BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,000	C→G	3.9%	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,000	0	C→G	3.9%	60.2 ‑1.1 ‑0.0	950	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/22): ref base (469/442): total (485/465)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.21e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.80e-01

Only 100 of 1922 total aligned reads displayed.


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100


gcAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                                      <  2:1656611/100‑1 (MQ=255)


  ggatggggtcggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                                    >  2:2944063‑M1/55‑101 (MQ=255)


     tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                                 >  2:2845650‑M1/52‑101 (MQ=255)


     acggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc                                                                                                 >  1:4456007‑M1/52‑101 (MQ=255)


        gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                              <  1:3057008‑M1/53‑1 (MQ=255)


        ggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                              >  1:2035118‑M1/49‑101 (MQ=255)


         tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                             >  2:3056209‑M1/48‑101 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            <  1:3954818‑M1/55‑1 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            <  1:4205932‑M1/55‑1 (MQ=255)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                                           >  1:4978642‑M1/46‑101 (MQ=255)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                                           >  1:266027‑M1/46‑101 (MQ=255)


           ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                           <  1:186593‑M1/56‑1 (MQ=255)


               cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                       <  1:4410823/101‑1 (MQ=255)


                  tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:2689474‑M1/63‑1 (MQ=255)


                  tgggatcggtccgatccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                    >  2:841143‑M1/39‑101 (MQ=255)


                    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  >  2:672410‑M1/37‑101 (MQ=255)


                    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  <  1:2198570‑M1/65‑1 (MQ=255)


                    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  >  1:4682588‑M1/37‑101 (MQ=255)


                      aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCgggg                                                                                >  2:3653711/1‑100 (MQ=255)


                        ccgtgggatccGTCGGGTCCGGGGGATCCGTCGGATCTGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  2:3954526/91‑1 (MQ=11)


                          gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            >  2:3166697‑M1/31‑101 (MQ=255)


                           cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggg                                                                           >  2:1027618/1‑99 (MQ=255)


                              ggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                        >  1:4144233‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                 gcgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                     >  1:521453‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                  ggtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                    >  2:4178339‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                  cGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTgcatcaag                                                                    <  2:1523748/101‑8 (MQ=255)


                                   gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   >  1:2122483‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                    tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtg                                                                  <  2:1759060‑M1/81‑2 (MQ=255)


                                    tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGggtccgtggggtccgtg                                                                  <  1:458538‑M1/81‑8 (MQ=255)


                                          cggtcgttccggtgggATCGGTCGGGCCCTTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                            <  2:748397/92‑1 (MQ=11)


                                          cggTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                            <  2:4481193/99‑1 (MQ=11)


                                            gtcgcgtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                          >  2:1212920‑M1/13‑101 (MQ=255)


                                             tcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                         <  1:4058176‑M1/90‑1 (MQ=255)


                                               gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                       >  2:2362700‑M1/10‑101 (MQ=255)


                                                 gtcggtgggGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                     <  1:1458778/100‑1 (MQ=14)


                                                 gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                     >  1:228925‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                 gctcgggggatctgtcggctccgtgggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     <  2:2460813/94‑1 (MQ=11)


                                                    cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  1:113781‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                    cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACGGTGGGAtcgt                                                  >  2:477159/2‑100 (MQ=11)


                                                     gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCAGTCGGATCCGGGGGTTGGGGTGGATCCGGGGGAtgggg                                                 >  1:1399601/4‑100 (MQ=11)


                                                     gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGCCGGAtcggc                                                 >  1:649753/1‑100 (MQ=11)


                                                     ggcggATGGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                 <  1:192757/99‑1 (MQ=11)


                                                      tgggatcggtgtggtctgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtg                                                <  1:1318688/99‑2 (MQ=11)


                                                      gggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                <  1:3174627/96‑1 (MQ=11)


                                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:8772‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:3498502‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                               <  2:4860325‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                               >  1:2965611‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                                       cggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGAtcggtcg                                               >  1:3562728/1‑101 (MQ=11)


                                                        gggtcgttcggttccgtggggtgcttcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                              <  2:4436682/98‑1 (MQ=11)


                                                        ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGAGCGGTGGGagagggcgg                                              >  2:109858/1‑93 (MQ=14)


                                                         gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                             >  2:907900/1‑101 (MQ=11)


                                                          ctcggtcggatccgtgggagcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                            <  2:3735719/100‑3 (MQ=14)


                                                            tggtccggcccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  2:3386815/100‑1 (MQ=11)


                                                            gtttcgggtccgtgggatcggtcgggtccctcggttcggTGGGGGCCGTGGGCTCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  1:70394/98‑1 (MQ=11)


                                                            cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGGGGGGTGGGGCGGGTcg                                          >  2:2566216/1‑100 (MQ=11)


                                                            cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  2:2742895/101‑1 (MQ=11)


                                                            cgggcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  1:1761178/101‑1 (MQ=11)


                                                            ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTAGAGACCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCAGACGGGtac                                          >  1:1659424/3‑99 (MQ=14)


                                                              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                        >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                              gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcgGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGGCCGt                                        >  1:940553/1‑101 (MQ=14)


                                                               tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCgcg                                       >  2:4683126/1‑99 (MQ=14)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                      <  1:773280/101‑3 (MQ=11)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCgggagcgtgg                                      >  2:3816888/1‑94 (MQ=11)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGGCCGTGGGAACGGACGAGACGGGGGGATCAATGGGGTCGGTGGGTTCGGTGGGATCAGtgg                                      >  2:2005791/1‑99 (MQ=2)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                      >  2:3544767‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                     <  1:2594626/101‑1 (MQ=11)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                     >  1:3817173‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGTCCGTGgg                                     >  1:601151/1‑101 (MQ=11)


                                                                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGTGggct                                   >  2:4587730/1‑99 (MQ=14)


                                                                   gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                   >  1:2856970‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                   ggccgtcggatcggtcggatccggaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                   <  2:4943150/99‑1 (MQ=11)


                                                                    tccgtgggatcggtctgttcctgggggtcggtcggGTCCGTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                  <  1:1239118/101‑1 (MQ=11)


                                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggtgggtc                                  >  2:3477031/1‑94 (MQ=11)


                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                               <  1:3650842‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                               <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGCTCCGTCGGATCGGAGGGGTCCGTGGGGtgggtcg                             >  2:3281944/1‑101 (MQ=11)


                                                                          tgatccgccggggctgtgcgttccgtgggGTCCGTGGCGTCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTGGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtggg                            <  1:4762189/100‑1 (MQ=9)


                                                                          ggggcggtcgggtccgggggatcggtcggAGCCGTGGTATCGGTCGGATCCGTAGGAACGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                            <  1:4314983/97‑1 (MQ=11)


                                                                          ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcgg                            <  2:2276556‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                          ggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgg                            <  2:4280867‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                           gatcgggcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgga                           <  2:2175566/101‑2 (MQ=11)


                                                                            atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat                          <  1:251571‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                             tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtc                         >  2:4057873‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                                             tcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatc                         >  1:3423366‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                                              cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtac                        >  2:2098665/1‑99 (MQ=11)


                                                                              cggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtcc                        >  1:3263663/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 tgggatcggtggggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc                     <  2:4362043/93‑1 (MQ=11)


                                                                                  cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                    <  1:3358554‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                  cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                    >  1:3735997/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggg                  >  2:188193‑M2/1‑79 (MQ=255)


                                                                                    ggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgggt                  >  1:2414122/1‑100 (MQ=11)


                                                                                     atcggtggggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggat                 <  1:4828231/97‑3 (MQ=11)


                                                                                     atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                 >  1:276401/2‑99 (MQ=255)


                                                                                       ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGgccgggtccgtggggtcg               >  2:5049391/1‑100 (MQ=11)


                                                                                         gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggt             <  1:1547391‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                                         gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt             >  2:1423101/1‑101 (MQ=14)


                                                                                         gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt             >  2:1307959/1‑101 (MQ=11)


                                                                                            ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg          <  1:4907258/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                 cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccg     >  2:610933/2‑99 (MQ=11)


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG