BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,027	G→C	12.1%	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,027	0	G→C	12.1%	0.0 ‑1.1 0.0	1706	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (86/119): ref base (675/803): total (777/929)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.31e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2096 total aligned reads displayed.


CGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221927‑222127


     tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 >  2:3883834‑M1/25‑101 (MQ=255)


      tcgggggatccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                >  2:2451030‑M1/24‑101 (MQ=255)


      cggtgggatgggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                >  2:4744996‑M1/24‑101 (MQ=255)


      cggTCGGGTCCGTGGGATGTGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcc                                                                                                <  1:4303634/99‑2 (MQ=11)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                <  1:3477608‑M1/78‑1 (MQ=255)


        gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                              <  2:3149271‑M1/80‑1 (MQ=255)


        gtgagatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                              >  2:1275418‑M1/22‑101 (MQ=255)


        gcgtgccccctGGGCTAGGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                              <  2:1088987/91‑1 (MQ=11)


               gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                       <  2:3432393/101‑1 (MQ=255)


               cgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                       >  2:1599804‑M1/15‑101 (MQ=255)


                ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                      >  2:2710839‑M1/14‑101 (MQ=255)


                ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcgagatcggaag                                                                                      <  1:1250541‑M1/88‑11 (MQ=255)


                cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                      >  1:2969496/1‑101 (MQ=1)


                 gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     >  2:2899846‑M1/13‑101 (MQ=255)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGTTGGGAACCGCGGGATCCGTgg                                                                                   >  2:1700463/11‑101 (MQ=11)


                   cgggtccgtgGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                   >  2:2253312‑M1/11‑101 (MQ=255)


                     gatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                 >  2:4824913/3‑101 (MQ=11)


                       tccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                               >  1:1557674‑M1/7‑101 (MQ=255)


                        tggtggtatcgctggggtccgtggggttcgttggatccgtcggATCGGACGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                              <  2:4182221/94‑1 (MQ=11)


                        ccctcggcgcggtcggggcccttggagcggccgggcccctgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                                                                              <  2:836883/92‑2 (MQ=2)


                         cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                                             >  1:3701608‑M1/5‑96 (MQ=255)


                          gtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTGGGATCCGGGGGTtcggt                                                                            >  1:4058956/10‑101 (MQ=11)


                          gtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                            >  1:3844926‑M1/4‑101 (MQ=255)


                           tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                           >  1:2598676‑M1/3‑101 (MQ=255)


                           tgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                           >  1:2434975‑M1/3‑101 (MQ=255)


                            gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGGtcggtcg                                                                          >  2:1834129/2‑101 (MQ=11)


                            gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          <  1:8772‑M1/100‑1 (MQ=255)


                            cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          <  1:2214376/101‑1 (MQ=255)


                            cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg                                                                          >  1:2336405/1‑101 (MQ=14)


                             ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                         <  1:2867614/101‑1 (MQ=11)


                              gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCggg                                                                        >  2:907900/1‑101 (MQ=11)


                                tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                      <  1:3600286/101‑1 (MQ=11)


                                 gtttcgggtccgtgggatcggtcgggtccctcggttcggTGGGGGCCGTGGGCTCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:70394/98‑1 (MQ=11)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  1:2522881/1‑101 (MQ=11)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                     >  2:583967/1‑101 (MQ=11)


                                 cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATcg                                                                     >  1:3771302/1‑100 (MQ=11)


                                 cgggggggttcgtggggtcggtggggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:3298450/96‑1 (MQ=14)


                                 cgggcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:1761178/101‑1 (MQ=11)


                                 ccgtcggtgccttgggataggtcggggccgtgggatcgGTCGGATCCGCGGGATCGGCCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:116477/99‑1 (MQ=14)


                                 aggtgggggccgtgggggccgtcgggtccgtgggatcGGTCGGATGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:4747158/100‑1 (MQ=11)


                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTcgg                                                                    >  2:3507528/1‑99 (MQ=17)


                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGAAGGAGCGGGTCCg                                                                    >  2:1009283/1‑101 (MQ=11)


                                   ggcggggccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                   <  1:4452379/99‑1 (MQ=14)


                                     gggggcggtgggatcggtcggagccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAg                                                                 <  1:937970/94‑1 (MQ=11)


                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGgg                                                                >  2:2803356/1‑101 (MQ=11)


                                      ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                >  2:4451843/4‑101 (MQ=11)


                                       gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                               >  1:5049721‑M2/3‑97 (MQ=255)


                                        gtccgttggggccgtccggtgcgtgggctcggttggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              <  2:3352825/101‑1 (MQ=11)


                                        gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGAt                                                              >  2:1462999/1‑101 (MQ=11)


                                         tccgggggatgggtcgggtccttgggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                             <  1:636589/101‑1 (MQ=14)


                                            gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                          <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                             tgggatcgggcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                         <  1:1399991/101‑1 (MQ=11)


                                              tggatcggtcgggtgcgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                        <  1:584046/100‑1 (MQ=14)


                                              gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                        <  1:2054153‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                               ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                       <  2:3600015‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                 gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                     >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)


                                                 atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat                                                     >  2:214630‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                 atcggtcggggccgtggggtccggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                                     <  2:3772001/101‑3 (MQ=11)


                                                   cggtcgggtccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                                                   >  1:3962217‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccg                                                  >  2:2537805‑M2/1‑84 (MQ=255)


                                                    ggtcgcgcccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg                                                  <  2:2636117/101‑1 (MQ=11)


                                                      tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtg                                                >  1:2768133/1‑100 (MQ=11)


                                                       ggggtccgtgggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                               <  2:3988071/100‑1 (MQ=11)


                                                       ggggtccgtgggaccggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                                               >  1:2145110‑M2/2‑81 (MQ=255)


                                                       cgggtccgtcggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcg                                               >  2:4298121‑M2/1‑81 (MQ=255)


                                                        gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                              <  1:4667223/101‑1 (MQ=11)


                                                        ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                              >  2:4646560/4‑101 (MQ=11)


                                                           tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtc                                           <  1:495672‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                                ggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcg                                      >  1:4809186/1‑99 (MQ=11)


                                                                gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcgggcg                                      >  1:789262/1‑96 (MQ=11)


                                                                 ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                     >  1:4141639/1‑101 (MQ=14)


                                                                   atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggc                                   <  1:1067678‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                    gccgtgggATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                  <  1:1934419/95‑1 (MQ=14)


                                                                     cggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcagcgcg                                 <  2:2082484/101‑8 (MQ=11)


                                                                      ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                >  2:3705207/1‑101 (MQ=14)


                                                                       gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAGCGGTCGGGTTCGCCGGGTCCGTGGGAtcggt                               >  1:1670605/4‑101 (MQ=14)


                                                                       gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg                               <  1:4558628‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                                         gggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  1:4400442/2‑101 (MQ=17)


                                                                          gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                            <  2:1185449/98‑1 (MQ=14)


                                                                          ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                            <  2:649501‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                                            aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                          <  1:3057546/101‑1 (MQ=11)


                                                                            aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                          <  2:4084595/101‑1 (MQ=11)


                                                                               cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcgg                       <  1:4899009‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                               cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                       <  2:5001968/101‑1 (MQ=14)


                                                                                 tGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                     >  2:4917496‑M2/1‑55 (MQ=255)


                                                                                  cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGATCCGGgg                    >  1:2696781/2‑101 (MQ=17)


                                                                                     aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggat                 >  2:2356793‑M2/1‑51 (MQ=255)


                                                                                        ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg              <  2:138553‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                         gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt             >  2:1934282/1‑101 (MQ=17)


                                                                                         ggggggTCCGGCGGATCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgt             <  1:1477719/98‑1 (MQ=11)


                                                                                          tggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc            <  1:3524548/99‑1 (MQ=255)


                                                                                           cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg           <  1:4205932‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                                                            gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgggcgg          >  2:3021479/1‑101 (MQ=255)


                                                                                            gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggg          >  1:3177803‑M2/1‑44 (MQ=255)


                                                                                            ggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg          <  1:186593‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                              gTCCGTTGGTGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt        <  2:3257520/101‑1 (MQ=17)


                                                                                               tCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc       <  1:1330441/101‑1 (MQ=17)


                                                                                               tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc       >  1:3385214‑M2/1‑41 (MQ=255)


                                                                                                 cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg     >  2:4382459/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                   tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta   >  2:4544349/1‑100 (MQ=17)


CGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221927‑222127

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG