BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,012	A→G	5.5%	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,012	0	A→G	5.5%	166.3 ‑0.5 0.0	1718	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (47/53): ref base (803/808): total (855/863)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.07e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2020 total aligned reads displayed.


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112


  tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                    >  1:3385214‑M1/43‑101 (MQ=255)


      tgggatcggtccgatccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                >  2:841143‑M1/39‑101 (MQ=255)


      tgggagcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                >  1:4478601‑M1/39‑101 (MQ=255)


      gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                <  2:2566223/101‑1 (MQ=255)


       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               <  1:214664‑M1/64‑1 (MQ=255)


       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                               <  2:4922199‑M1/64‑1 (MQ=255)


           tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc                                                                                           >  2:5030897‑M1/34‑98 (MQ=255)


            gcgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          >  1:3755557‑M1/33‑101 (MQ=255)


            cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                          <  1:913768‑M1/69‑1 (MQ=255)


             gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                         >  2:4204723/1‑101 (MQ=255)


               tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTg                                                                                       <  2:2948594‑M1/72‑1 (MQ=255)


                gggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGtccgggg                                                                                      <  2:392777‑M1/73‑4 (MQ=255)


                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                      <  1:2786304‑M1/73‑1 (MQ=255)


                cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                      >  2:4409892‑M1/29‑101 (MQ=255)


                     cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTtggggcc                                                                                 >  1:843734/3‑97 (MQ=11)


                     ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg                                                                                 <  1:1325802‑M1/78‑1 (MQ=255)


                          ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg                                                                            >  2:1120016/1‑101 (MQ=255)


                             tccGTGGGGCCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc                                                                         <  2:3056770/99‑1 (MQ=14)


                              cggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                        >  1:2978705‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                  gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                    <  2:592236/101‑3 (MQ=11)


                                  cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                    <  1:755056‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                   gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                   >  2:2362700‑M1/10‑101 (MQ=255)


                                     gctcgggggatctgtcggctccgtgggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                 <  2:2460813/94‑1 (MQ=11)


                                       ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGACCCGTGGGAccg                                                               >  1:3517043/6‑101 (MQ=11)


                                        ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGtcgg                                                              >  2:4466808/1‑101 (MQ=11)


                                        cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGCCGGTgggcgcgg                                                              >  1:1878509/5‑96 (MQ=11)


                                         gtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             >  2:4028417‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                         gtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             >  1:3844926‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                          tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGGGGGGtcggcg                                                            >  2:3543131/3‑99 (MQ=11)


                                          tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                            <  1:3969350/101‑1 (MQ=255)


                                           gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                           <  1:141266‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                           gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcg                                                           <  2:2002970‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGGCCGGGGGATCGGGGGGGTCGGGGGGAtcgtgggggc                                                        >  2:3728284/1‑94 (MQ=11)


                                               tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                       >  1:4162409/1‑101 (MQ=11)


                                                cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      <  1:3477296/101‑1 (MQ=11)


                                                cggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                      <  1:1568020/101‑1 (MQ=11)


                                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      >  2:1328397/1‑101 (MQ=11)


                                                cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      <  2:2742895/101‑1 (MQ=11)


                                                cgggggggttcgtggggtcggtggggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      <  1:3298450/96‑1 (MQ=14)


                                                ccgtcgggtccgttgggtcggtggggtccgggggatcgGTCGTGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      <  2:4852639/99‑1 (MQ=11)


                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                     >  1:1766623/1‑101 (MQ=11)


                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGATCCg                                                     >  2:2172841/1‑101 (MQ=11)


                                                  gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                    >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                  ggcgggtccgtgggttgggtcgggtccttgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                    <  1:2877821/99‑1 (MQ=11)


                                                   tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                   >  2:3796832/1‑100 (MQ=11)


                                                   tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                   >  2:1431502/1‑100 (MQ=11)


                                                   gcgggcgcgtgggatcggtcgggcccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                   <  2:413491/94‑2 (MQ=11)


                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCAGGTCCGTGGGGTCCTTCGGACCCGTGGGATCGGCCGGCTccctgg                                                  >  1:4242450/1‑97 (MQ=14)


                                                    cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                  <  1:1141956/101‑3 (MQ=11)


                                                     gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                 >  1:4628767‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                     ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGgg                                                 >  2:3404295/4‑101 (MQ=11)


                                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                >  1:2451204/1‑101 (MQ=11)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                               >  1:4862697‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                        tccgtgggattggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  1:3687281/101‑1 (MQ=14)


                                                        tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                              >  1:3083236/1‑101 (MQ=11)


                                                         ccgtgggttcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                             <  2:3477343/101‑1 (MQ=14)


                                                           gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                           <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                           gtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtccgg                                           >  2:2274479/1‑98 (MQ=11)


                                                            tgggattggtcgggtccgtcgggtccgtcggCTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                          <  2:1766493/101‑1 (MQ=11)


                                                            tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGCtccgtc                                          >  1:4355637/1‑101 (MQ=11)


                                                             ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGAtcgtgcg                                         >  1:1480797/1‑97 (MQ=11)


                                                             gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                         >  1:626536/1‑101 (MQ=11)


                                                             gggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGACCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtccgtgg                                         >  2:3287245/1‑99 (MQ=11)


                                                              ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgg                                        <  1:2082668‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                ggcggtcggggccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                      <  1:1948654/99‑3 (MQ=11)


                                                                atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                      <  1:2702138‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                  cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatcc                                    >  1:547995‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                   ggtcgtgtccgtgggaccgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                   <  2:1052719/101‑1 (MQ=11)


                                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                   <  1:2356957‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCCCTGGGAtcggtccgcaccgt                                  >  1:985633/1‑93 (MQ=11)


                                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                  <  1:2537986‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                     tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                 <  1:2240310‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                     tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                 <  2:2854624‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                       gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgtagg                               <  2:1531186/101‑1 (MQ=2)


                                                                       gggggcgtggggttcgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                               <  1:3593690/96‑1 (MQ=11)


                                                                         gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                             >  2:4561036‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                            cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                          >  1:673417/1‑101 (MQ=14)


                                                                            cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCCTGGGGTCGgtcggggccgtggggaagt                          >  2:4759017/1‑97 (MQ=11)


                                                                             gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggc                         <  1:4729088‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                                             gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGGCCGGGGGATGGgtcgggtcggtcggatcggc                         >  2:659155/1‑98 (MQ=11)


                                                                               gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                       >  1:5023177/1‑99 (MQ=11)


                                                                               cggatcggtgggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                       <  1:3196086‑M2/100‑30 (MQ=255)


                                                                                ggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtggttcgg                      >  2:18801/1‑94 (MQ=11)


                                                                                ggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                      >  2:3172465/1‑101 (MQ=17)


                                                                                gctgccgtcgtATCCGTCGGATCGGTCGGCTCCGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                      <  2:2669122/95‑1 (MQ=11)


                                                                                  gcgcggaagATCCGTGGGGTAGGTGGGGTGCGTGGGAGGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                    <  1:2608537/93‑1 (MQ=2)


                                                                                  atctgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggt                    <  1:4418923‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                  atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggt                    >  2:4669019/1‑99 (MQ=11)


                                                                                   tcggtcggGGCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                   >  1:1242705‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                                                                     ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg                 <  2:1665390‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                                                      gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAGCGGTCGGGTTCGCCGGGTCCGTGGGAtcggt                >  1:1670605/4‑101 (MQ=14)


                                                                                      gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgg                >  2:722785/1‑98 (MQ=11)


                                                                                       gggggtCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg               >  1:4930851‑M2/3‑64 (MQ=255)


                                                                                          ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg            >  2:365174/3‑100 (MQ=14)


                                                                                            tcctgggtatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc          >  2:2095840‑M2/6‑59 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc          >  1:4793778‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                                              cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg        <  2:903777‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                                               gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatacgtgggatcgat       <  2:1239001‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                                 gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtctgtcgggtccgtgggatcggtcg     <  2:4306646‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                                 cggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg     <  1:4086794‑M2/100‑48 (MQ=255)


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT  >  NC_014034/221912‑222112

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG