BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,015	G→C	7.5%	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,015	0	G→C	7.5%	237.0 ‑1.9 0.0	1657	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (72/59): ref base (731/786): total (808/849)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.45e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2043 total aligned reads displayed.


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115


  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  1:3613150‑M1/62‑1 (MQ=255)


  cgcTCATGGACGGTGGGCGTCGGATGCTTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  1:215715/101‑1 (MQ=255)


        tcggtcgggtccgtgggatcggtctggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              >  2:1053442‑M1/34‑101 (MQ=255)


        tcggtcgcttccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              >  2:839510‑M1/34‑101 (MQ=255)


            tcgggttcgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                          >  1:3199198‑M1/30‑101 (MQ=255)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         <  1:2786304‑M1/73‑1 (MQ=255)


             cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                         >  2:1885623‑M1/29‑101 (MQ=255)


             cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         <  2:3947552‑M1/73‑1 (MQ=255)


                 tcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtc                                                                                     <  1:435763/98‑1 (MQ=11)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     <  1:2448932‑M1/77‑1 (MQ=255)


                  ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    >  1:2882660‑M1/24‑101 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   >  2:2180937‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                ggagccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                      <  2:4669518/95‑1 (MQ=11)


                                  gtgcgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    >  1:3528907‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                  gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  1:546986/97‑1 (MQ=11)


                                  gtccgggggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                                    <  1:1676950/94‑1 (MQ=11)


                                   tccggcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                   <  1:3705485/96‑1 (MQ=11)


                                   gcggggggaccggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  1:2085198/95‑1 (MQ=14)


                                     cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGCCGGTgggcgcgg                                                                 >  1:1878509/5‑96 (MQ=11)


                                      gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                >  1:674405/4‑101 (MQ=11)


                                      gggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                <  1:1776896/98‑1 (MQ=11)


                                       tgggttcgttcgtgtccgtgttatcggtcgggtccgtcgtgCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:2282174/96‑1 (MQ=11)


                                         ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAtcgggcgg                                                             >  2:250127/1‑101 (MQ=11)


                                           agcggtcgggcccgtgggttcggtggggggcgtggggtCGGTCGGGTCCCTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                           <  1:4714244/99‑3 (MQ=9)


                                            tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTc                                                          >  1:3772286/1‑101 (MQ=11)


                                            tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          <  2:1240232/101‑1 (MQ=11)


                                             gggcgcgggccgtgggctcgggccggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  2:4213338/92‑1 (MQ=11)


                                             cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                         <  1:759189/101‑1 (MQ=14)


                                             cggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                         <  1:1568020/101‑1 (MQ=11)


                                             cggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcg                                                         >  2:2870885/1‑100 (MQ=11)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGGTCGTGGGGTCGGGCGGGAcc                                                         >  2:4320269/1‑101 (MQ=11)


                                             cgctcgggtccgtgagatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:4141322/98‑1 (MQ=11)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                        <  2:3077558/101‑1 (MQ=14)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggatacg                                                        >  2:1543940/1‑96 (MQ=11)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                       >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                      >  2:3796832/1‑100 (MQ=11)


                                                tcggatccgtgggatctgtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                      <  2:4468521/101‑2 (MQ=11)


                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                     <  1:1474486‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTgg                                                     <  2:1776028‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                  gggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                    >  1:4603595‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTGGGGTCCGTGgg                                                    >  2:3298188/1‑101 (MQ=11)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                    >  1:348084/1‑101 (MQ=11)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                    >  1:916030/1‑101 (MQ=11)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGCGGGGtcggtcggagacgcggg                                                    >  2:3724092/1‑92 (MQ=14)


                                                  ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGgg                                                    >  2:3404295/4‑101 (MQ=11)


                                                   gtggcgttggattggtcgggtccgtcgcatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                   <  2:2119284/97‑1 (MQ=11)


                                                   gggacgtgggctcggtctggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                   <  2:653232/97‑1 (MQ=11)


                                                    acccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                  <  2:1432790/99‑1 (MQ=11)


                                                     tccgtggtatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                 <  2:3650034/101‑1 (MQ=11)


                                                      ccgtgggttcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                <  2:3477343/101‑1 (MQ=14)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                <  2:441502/101‑1 (MQ=14)


                                                       cgggggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                               <  1:4862407/98‑1 (MQ=11)


                                                        gtggggtgggtcggacacgtgggatcggtcggCCCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                              <  2:2014376/101‑1 (MQ=11)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                              >  1:1246404‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                        gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                              <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                            <  1:2346339‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg                                   >  2:2953171/1‑101 (MQ=11)


                                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                            >  1:626536/1‑101 (MQ=11)


                                                           ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                           <  2:2593938‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                             gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                         >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)


                                                             ggcggtcggggccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                         <  1:1948654/99‑3 (MQ=11)


                                                             atcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggg                                         >  1:4103212/1‑100 (MQ=11)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc                                       <  1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                ggtggggtccgtgggatcggtcggGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                      >  2:2694236‑M2/1‑84 (MQ=255)


                                                                ggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCgtggggtccg                                      >  2:3177552/1‑101 (MQ=11)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCCCTGGGAtcggtccgcaccgt                                     >  1:985633/1‑93 (MQ=11)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                     <  1:2537986‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                  tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                    <  1:2240310‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                  tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc                                    <  1:4918931/101‑1 (MQ=11)


                                                                   cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                                   <  1:849334‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                     gatccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga                                 <  1:3401630‑M2/99‑23 (MQ=255)


                                                                        ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcg                              <  2:1679913‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                        ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                              <  1:4008036/101‑1 (MQ=11)


                                                                         cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCCTGGGGTCGgtcggggccgtggggaagt                             >  2:4759017/1‑97 (MQ=11)


                                                                          gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCCGTggggtccgtcggggccgt                            >  1:425821/4‑101 (MQ=11)


                                                                           tggggtccggcggACCCGTGTGATCGGTAGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTcggatccgtgggatcggtc                           <  2:576010/101‑2 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                          >  2:5016845/1‑99 (MQ=11)


                                                                              gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcggggccgtgggatcggtcggg                        <  2:4568721‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                                               gtccgtcggaTCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                       >  2:4031667‑M2/2‑69 (MQ=255)


                                                                               gcgcggaagATCCGTGGGGTAGGTGGGGTGCGTGGGAGGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                       <  1:2608537/93‑1 (MQ=2)


                                                                               atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggc                       >  2:4918604/1‑99 (MQ=11)


                                                                                tccgggggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                      <  1:1143651/95‑1 (MQ=14)


                                                                                 ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGAtcg                     >  2:2392085/6‑101 (MQ=14)


                                                                                 ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                     <  2:89956/99‑2 (MQ=11)


                                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtacgg                   <  2:1136382‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                                    tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtg                  >  2:484697/1‑100 (MQ=14)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                 <  1:3300812/101‑3 (MQ=11)


                                                                                      gggtcggTGGGGTCCATCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                <  2:2767931/95‑1 (MQ=17)


                                                                                      ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                >  1:4787231/1‑101 (MQ=11)


                                                                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg                >  1:5006197/1‑101 (MQ=11)


                                                                                       ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggacggg               >  2:1334814/3‑100 (MQ=14)


                                                                                        gtcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat              >  1:3084522‑M2/2‑60 (MQ=255)


                                                                                          ccGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATcg            <  1:4165231/101‑2 (MQ=11)


                                                                                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggt          <  1:3888642‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                            gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggt          <  1:2702492‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                             tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg         >  1:4474281/1‑101 (MQ=14)


                                                                                              aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg        >  1:2982025/2‑99 (MQ=14)


                                                                                                  tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatc    >  1:442939‑M2/1‑50 (MQ=255)


                                                                                                   cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGGtcg   >  2:3530283/1‑101 (MQ=14)


                                                                                                    ggtcggGTCCGTGGGATCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg  <  1:1406813‑M2/101‑54 (MQ=255)


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG