BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,045	G→C	6.6%	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,045	0	G→C	6.6%	195.8 ‑0.9 0.0	1631	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (41/65): ref base (631/837): total (703/928)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.17e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2166 total aligned reads displayed.


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145


   ggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGa                                                                                                   >  1:2790264/6‑101 (MQ=11)


   gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGT.GGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                  <  1:611012/93‑1 (MQ=11)


    gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGAACCGTGGGAt                                                                                                  >  1:2157639/8‑101 (MQ=11)


    gtccgggggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                  <  1:1676950/94‑1 (MQ=11)


     gcggggggaccggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 <  1:2085198/95‑1 (MQ=14)


      ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                >  2:175003‑M1/6‑101 (MQ=255)


      ccgggggatgggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                <  1:4769152/96‑1 (MQ=11)


       ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcgg                                                                                               >  1:4327192/1‑101 (MQ=11)


       cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGCCGGTgggcgcgg                                                                                               >  1:1878509/5‑96 (MQ=11)


         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                             >  2:2413948‑M1/3‑101 (MQ=255)


         tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                             >  1:1253057‑M1/3‑101 (MQ=255)


         nnnnnnnnnncgggtccntgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  2:1336348/91‑1 (MQ=11)


          ggggtcggttgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            <  1:960996/97‑1 (MQ=11)


          cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            >  1:3631390/1‑101 (MQ=255)


           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           >  2:2178037/1‑101 (MQ=14)


             gtctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                         <  1:1568596/97‑3 (MQ=14)


             atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGATCGGTGGGGTCCGTGgggc                                                                                         >  2:2104037/1‑100 (MQ=11)


              tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc                                                                                        <  2:584808/101‑1 (MQ=11)


              gcgctgcgctccgtgtgatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                        <  2:3746411/92‑1 (MQ=14)


               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       >  1:2444676/1‑101 (MQ=11)


               ccgtcggtgccttgggataggtcggggccgtgggatcgGTCGGATCCGCGGGATCGGCCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       <  1:116477/99‑1 (MQ=14)


                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                      >  1:1766623/1‑101 (MQ=11)


                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggattgGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     <  1:3320675/101‑1 (MQ=11)


                  gcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                                                    <  2:1138113/100‑2 (MQ=11)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                   <  1:4473456‑M2/101‑3 (MQ=255)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                   <  1:1474486‑M2/101‑3 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                  <  2:3057308‑M2/101‑4 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatctgtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                  <  2:4470923/101‑1 (MQ=11)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGACGCGTCTGTGCGCTCGACCGGGCCCGtgga                                                                                  >  1:1964793/1‑98 (MQ=2)


                    gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAgg                                                                                  >  1:4084898/1‑101 (MQ=11)


                     gggacgtgggctcggtctggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                 <  2:653232/97‑1 (MQ=11)


                     gctccgtgggatcggtcgggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                 <  2:3408567/99‑1 (MQ=11)


                      gtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                                                >  1:4690685‑M2/1‑96 (MQ=255)


                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggt                                                                                <  1:4414714‑M2/101‑6 (MQ=255)


                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat                                                                                <  2:366601‑M2/101‑6 (MQ=255)


                      acccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                <  2:1432790/99‑1 (MQ=11)


                       ccggtgggatcggtcgggtccgtgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                               <  2:2286651/98‑1 (MQ=11)


                          gtggggtgggtcggacacgtgggatcggtcggCCCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                            <  2:2014376/101‑1 (MQ=11)


                          gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTCGGGTCGGTCGGGGCCGGGGGAtcggc                                                                            >  2:3561733/1‑100 (MQ=11)


                          gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                            <  1:2530673‑M2/101‑10 (MQ=255)


                          gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                            <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                          <  1:2346339‑M2/101‑12 (MQ=255)


                            gggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGACCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtccgtgg                                                                          >  2:3287245/1‑99 (MQ=11)


                             ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                                         <  2:2593938‑M2/101‑13 (MQ=255)


                               gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                                       >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)


                               gtcgggcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                                       <  1:3532947/100‑1 (MQ=11)


                                tctgtcggggccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                      <  2:900145/98‑1 (MQ=11)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                                     >  1:2699735‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                                     >  2:3176530‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                  ggtcgtgtccgtgggaccgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                                                    <  2:1052719/101‑1 (MQ=11)


                                    tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtc                                                                  >  1:900250/1‑101 (MQ=11)


                                    tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggg                                                                  >  1:4590839/1‑99 (MQ=11)


                                     ctaattcgtaggttcgttcgaGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                                                                 <  2:4852923/95‑1 (MQ=11)


                                      ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                >  2:165598/4‑101 (MQ=255)


                                        atcggtggggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                              <  1:4828231/97‑3 (MQ=11)


                                           cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCCTGGGGTCGgtcggggccgtggggaagt                                                           >  2:4759017/1‑97 (MQ=11)


                                            gtgggatcggtcggGCCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                                          <  1:4161521/101‑1 (MQ=11)


                                            gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt                                                          >  2:4311654/1‑101 (MQ=11)


                                             tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGAGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGAcggggccgcggggtccgtc                                                         >  1:653321/1‑100 (MQ=11)


                                             tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgttg                                                         <  2:3825202‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                              gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcg                                                        <  1:1062320‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                              gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg                                                        <  2:824822‑M2/101‑30 (MQ=255)


                                              cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGGgg                                                        >  1:2260910/11‑101 (MQ=11)


                                                gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcggggccgtgggatcggtcggg                                                      <  2:4568721‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                 gtccgtcggaTCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                     >  2:4031667‑M2/2‑69 (MQ=255)


                                                 atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     >  2:1527583/1‑101 (MQ=14)


                                                 atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggt                                                     >  2:4669019/1‑99 (MQ=11)


                                                   cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtagggtcc                                                   <  1:839612‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                                    ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg                                                  <  1:3408830‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                                      tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                >  1:2991097/1‑101 (MQ=11)


                                                            ccGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                          <  1:3906230‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                             ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                         >  2:5030160/5‑101 (MQ=17)


                                                              gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                        >  2:251537‑M2/1‑56 (MQ=255)


                                                                tgcatcgGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                      >  2:3493264‑M2/4‑54 (MQ=255)


                                                                      ggtcggGTCCGTGGGATCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                <  1:1406813‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                         cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggccggcgg                             <  2:4417780‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                                          gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggg                            >  1:4978642‑M2/1‑44 (MQ=255)


                                                                             tcggTGGGTTCGGCCGGATCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                         <  1:3788518/98‑1 (MQ=17)


                                                                              ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcg                        <  1:2599895‑M2/101‑62 (MQ=255)


                                                                                 tgtggtcagtcgggtccgTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                     >  2:4205615‑M2/6‑37 (MQ=255)


                                                                                 tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtg                     <  2:4136778‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                                 tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtc                     <  2:2689474‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                                 tGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta                     <  1:3121764/101‑2 (MQ=17)


                                                                                  gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                    >  1:746176/1‑101 (MQ=255)


                                                                                  gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                    <  2:4922199‑M2/101‑66 (MQ=255)


                                                                                   gggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                   <  1:4217339/98‑1 (MQ=14)


                                                                                     gtcggtcggATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                 <  1:1334935/100‑3 (MQ=14)


                                                                                         gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt             >  1:3208038‑M2/1‑29 (MQ=255)


                                                                                         gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt             >  1:3493625‑M2/1‑29 (MQ=255)


                                                                                         gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggg             >  2:2760604/1‑100 (MQ=255)


                                                                                          tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggggtcggtcgggtccgtg            <  2:2948594‑M2/101‑74 (MQ=255)


                                                                                           gggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgggg           <  2:392777‑M2/100‑75 (MQ=255)


                                                                                           cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg           >  2:1885623‑M2/1‑27 (MQ=255)


                                                                                            ggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg          >  1:4914979‑M2/1‑26 (MQ=255)


                                                                                             gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcggg         >  1:3988373/1‑91 (MQ=11)


                                                                                              gtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat        >  1:3724370‑M2/2‑24 (MQ=255)


                                                                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatc       <  2:1249165‑M2/101‑79 (MQ=255)


                                                                                                gcgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg      >  1:521453‑M2/2‑22 (MQ=255)


                                                                                                ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg      >  1:2882660‑M2/1‑22 (MQ=255)


                                                                                                  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt    <  2:2846809‑M2/101‑82 (MQ=255)


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 30 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG