BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,997	G→C	12.5%	T220T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,997	0	G→C	12.5%	214.7 ‑0.4 ‑0.1	841	T220T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (52/55): ref base (375/358): total (427/414)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.79e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.14e-01

Only 100 of 1903 total aligned reads displayed.


TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221897‑222097


tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                                      <  1:707563/101‑1 (MQ=255)


ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                                                                                      <  2:3195479‑M1/42‑1 (MQ=255)


    gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                                  <  1:4152941‑M1/46‑1 (MQ=255)


       gtcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                               >  1:2208617‑M1/53‑101 (MQ=255)


       cGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                               >  2:74337/1‑99 (MQ=255)


        nccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGNCGGATc                                                                                              <  1:384141‑M1/50‑1 (MQ=255)


        gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGCCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTc                                                                                              >  1:2679678/1‑101 (MQ=37)


         cggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             >  1:4066612‑M1/51‑101 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                                        >  1:4215095‑M1/46‑101 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                        <  1:2297750‑M1/56‑1 (MQ=255)


                gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      <  1:4456751‑M1/58‑1 (MQ=255)


                  ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                    <  1:1692383‑M1/60‑1 (MQ=255)


                      gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                <  2:4922199‑M1/64‑1 (MQ=255)


                         gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                             >  2:1302528‑M1/35‑101 (MQ=255)


                         aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCgggg                                                                             >  2:3653711/1‑100 (MQ=255)


                           cggtcgggtccgtggcatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           >  2:2774304‑M1/33‑101 (MQ=255)


                           cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                           >  2:4433137‑M1/33‑101 (MQ=255)


                               cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                       <  1:319541‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                    >  2:3558284‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  1:538029‑M1/76‑1 (MQ=255)


                                   gccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   >  1:613186‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                    ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                  <  2:598041‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                    ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                                                                  <  1:1325802‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                    ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  <  1:1240349‑M1/78‑1 (MQ=255)


                                     cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                 <  1:4853250‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                      gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                >  1:3280239‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                      gTCGGATGCGTGGGCTGGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                <  2:3318434/101‑1 (MQ=255)


                                               gtcgcgtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                       >  2:1212920‑M1/13‑101 (MQ=255)


                                                 cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                     <  1:3659073‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                  gtgcccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                    <  1:4320586/95‑1 (MQ=11)


                                                   gttccgcgttatccgtcggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                   <  2:4264860/91‑1 (MQ=14)


                                                    gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                  >  1:4697970‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                     tccgtgggaccggtcgggtgcgtgggctcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                 <  2:1519918/95‑1 (MQ=11)


                                                     tccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                 >  1:1557674‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                      ccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                <  2:2584961/93‑1 (MQ=11)


                                                      ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                <  2:2122335‑M1/96‑1 (MQ=255)


                                                      ccgggggatgggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                <  1:4769152/96‑1 (MQ=11)


                                                      ccctcggcgcggtcggggcccttggagcggccgggcccctgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                                                <  2:836883/92‑2 (MQ=2)


                                                       cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGCCGGTgggcgcgg                                               >  1:1878509/5‑96 (MQ=11)


                                                       cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                               >  2:504117‑M1/5‑101 (MQ=255)


                                                       cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                               <  1:113781‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                         tgggttcgttcgtgtccgtgttatcggtcgggtccgtcgtgCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                             <  2:2282174/96‑1 (MQ=11)


                                                         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGgatccgtggggtccgtg                                             <  1:2427024‑M1/99‑8 (MQ=255)


                                                         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                             >  2:1098996‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                          ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg                                            >  1:5005436/8‑101 (MQ=14)


                                                          gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                            >  1:1399627‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                          cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                            >  2:1405135/1‑101 (MQ=255)


                                                           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                           >  2:2184969/1‑101 (MQ=14)


                                                            gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCggg                                          >  1:3370278/1‑101 (MQ=11)


                                                            gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                          >  2:907900/1‑101 (MQ=11)


                                                             gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                         <  2:3479008/100‑1 (MQ=11)


                                                             ctcggtcggatccgtgggagcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                         <  2:3735719/100‑3 (MQ=14)


                                                             atcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                         <  1:659244/101‑1 (MQ=14)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                       >  1:2522881/1‑101 (MQ=11)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtacgtgcggtCCGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                       <  2:458473/101‑1 (MQ=14)


                                                                ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCg                                      >  2:4476396/1‑101 (MQ=11)


                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                      >  2:4768829/1‑101 (MQ=11)


                                                                gggcgcgtccgtcagatccgtcgggtccgtgggatccgtcggGGCCGTGGGAGCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                      <  2:1659295/95‑1 (MQ=11)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCgg                                     >  2:405038/1‑100 (MQ=14)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                     >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcgGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGGCCGt                                     >  1:940553/1‑101 (MQ=14)


                                                                 gtcggatccgtgggatcggtgggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                     <  2:1888495/101‑1 (MQ=11)


                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                    >  2:2514352/1‑100 (MQ=14)


                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATGGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTcggag                                    >  2:2882447/1‑97 (MQ=11)


                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGTATCGGTCGGGTCCGtg                                    <  1:4414050/101‑2 (MQ=11)


                                                                  gcgtggccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTa                                    <  2:665355/95‑1 (MQ=11)


                                                                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGCGGGGTCCGtgg                                   >  1:3572282/1‑99 (MQ=14)


                                                                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                   <  1:1960936‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                    ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                  <  2:3950923‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                                     ggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGACGGGTCCGGGGGATGGGTGAGGTCCggtgac                                 >  1:351154/1‑96 (MQ=11)


                                                                     gctccgtgggatcggtcgggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                 <  2:3408567/99‑1 (MQ=11)


                                                                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGCGGGGGCGGTCGCATCGGCGGGCTCGCTCGGGGCCgcgccgc                                >  2:2694685/1‑95 (MQ=9)


                                                                      gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                >  1:2856970‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                       tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                               >  1:3083236/1‑101 (MQ=11)


                                                                       tccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                               <  1:1473594/101‑1 (MQ=14)


                                                                        ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                              >  2:2381691‑M2/1‑94 (MQ=255)


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                                                                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg                             >  1:2970609‑M2/1‑93 (MQ=255)


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                                                                               atcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat                       >  1:777200‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                                                tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGACCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtc                      >  1:3746689/1‑101 (MQ=11)


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                                                                                    tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggg                  >  1:4590839/1‑99 (MQ=11)


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                                                                                          ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGTATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg            <  2:1030616/101‑2 (MQ=14)


                                                                                            gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt          >  1:3462484/1‑101 (MQ=14)


                                                                                            gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatccgt          <  1:3964101‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                                             tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgttg         <  2:3825202‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                                                             ggggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTg         <  1:2596446/100‑1 (MQ=11)


                                                                                                  tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc    >  1:2129125‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg  >  2:4164914/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                    ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGGCGGGTCCGTCGGGTCCGGggggtggg  >  2:4347475/1‑96 (MQ=14)


TGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221897‑222097

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG