BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,051	G→C	1.4%	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,051	0	G→C	1.4%	23.8 ‑2.6 ‑0.9	1423	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/15): ref base (638/765): total (643/780)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.38e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.29e-01

Only 100 of 2083 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151


ccgggggatgggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                      <  1:4769152/96‑1 (MQ=11)


  gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  1:3491397‑M1/98‑1 (MQ=255)


  gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGCCGGAtcggc                                                                                                    >  1:649753/1‑100 (MQ=11)


     ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 >  2:2178037/1‑101 (MQ=14)


      ggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                <  1:124880/96‑1 (MQ=14)


       gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                               <  2:3479008/100‑1 (MQ=11)


       atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGATCGGTGgggg                                                                                               >  1:40930/1‑100 (MQ=14)


         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             >  1:4908647/1‑101 (MQ=14)


         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                             >  2:583967/1‑101 (MQ=11)


         cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  1:2363715/101‑1 (MQ=11)


         cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             >  2:653902/1‑101 (MQ=11)


         cgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             <  1:722874/101‑1 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGGGATGGGACGGGTGCg                                                                                            >  2:4194990/1‑101 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                            >  1:1766623/1‑101 (MQ=11)


           gtcggggccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                           <  1:3533379/101‑1 (MQ=11)


           gtcggatccgtgggatcggtgggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                           <  2:1888495/101‑1 (MQ=11)


           gtcgcatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGt                                                                                           >  2:3398868/7‑101 (MQ=11)


            tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGCCGGCGCCGTGGGATCGGGCGGTCCCGtg                                                                                          >  1:836985/1‑100 (MQ=11)


            tcgggtccgggggtgcggtcgggtccgtgggatgggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                                          <  1:4341719/101‑2 (MQ=11)


            tcggatccgtgggatctgtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                                          <  2:4468521/101‑2 (MQ=11)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         <  1:2563921‑M2/101‑3 (MQ=255)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                         >  2:3544767‑M2/1‑99 (MQ=255)


             cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGGCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGTGCCGTGGGATGGGGCGGGTCTGtgg                                                                                         >  2:3035843/1‑99 (MQ=11)


             cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCGGtgg                                                                                         >  2:1328511/1‑99 (MQ=14)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        >  1:3729493/1‑101 (MQ=11)


                gtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                                                      >  1:4690685‑M2/1‑96 (MQ=255)


                ctccgtgggtccggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      <  2:3741004/100‑1 (MQ=11)


                 gccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                                     >  1:2174554‑M2/2‑95 (MQ=255)


                 ccggtgggatcggtcgggtccgtgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     <  2:2286651/98‑1 (MQ=11)


                    gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg                                                                                  <  1:955185‑M2/101‑10 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTGGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGGCGGGTCGGTGgggggggt                                                                                  >  2:2418798/1‑95 (MQ=11)


                    gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                                  <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                     tgggattggtcgggtccgtcgggtccgtcggCTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  2:1766493/101‑1 (MQ=11)


                     tgggatcgttcgtaacggtcgggtcggtcggGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  2:274571/101‑1 (MQ=14)


                       ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg                                                                               <  1:89966‑M2/101‑13 (MQ=255)


                         gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                                             >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)


                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGAGGGAGCGgtagggt                                                                             >  2:4025208/1‑101 (MQ=11)


                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                                             <  2:4920883‑M2/101‑15 (MQ=255)


                         atcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                                             <  1:2702138‑M2/101‑15 (MQ=255)


                          tctgtcggggccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                            <  2:900145/98‑1 (MQ=11)


                           cgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                           <  2:816123/98‑1 (MQ=11)


                           cggtcgggttcgtcggatcggtctgCTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                           <  2:283649/101‑1 (MQ=11)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcggatcg                                                                           <  2:4303317‑M2/101‑17 (MQ=255)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                                                           >  1:3399131‑M2/1‑85 (MQ=255)


                           cgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                                                                           >  1:2890114‑M2/1‑85 (MQ=255)


                             gtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                                                         >  1:608207/1‑101 (MQ=11)


                             gtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcggt                                                                         >  2:3267742/1‑101 (MQ=11)


                              tcgggtccgtcggatcggtgggATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                                                        <  1:3797117/101‑2 (MQ=11)


                               ctaattcgtaggttcgttcgaGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg                                                                       <  2:4852923/95‑1 (MQ=11)


                                gggtcggtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                      <  1:4164249/101‑1 (MQ=11)


                                ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                                                      >  2:2940424/4‑101 (MQ=11)


                                  gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                                                                    >  2:4561036‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                   tccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtgggggccgtcggggc                                                                   >  2:124864/1‑99 (MQ=11)


                                      gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                <  1:1547391‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                       taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTg                                                               >  1:2092185/3‑101 (MQ=11)


                                         ggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                             <  2:3654806‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                           atctgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggt                                                           <  1:4418923‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                           atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                           >  2:1527583/1‑101 (MQ=14)


                                            tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtc                                                          <  1:3304250/101‑1 (MQ=11)


                                            tccgggggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                          <  1:1143651/95‑1 (MQ=14)


                                             cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc                                                         >  2:4756924‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                             cggtcggAGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                         >  1:1988912‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                               gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtacgg                                                       <  2:1136382‑M2/101‑37 (MQ=255)


                                                tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                      >  1:2991097/1‑101 (MQ=11)


                                                 cggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtgg                                                     <  1:2461276/101‑3 (MQ=11)


                                                  ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                    <  2:2594445‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                    gtgcgtgGGATGGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                  >  1:1463129‑M2/4‑60 (MQ=255)


                                                    aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggag                                                  <  2:3925114‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                     tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                 >  2:1429218‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                       ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                               >  2:5030160/5‑101 (MQ=17)


                                                        gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggttacgt                                              <  2:4129725‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                         tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                             >  1:4474281/1‑101 (MQ=14)


                                                             agcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                         <  1:1328518/99‑1 (MQ=17)


                                                                    gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtggg                                  >  1:4978642‑M2/1‑44 (MQ=255)


                                                                    gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGGGCGGTCGGGTCCGTgggggcggcggg                                  >  1:4597164/1‑92 (MQ=11)


                                                                     ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggg                                 <  1:26112‑M2/101‑59 (MQ=255)


                                                                     ggGCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                 >  2:3805503‑M2/1‑43 (MQ=255)


                                                                       tCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc                               <  1:4221573/101‑1 (MQ=17)


                                                                          gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcggt                            <  1:188227‑M2/101‑64 (MQ=255)


                                                                          gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                            >  1:3907475/1‑101 (MQ=255)


                                                                           tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtc                           <  2:2689474‑M2/101‑65 (MQ=255)


                                                                           tGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta                           <  1:3121764/101‑2 (MQ=17)


                                                                            gggATCGGTCGGATCCTGGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtag                          <  2:2107487/101‑3 (MQ=17)


                                                                               aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcggtggggt                       <  2:1042118‑M2/101‑69 (MQ=255)


                                                                                tcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                      >  1:484762‑M2/1‑32 (MQ=255)


                                                                                gcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                      >  1:1055934‑M2/2‑32 (MQ=255)


                                                                                 cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                     <  1:4004815/101‑5 (MQ=14)


                                                                                 ccgtcgcATCCGTGGTATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcg                     <  2:2519168/99‑5 (MQ=14)


                                                                                   gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgg                   <  2:3165184‑M2/101‑73 (MQ=255)


                                                                                    tcggGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                  >  1:3199198‑M2/1‑28 (MQ=255)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg                 >  2:4409892‑M2/1‑27 (MQ=255)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                 <  1:2266744/101‑9 (MQ=11)


                                                                                      ggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                >  2:1655832‑M2/1‑26 (MQ=255)


                                                                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcgg                >  1:1664345/1‑92 (MQ=14)


                                                                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggg          <  1:3630236‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt          <  1:1394490‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                             tgggatcggtcgggtccgtcggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc         >  2:2017538‑M2/1‑19 (MQ=255)


                                                                                             ggggAGCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc         <  2:466424/100‑1 (MQ=21)


                                                                                                 aTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGGGGGATCGGTCGGAc     >  1:278726/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                  tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGCGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc    >  1:51330/1‑101 (MQ=255)


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG