BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	221,991	G→C	3.9%	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,991	0	G→C	3.9%	39.5 ‑0.4 0.0	664	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (15/12): ref base (323/313): total (338/326)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.97e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1881 total aligned reads displayed.


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091


tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGCTCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                                      <  2:847576/101‑1 (MQ=255)


  ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                                    <  1:2694421‑M1/38‑1 (MQ=255)


   tggtggTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                                                   >  1:1364565/1‑101 (MQ=255)


   gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcggga                                                                                                   <  2:228891‑M1/39‑1 (MQ=255)


    ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGGCGGATcggtcggggccgtgggatcggtggggtccgtgggat                                                                                                  >  1:3693139/1‑101 (MQ=255)


    atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                                                                  <  2:2596265‑M1/40‑1 (MQ=255)


    atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                                                                  <  2:2699550‑M1/40‑1 (MQ=255)


     tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                                 >  2:1429218‑M1/61‑101 (MQ=255)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                                                                                <  2:3195479‑M1/42‑1 (MQ=255)


        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                              >  2:4876776‑M1/58‑101 (MQ=255)


        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                              <  1:816225‑M1/44‑1 (MQ=255)


         tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                             >  2:3652285‑M1/57‑101 (MQ=255)


         tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                             <  1:4433456‑M1/45‑1 (MQ=255)


          cggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                            <  1:4086794‑M1/46‑1 (MQ=255)


           gggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                           <  1:3767863‑M1/47‑1 (MQ=255)


           ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                           <  1:385676‑M1/47‑1 (MQ=255)


           aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                           >  1:4614581/1‑101 (MQ=255)


               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                       <  2:4690362‑M1/51‑1 (MQ=255)


               cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       <  1:4473983‑M1/51‑1 (MQ=255)


               ccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                       >  1:2089273‑M1/51‑101 (MQ=255)


                  gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                                                    >  1:3407357‑M1/48‑101 (MQ=255)


                  ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                    >  1:2768716/1‑101 (MQ=255)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                                   >  2:920139‑M1/47‑101 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                  >  2:622741‑M1/46‑101 (MQ=255)


                     gggccgtgggctcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                 >  2:3805503‑M1/45‑101 (MQ=255)


                         cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                             <  2:1111764‑M1/61‑1 (MQ=255)


                           tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                           >  2:4948775‑M1/39‑101 (MQ=255)


                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                         >  2:672410‑M1/37‑101 (MQ=255)


                               atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggg                                                                       <  2:2029485‑M1/67‑2 (MQ=255)


                                 ctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  1:2605150‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:3090480‑M1/69‑1 (MQ=255)


                                 cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                     >  2:4433137‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   >  2:750516‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                 <  1:319541‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                        gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                              >  2:3558284‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                          gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                            <  1:1895603/101‑1 (MQ=255)


                                          cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc                                                            <  1:2003114/99‑2 (MQ=11)


                                          ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                            <  1:2253467‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                           >  2:4590517‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                            gTCGGATGCGTGGGCTGGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                          <  2:3318434/101‑1 (MQ=255)


                                             tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                         >  1:4860652‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                  tcggtgtccTCGGTGGGCTCGGTCGTGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                    <  2:1047287/93‑1 (MQ=11)


                                                  tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcgggtc                                                    >  2:2774649‑M1/16‑98 (MQ=255)


                                                   cggTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                   <  2:4481193/99‑1 (MQ=11)


                                                    ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcgagatcggaag                                                  <  1:1250541‑M1/88‑11 (MQ=255)


                                                     gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                 <  1:744277‑M1/89‑1 (MQ=255)


                                                          ggtggggggatgggtcggggccggggggtccgtcgtgcacgggGGGCCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                            <  1:149672/94‑1 (MQ=2)


                                                            gcggggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                          <  1:670406/93‑1 (MQ=11)


                                                            cggtgggATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                          <  2:1520506/101‑1 (MQ=11)


                                                            ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGTGCGGGACCGCGGGATCCGTGGGATCAGCGGGAtcg                                          >  2:2515758/6‑101 (MQ=14)


                                                               tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                       >  2:2413948‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                gggatcggtcgggtgcgtgagatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGTTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                      <  1:2871098/100‑1 (MQ=11)


                                                                gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCNTGGGATCGGCCGGGTCCGCGGGGccggtcg                                      >  1:626167/2‑101 (MQ=11)


                                                                gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                      >  2:4347407‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                                gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                      <  1:1432917‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCtcggtcg                                      <  1:971802‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                     <  2:3948608/101‑1 (MQ=11)


                                                                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgggcgg                                     >  2:478358/1‑101 (MQ=11)


                                                                   gttgggtgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcTGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                   <  1:3525163/94‑3 (MQ=11)


                                                                   gtgtgtcgggtccgtggggtccgtcggttccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                   <  1:1700593/97‑3 (MQ=11)


                                                                   gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                   <  2:3479008/100‑1 (MQ=11)


                                                                   ctcggtcggatccgtgggagcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                   <  2:3735719/100‑3 (MQ=14)


                                                                   atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgcgggAGCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCTGGTCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTAGGATCGGTCaggg                                   >  1:1810722/1‑100 (MQ=11)


                                                                    tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                  <  1:3600286/101‑1 (MQ=11)


                                                                     cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 >  1:2444676/1‑101 (MQ=11)


                                                                     cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                 >  1:1595654/1‑101 (MQ=11)


                                                                      ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATGGGTCGGGTCCg                                >  2:1776999/1‑101 (MQ=11)


                                                                      ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCg                                >  2:505873/1‑101 (MQ=11)


                                                                      ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                >  1:3975612/1‑101 (MQ=11)


                                                                      cgtcagatccctgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                <  2:1687281/94‑1 (MQ=11)


                                                                       gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                               >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                                       gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggattgGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               <  1:3320675/101‑1 (MQ=11)


                                                                       gcgggttccgtggcatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               <  1:4712208/95‑1 (MQ=11)


                                                                        tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATGGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTcggag                              >  2:2882447/1‑97 (MQ=11)


                                                                        tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGCTCGGGCGGGTCGGGGGGATCGGTCGGGCCCGtg                              >  1:2535958/1‑100 (MQ=11)


                                                                         gggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg                             <  2:4162092/97‑3 (MQ=11)


                                                                         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGtgg                             >  2:4254469/1‑99 (MQ=11)


                                                                         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCAGGTCCGTGGGGTCCTTCGGACCCGTGGGATCGGCCGGCTccctgg                             >  1:4242450/1‑97 (MQ=14)


                                                                         cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                             <  1:1141956/101‑3 (MQ=11)


                                                                          ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                            <  2:1902265/98‑1 (MQ=11)


                                                                           gctccgtgggatcggtcgggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                           <  2:3408567/99‑1 (MQ=11)


                                                                               cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg                       >  1:2970609‑M2/1‑93 (MQ=255)


                                                                                gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGTGAtcggc                      >  2:2144962/1‑100 (MQ=11)


                                                                                gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                      <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                 tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc            >  1:4779939/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 ggggatgtgtcgggtccgtgggatctgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                     <  2:3082998/100‑1 (MQ=11)


                                                                                   ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGtcggtcgg                   >  2:2970381/1‑101 (MQ=11)


                                                                                      tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                >  2:4057873‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatcc               >  1:547995‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                                        ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg              >  2:1222591/1‑101 (MQ=11)


                                                                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg              <  1:2356957‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                                         gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCGGGGGGATCGATCGGGTCCGTGGGGTCGgccgggtcggt             >  2:2193405/1‑101 (MQ=11)


                                                                                          tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtc            >  1:900250/1‑101 (MQ=11)


                                                                                          tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc            <  1:4918931/101‑1 (MQ=11)


                                                                                          gcggatccgtaggagcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc            <  1:2172192/100‑1 (MQ=11)


                                                                                            gggtcggtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg          <  1:4164249/101‑1 (MQ=11)


                                                                                            gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg          >  1:4347724/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                  gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt    >  2:1307959/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                   tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc   >  1:3479273/1‑100 (MQ=11)


                                                                                                    gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg  >  1:5023177/1‑99 (MQ=11)


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG