (MQ=255)


                                cgcTCATGGACGGTGGGCGTCGGATGCTTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                     <  1:215715/101‑1 (MQ=255)


                                  cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                   <  1:4842160/101‑1 (MQ=255)


                                       cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                              >  2:4846033‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                          <  1:490512‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                            ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGggg                                                         <  1:2001979‑M1/74‑1 (MQ=255)


                                             tGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggtgga                                                        >  2:1795041/1‑96 (MQ=255)


                                               tccgtgggatcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                      >  1:3149522‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                     <  2:598041‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                     <  1:611550‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                                 ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggcccg                                                    >  2:1040893/2‑96 (MQ=11)


                                                   tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                  >  1:3720793/1‑101 (MQ=255)


                                                   gcGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                  <  2:3175577/100‑1 (MQ=11)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                 >  1:4033926‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                    cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                 <  1:3350266/101‑1 (MQ=255)


                                                     gcagtgtcgggATCCGTCGCAACGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGATCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                <  2:2284463/93‑1 (MQ=11)


                                                        tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                             >  1:3783326‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                                         cgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                            >  1:3543401‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                                           gggggGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                          <  1:3027107/99‑1 (MQ=11)


                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                          >  1:3498206/1‑101 (MQ=255)


                                                             gggGTCGGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                        <  1:3638579/101‑1 (MQ=11)


                                                              gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                       <  2:1557544‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                              gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                       <  2:240992‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                              ggagccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                       <  2:4669518/95‑1 (MQ=11)


                                                                gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                     <  2:3708140/97‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGTGCGGGACCGCGGGATCCGTGGGATCAGCGGGAtcg                                   >  2:2515758/6‑101 (MQ=14)


                                                                  ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc                                   >  2:1692254‑M1/6‑97 (MQ=255)


                                                                   cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                  >  2:504117‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                                                     tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGgggcgcggcg                                >  1:2087040/3‑94 (MQ=11)


                                                                     tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGAGCCGTggggcccgtg                                >  2:4469331/3‑94 (MQ=11)


                                                                     tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                <  1:3217402‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                                                     tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                >  1:149035‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                     tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                <  1:2316366‑M1/99‑8 (MQ=255)


                                                                     tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                                <  1:1364533/101‑1 (MQ=11)


                                                                     ggggatcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                <  2:4202094/99‑1 (MQ=11)


                                                                      gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                               <  1:3422445‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                      cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                               <  1:2214376/101‑1 (MQ=255)


                                                                       ggcttgttcgggacggtgggatcgctcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgg                              <  2:2952526/94‑1 (MQ=11)


                                                                        ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg                             <  1:124880/96‑1 (MQ=14)


                                                                        gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGTTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga                             <  2:4418604/101‑2 (MQ=11)


                                                                         gtccgtcggttccgtgggatcggtcggctccgtcggatcgGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                            <  2:1310571/97‑1 (MQ=11)


                                                                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                            <  1:2594119/101‑1 (MQ=11)


                                                                         atcgataggttccgtgggatccgtgggatccgtaggCTCGGTCGGGTCCGTAGGATCCGTCGGGTCCGTCGGAACGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                            <  2:3515249/101‑1 (MQ=2)


                                                                          tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                           <  1:4391925/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtggggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                          <  1:2836074/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGGTCGTGGGGTCGGGCGGGAcc                          >  2:4320269/1‑101 (MQ=11)


                                                                           cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                          <  1:1423228/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                          <  1:722874/101‑1 (MQ=11)


                                                                           aggtgggggccgtgggggccgtcgggtccgtgggatcGGTCGGATGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                          <  1:4747158/100‑1 (MQ=11)


                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                        >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                                             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCCGGTGGGTCCGt                        >  1:662047/1‑101 (MQ=11)


                                                                              gcgtggccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTa                       <  2:665355/95‑1 (MQ=11)


                                                                               cgggtcccggggatcggtcgggttcggggggtcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                      <  2:3891675/101‑3 (MQ=11)


                                                                               cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                      <  1:1141956/101‑3 (MQ=11)


                                                                                gggtccgtgggatctgtcaggtccgtgggatcggtcGAATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                     <  2:3370330/101‑1 (MQ=14)


                                                                                gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                     <  2:3057308‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                                gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                     >  1:4537032‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                                 ggcccgggggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGa                    <  2:753989/98‑1 (MQ=11)


                                                                                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGCGGGGGCGGTCGCATCGGCGGGCTCGCTCGGGGCCgcgccgc                   >  2:2694685/1‑95 (MQ=9)


                                                                                  gtccgggggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                   <  1:1784591/101‑1 (MQ=11)


                                                                                  ggacgtgggagcggtggggtccgtggggtgagtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                   <  1:2515932/98‑1 (MQ=11)


                                                                                  acccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                   <  2:1432790/99‑1 (MQ=11)


                                                                                   tgcgtgcggtcggtcgggcccgtgggatccgccggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                  <  2:2764922/99‑1 (MQ=11)


                                                                                      gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg               <  1:955185‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                      gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt               <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                      gtgggatcgggcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt               <  1:1696728/101‑1 (MQ=11)


                                                                                        ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcg             >  1:4298439/1‑101 (MQ=11)


                                                                                        gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGCTCCGTCGGATCGGAGGGGTCCGTGGGGtgggtcg             >  2:3281944/1‑101 (MQ=11)


                                                                                        gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTgggatcggtcg             <  1:4189059‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg            <  2:3600015‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg            <  1:89966‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg            <  2:2593938‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                           atcggtgggatccgtgggatcggccggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCAGGGCCGTGGTATCGGTCGGGGCCGTGGGTtgggtcggcc          >  2:850949/1‑99 (MQ=2)


                                                                                           atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat          >  2:214630‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                                                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGAGGGAGCGgtagggt          >  2:4025208/1‑101 (MQ=11)


                                                                                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt          <  2:4920883‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                                            tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc         >  1:530960‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                                                             cggttggatccgtggggtctgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtcc        <  1:2901002/101‑1 (MQ=14)


                                                                                             cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatcc        >  1:2427144/1‑101 (MQ=11)


                                                                                             cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGggcggatcc        >  1:4128132/1‑101 (MQ=11)


                                                                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg       <  2:1913155‑M2/101‑18 (MQ=255)


CTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGG  >  NC_014034/221885‑222084

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG