BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,994	A→G	13.4%	D221D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,994	0	A→G	13.4%	230.8 ‑2.2 ‑2.0	741	D221D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (44/56): ref base (339/300): total (384/357)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.06e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.02e-02

Only 100 of 1889 total aligned reads displayed.


TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT  >  NC_014034/221894‑222094


 gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                                     <  1:2157469‑M1/40‑1 (MQ=255)


 atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                                                                     <  2:2699550‑M1/40‑1 (MQ=255)


  tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                                    >  1:2538310‑M1/61‑101 (MQ=255)


        ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                              <  2:4033623‑M1/47‑1 (MQ=255)


            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                          <  1:4600946‑M1/51‑1 (MQ=255)


            cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          >  1:957174‑M1/51‑101 (MQ=255)


             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                         <  1:1345135‑M1/52‑1 (MQ=255)


              gCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                        <  2:2191448/101‑1 (MQ=255)


               tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                       <  1:3752554‑M1/54‑1 (MQ=255)


               tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGATCCGTg                                                                                       >  2:4585709‑M1/48‑101 (MQ=255)


               ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                       <  1:2608176/101‑1 (MQ=255)


                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                                      >  2:920139‑M1/47‑101 (MQ=255)


                      cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcgg                                                                                <  2:4862080‑M1/61‑1 (MQ=255)


                      cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                <  2:1111764‑M1/61‑1 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGatcggc                                                                               <  1:1885760‑M1/62‑2 (MQ=255)


                        tgggatcggtccgatccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                              >  2:841143‑M1/39‑101 (MQ=255)


                           gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                                                           <  2:2978477‑M1/66‑1 (MQ=255)


                           gatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGatcggtcgga                                                                           <  2:4689814‑M1/66‑2 (MQ=255)


                             tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                         >  1:1572893‑M1/34‑101 (MQ=255)


                              cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                        >  2:4433137‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                  gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGtccgggg                                                                    <  2:392777‑M1/73‑4 (MQ=255)


                                   ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGggg                                                                   <  1:2001979‑M1/74‑1 (MQ=255)


                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                 <  1:538029‑M1/76‑1 (MQ=255)


                                      tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                <  1:2448932‑M1/77‑1 (MQ=255)


                                      gccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                >  1:613186‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                       ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                               <  1:3477608‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                        cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                              <  1:4468840‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                        cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                              <  1:4853250‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                         gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             <  2:3407094‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                               tcggtgtccTCGGTGGGCTCGGTCGTGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                       <  2:1047287/93‑1 (MQ=11)


                                               tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcgggtc                                                       >  2:2774649‑M1/16‑98 (MQ=255)


                                                gCGTGGGCTCGGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                      <  2:1221517/101‑1 (MQ=255)


                                                cggtcgttccggtgggATCGGTCGGGCCCTTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      <  2:748397/92‑1 (MQ=11)


                                                cggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      >  1:2978705‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                                     gggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCGGTggg                                                 >  2:3640827/7‑101 (MQ=11)


                                                       gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                               >  1:4697970‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                        tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTAGGGTCGGTGGGATCGGGCGGATCGGTGGGCtc                                              >  2:2884276/7‑101 (MQ=11)


                                                        tccgtgggaccggtcgggtgcgtgggctcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                              <  2:1519918/95‑1 (MQ=11)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGACCCGTGGGAccg                                             >  1:3517043/6‑101 (MQ=11)


                                                         ccgggggatgggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                             <  1:4769152/96‑1 (MQ=11)


                                                          cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACGGTGGGAtcgt                                            >  2:477159/2‑100 (MQ=11)


                                                           gtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                           >  1:3844926‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                                           gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCATGGGCTCGGTCGGGCCCGTGGGGTCCGTGGGAGGCGTGGGAtcggt                                           >  2:4161204/1‑101 (MQ=14)


                                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGGGGGGtcggcg                                          >  2:3543131/3‑99 (MQ=11)


                                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGgggcgcggcg                                          >  1:2087040/3‑94 (MQ=11)


                                                            tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                          >  1:149035‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                            tcggATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                          <  2:608128/101‑1 (MQ=11)


                                                             ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg                                         >  1:5005436/8‑101 (MQ=14)


                                                             gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                         >  2:4347407‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                              ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGAGGGGTCGGGCGGATCCGAGGGGTGGGGCGGTCCGGGGGGGccggtcgg                                        >  2:4478281/1‑101 (MQ=2)


                                                                gtgtgtcgggtccgtggggtccgtcggttccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                      <  1:1700593/97‑3 (MQ=11)


                                                                 tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggggc                                     >  1:357538/1‑99 (MQ=11)


                                                                 tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                     >  1:4162409/1‑101 (MQ=11)


                                                                 tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                     <  2:3311430/101‑1 (MQ=11)


                                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                    <  1:1423228/101‑1 (MQ=11)


                                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                    <  2:1306952/101‑1 (MQ=11)


                                                                  cgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                    <  1:722874/101‑1 (MQ=11)


                                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCg                                   >  1:2781043/1‑101 (MQ=11)


                                                                   gggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgggtcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg                                   <  1:4338844/98‑1 (MQ=11)


                                                                   gggcgcgtccgtcagatccgtcgggtccgtgggatccgtcggGGCCGTGGGAGCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                   <  2:1659295/95‑1 (MQ=11)


                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                  >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCCGGTGGGTCCGt                                  >  1:662047/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gtcggatccgtgggatcggtgggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                  <  2:1888495/101‑1 (MQ=11)


                                                                    ggcgggtccgtgggttgggtcgggtccttgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                  <  1:2877821/99‑1 (MQ=11)


                                                                     tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                 >  2:2514352/1‑100 (MQ=14)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGGGCGGTCGGATCGGTGGGGTCGGGAGGGGCCGtgg                                >  2:3788233/1‑99 (MQ=2)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                <  2:141250/101‑3 (MQ=11)


                                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGtgg                                >  2:4254469/1‑99 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                               <  1:3970645/101‑1 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGCGGGGtcggtcggagacgcggg                               >  2:3724092/1‑92 (MQ=14)


                                                                       gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAgg                               >  1:4084898/1‑101 (MQ=11)


                                                                         ggccgtcggatcggtcggatccggaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                             <  2:4943150/99‑1 (MQ=11)


                                                                          ccggtgggatcggtcgggtccgtgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                            <  2:2286651/98‑1 (MQ=11)


                                                                           ccgtgggttcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                           <  2:3477343/101‑1 (MQ=14)


                                                                           ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                           >  1:4916240‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                           ccgtgggatcggtcagatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTCGGAtcg                           >  1:3108322/1‑101 (MQ=11)


                                                                             gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                         >  1:1246404‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                                             gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                         <  2:2014514‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                             gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                         <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                             gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGCGTCCGTAGGAtcggt                         >  1:4242424/1‑101 (MQ=11)


                                                                              tgggattggtcgggtccgtcgggtccgtcggCTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                        <  2:1766493/101‑1 (MQ=11)


                                                                              tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                        <  1:1798815‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                              ggggatgtgtcgggtccgtgggatctgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                        <  2:3082998/100‑1 (MQ=11)


                                                                                ggtttgatcgtgtccgtggggtctttcggATCCGTGGGATTGGTCGGACCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                      <  1:800239/94‑1 (MQ=11)


                                                                                ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                      <  2:2593938‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                   tcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcggggc                   >  2:2128977/1‑99 (MQ=11)


                                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                  >  1:2699735‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                  >  1:3399131‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                                    cggcggggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                  <  1:2241823/96‑1 (MQ=11)


                                                                                     ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg                 >  1:3678473/1‑101 (MQ=11)


                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                 <  1:2356957‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                                     ggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCgtggggtccg                 >  2:3177552/1‑101 (MQ=11)


                                                                                          ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGgtcgggccggtggga            >  2:2406988/1‑92 (MQ=11)


                                                                                             ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGgccgggtccgtggggtcg         >  2:5049391/1‑100 (MQ=11)


                                                                                              cgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcgggtccg        <  2:670994/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGCCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggcccgtcggatcggcc      >  1:1138227/1‑97 (MQ=11)


                                                                                                 gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcg     <  1:888517‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                                                                                 cggatcggtgggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg     <  1:3196086‑M2/100‑30 (MQ=255)


                                                                                                    atctgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggt  <  1:4418923‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                                    atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt  <  1:3295346/101‑1 (MQ=11)


TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT  >  NC_014034/221894‑222094

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG