BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,021	G→A	25.5%	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,021	0	G→A	25.5%	0.0 ‑2.5 0.0	1703	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (190/245): ref base (615/650): total (805/898)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.44e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2069 total aligned reads displayed.


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121


  tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  1:1572893‑M1/34‑101 (MQ=255)


  tcggtcgcttccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  2:839510‑M1/34‑101 (MQ=255)


   gcgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   >  1:3755557‑M1/33‑101 (MQ=255)


   cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                   >  2:4629549‑M1/33‑101 (MQ=255)


    ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                                  >  2:3051721‑M1/32‑101 (MQ=255)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                              >  1:4914979‑M1/28‑101 (MQ=255)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                              >  2:1655832‑M1/28‑101 (MQ=255)


         ggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                             >  1:4144233‑M1/27‑101 (MQ=255)


           tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                           >  1:4674536‑M1/25‑101 (MQ=255)


            gcgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                          >  1:521453‑M1/24‑101 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                         >  2:2180937‑M1/23‑101 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        >  1:1688614‑M1/22‑101 (MQ=255)


               ggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                       >  1:3594718‑M1/21‑101 (MQ=255)


                 ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcgg                                                                                     >  2:1120016/1‑101 (MQ=255)


                     cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                 <  1:2362864‑M1/87‑1 (MQ=255)


                     cggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                 <  1:2609599‑M1/87‑1 (MQ=255)


                      cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcggggccg                                                                                >  2:4365585/1‑96 (MQ=11)


                         cgggtcggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                             <  2:4441499/97‑1 (MQ=11)


                           gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGT.GGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                          <  1:611012/93‑1 (MQ=11)


                           gatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                           <  2:3446279‑M1/93‑1 (MQ=255)


                             tccgtgggaccggtcgggtgcgtgggctcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                         <  2:1519918/95‑1 (MQ=11)


                             gccgtggggtcggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                         <  2:3166255/92‑1 (MQ=11)


                               cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGCCGGTgggcgcgg                                                                       >  1:1878509/5‑96 (MQ=11)


                                 tgggttcgttcgtgtccgtgttatcggtcgggtccgtcgtgCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                     <  2:2282174/96‑1 (MQ=11)


                                  ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGGtcggtcg                                                                    >  2:4061024/8‑101 (MQ=11)


                                  gggatcggtcgggtgcgtgagatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGTTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                    <  1:2871098/100‑1 (MQ=11)


                                    ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                  <  1:124880/96‑1 (MQ=14)


                                    gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCggg                                                                  >  1:3370278/1‑101 (MQ=11)


                                    gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                                                  >  2:907900/1‑101 (MQ=11)


                                     gtccgtcggttccgtgggatcggtcggctccgtcggatcgGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                 <  2:1310571/97‑1 (MQ=11)


                                     atcgataggttccgtgggatccgtgggatccgtaggCTCGGTCGGGTCCGTAGGATCCGTCGGGTCCGTCGGAACGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                 <  2:3515249/101‑1 (MQ=2)


                                      gccgccgggtccgtgggatcggtagggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                <  2:4823231/96‑1 (MQ=14)


                                       cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               <  1:3477296/101‑1 (MQ=11)


                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                               >  2:583967/1‑101 (MQ=11)


                                       cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               <  2:2742895/101‑1 (MQ=11)


                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCg                                                              >  1:2781043/1‑101 (MQ=11)


                                         gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGTCCGGTGGGTCCGt                                                             >  1:662047/1‑101 (MQ=11)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGtgg                                                           >  2:719818/1‑99 (MQ=14)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                          <  2:174852/101‑1 (MQ=11)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGACGCGTCTGTGCGCTCGACCGGGCCCGtgga                                                          >  1:1964793/1‑98 (MQ=2)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGCATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                         >  1:3520995/1‑101 (MQ=11)


                                             gggacgtgggctcggtctggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                         <  2:653232/97‑1 (MQ=11)


                                              gcccgtgggaccggtcgggtccctcaagtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                        <  2:4536010/99‑1 (MQ=11)


                                               tccgtgggattggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                       <  1:3687281/101‑1 (MQ=14)


                                               gccgtggggtcgttgggttccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                       <  1:2456107/100‑1 (MQ=14)


                                                gggtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                      >  1:4980849‑M2/3‑94 (MQ=255)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                      >  2:2381691‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGAtcg                                                      >  2:3970353/1‑101 (MQ=11)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                      >  1:2265021‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                 cgtggggccgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGAGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                     <  2:3612879/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtgggttcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                    <  2:3368208/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtggggtgggtcggacacgtgggatcggtcggCCCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                    <  2:2014376/101‑1 (MQ=11)


                                                  gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                    <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAgcggtcg                                                  >  2:4915913/1‑101 (MQ=14)


                                                    gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcgggcg                                                  >  2:4181146/1‑101 (MQ=11)


                                                     tgatccgccggggctgtgcgttccgtgggGTCCGTGGCGTCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTGGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtggg                                                 <  1:4762189/100‑1 (MQ=9)


                                                     ggatcggccgggtcggtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                 <  2:2108268/101‑1 (MQ=11)


                                                       atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                               <  1:2702138‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                         cggtggggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                             >  1:4061327‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                         cggtcgggtccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                                             >  1:3962217‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                          ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                            <  1:4410211‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                          cgtcgggtccggggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtgggatccg                                            <  2:4736538/100‑1 (MQ=11)


                                                           gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                           <  1:2537986‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                           gtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcggt                                           >  2:3267742/1‑101 (MQ=11)


                                                            tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtc                                          >  1:900250/1‑101 (MQ=11)


                                                            gcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                          <  1:4312772/100‑2 (MQ=11)


                                                            gcggatccgtaggagcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                          <  1:2172192/100‑1 (MQ=11)


                                                             ggggtcggtgggatccgtgggATCGGTGGGATCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtag                                         <  1:1490606/100‑3 (MQ=11)


                                                             cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcg                                         <  2:4286105‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                               ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggg                                       >  2:188193‑M2/1‑79 (MQ=255)


                                                                gtgcgtgggatgggtcggATGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgggat                                      <  1:747287/98‑3 (MQ=11)


                                                                atcggtggggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggat                                      <  1:4828231/97‑3 (MQ=11)


                                                                  ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                    <  1:1778199‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                    gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                  >  2:1423101/1‑101 (MQ=14)


                                                                      gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcg                                <  1:1062320‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                                                       gctgccgtcgtATCCGTCGGATCGGTCGGCTCCGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                               <  2:2669122/95‑1 (MQ=11)


                                                                         atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt                             <  1:3295346/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                           >  2:3879459‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagggtcc                           <  1:839612‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                                            ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                          >  2:3705207/1‑101 (MQ=14)


                                                                              tcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGGtccgtg                        >  1:1146235/1‑100 (MQ=11)


                                                                                ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                      <  1:3190694/101‑1 (MQ=1)


                                                                                ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg                      >  2:1047356/1‑101 (MQ=11)


                                                                                   tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                   >  2:1234570‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                                                     cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                 <  2:5001968/101‑1 (MQ=14)


                                                                                      gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                <  2:2472893‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                       tcggATCGGTGGGGTCCGGGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTAGGATCGGTCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg               <  1:421082/99‑1 (MQ=18)


                                                                                         ggatggggtcggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg             >  2:2944063‑M2/11‑53 (MQ=255)


                                                                                          ggtccggggggTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa            <  1:1328632/93‑1 (MQ=18)


                                                                                            tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatc          >  2:2845650‑M2/1‑50 (MQ=255)


                                                                                            nccgtcggatcCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggncggatc          <  1:384141‑M2/98‑52 (MQ=255)


                                                                                            acggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatc          >  1:4456007‑M2/2‑50 (MQ=255)


                                                                                             cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc         >  1:957174‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                                                             ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc         >  1:2089273‑M2/3‑49 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggGTCCGTGGGATCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg        <  1:1406813‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                               gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgt       <  1:3077796‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                                                                tctggTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGACCCGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc      <  2:3770238/98‑1 (MQ=14)


                                                                                                tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg      <  1:2971776‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                                                    gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt  <  1:4569042/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                    gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggt  >  2:2583510‑M2/1‑42 (MQ=255)


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG