BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,057	G→A	13.0%	D200D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,057	0	G→A	13.0%	0.0 ‑1.9 ‑0.2	1420	D200D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (74/111): ref base (566/668): total (641/779)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.54e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.87e-01

Only 100 of 1927 total aligned reads displayed.


GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGT.GGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC  >  NC_014034/221957‑222157


gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgt.ggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCggg                                                                                                      >  1:3370278/1‑101 (MQ=11)


 atcgataggttccgtgggatccgtgggatccgt.aggCTCGGTCGGGTCCGTAGGATCCGTCGGGTCCGTCGGAACGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                                     <  2:3515249/101‑1 (MQ=2)


   cggtcgggtcggtgggatcggtcgggtccgt.gggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                                   <  1:1568020/101‑1 (MQ=11)


   cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                   <  1:4452162/101‑1 (MQ=14)


   cgggcgggtccgttggatcggtcgggtccgt.gggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   <  1:1761178/101‑1 (MQ=11)


    ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.ggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                                                                                  >  2:4768829/1‑101 (MQ=11)


    ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                                  >  1:841245/1‑101 (MQ=14)


    ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                                  >  2:494375/1‑101 (MQ=14)


     gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGGGGGGTCGGTGGGGTcggg                                                                                                 >  2:5045926/1‑98 (MQ=11)


     gtcggatccgtggtatcggtcggatccgt.aggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                                 <  2:3616070/101‑1 (MQ=11)


      tcgggtcggtgtgaccgggcgggcccgt.ggggtccgGCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                                                <  2:33302/101‑2 (MQ=11)


       cgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                               <  1:1960936‑M2/101‑3 (MQ=255)


       cgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTGGGGCGGGGCCGTGGGGTCCGTCGGTCCCGtgg                                                                                               >  2:2563865/1‑99 (MQ=11)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgt.ggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                              <  1:2519342‑M2/101‑4 (MQ=255)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              >  1:3078865‑M2/1‑98 (MQ=255)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              >  1:1872938‑M2/1‑98 (MQ=255)


        ggatccgtggggtccgtcgggtccgt.gggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGATCCGTGgg                                                                                              >  1:132361/4‑101 (MQ=11)


        ggatccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              <  1:472256‑M2/101‑4 (MQ=255)


         ggtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTggga                                                                                             <  2:4070371‑M2/101‑5 (MQ=255)


          gtccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                                                            >  1:4862697‑M2/1‑96 (MQ=255)


           tccgggggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                           <  1:1473594/101‑1 (MQ=14)


           accgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATTTTTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                           <  1:4631262/100‑1 (MQ=11)


            ccgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                                          <  1:3529717‑M2/101‑8 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcgggtccgt.gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg                                                                                         >  1:2970609‑M2/1‑93 (MQ=255)


             cgtgggatcggtcggatccgt.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGAttgg                                                                                         >  2:3707982/1‑101 (MQ=14)


              gtgggatcggtcggatccgt.gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                                        <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


               ggggatgtgtcgggtccgt.gggatctgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                       <  2:3082998/100‑1 (MQ=11)


                gggatcggtcgggtccgt.ggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                                                      <  1:4545076‑M2/101‑12 (MQ=255)


                 gggtccgtcggatccgt.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg                                                                                     >  2:3207787/7‑101 (MQ=11)


                 ggatcggtcgggtccgt.gggatctgtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                            >  1:1394333/1‑101 (MQ=11)


                 ggatcggtcgggtccgt.cggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                     <  1:1665519/101‑1 (MQ=11)


                    tctgtcggggccgt.cggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                                  <  2:900145/98‑1 (MQ=11)


                     gggtggggtccgtcggggtc.gtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                                 <  1:998666/100‑1 (MQ=11)


                     cggtcgggtccgt.cggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGgtcggggcc                                                                                 >  1:3891967/1‑101 (MQ=11)


                     cggcggggtccgt.gggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                                                 <  1:2241823/96‑1 (MQ=11)


                      ggtcgggtccgt.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                                                                                <  2:1913155‑M2/101‑18 (MQ=255)


                      ggtcggatccgt.gggatcggtcggATCCGTCGGATCGGTCGGATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGCTCGgtcggggcag                                                                                >  1:4401737/1‑97 (MQ=11)


                        tcggatccgt.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc                                                                              <  2:2781320/101‑1 (MQ=255)


                         cgggtccgt.cggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcg                                                                             >  2:4298121‑M2/1‑81 (MQ=255)


                            gtccgt.gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                                                                          >  2:4561036‑M2/1‑78 (MQ=255)


                            atccgt.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                                          >  2:2630990/2‑99 (MQ=255)


                                 t.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggaccgt.gggtccggtc                                                                    >  1:5002298/1‑98 (MQ=11)


                                 t.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                                                                     <  2:2054555/101‑2 (MQ=11)


                                 t.gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGCCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggcccgtcggatcggcc                                                                     >  1:1138227/1‑97 (MQ=11)


                                   gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                    >  1:755246/1‑101 (MQ=11)


                                   cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGCCCGGTCGGGTCCGCGGGGCCCGTgg                                                                    >  2:2456872/11‑101 (MQ=2)


                                    ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTGCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTcgg                                                                   >  1:4298438/1‑101 (MQ=14)


                                    ggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg                                                                   <  2:3426194/101‑1 (MQ=11)


                                       tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                <  1:674829/101‑1 (MQ=14)


                                       tcggtcggGGCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                >  1:1242705‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                        cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                               <  2:2124913/101‑1 (MQ=14)


                                         ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                              <  1:2693706‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                            cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgcgg                                                           <  1:2765124‑M2/101‑39 (MQ=255)


                                            cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtgg                                                           >  2:1696599/1‑99 (MQ=11)


                                             gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                          <  2:1185449/98‑1 (MQ=14)


                                             ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                          <  1:3190694/101‑1 (MQ=1)


                                             ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                          <  2:1820251‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                       >  1:4793778‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                                                       <  1:3616341‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                                tCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                       >  1:2346031/1‑101 (MQ=14)


                                                  cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGCGGGCTCCGTGGGagcgg                                                     >  2:1378799/1‑97 (MQ=11)


                                                  cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTAGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTACGTGGGAACCGCGGGGTCGGCCGGGTcgc                                                     >  2:670317/1‑99 (MQ=2)


                                                      ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTcgg                                                 >  2:288952/1‑101 (MQ=14)


                                                         tgggtcggGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  1:4921210/99‑1 (MQ=17)


                                                              cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                         <  2:3783041‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                              cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                         <  1:4205932‑M2/101‑57 (MQ=255)


                                                               gggTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                        <  2:1440954/101‑1 (MQ=14)


                                                                 gTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCgggc                                      >  1:2435763/1‑100 (MQ=17)


                                                                  tcggTGGGTTCGGCCGGATCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                     <  1:3788518/98‑1 (MQ=17)


                                                                  gtggTGGGCTCGGTCGGGTTGGTGGGATCGGTCGGCTCTGTGGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTc                                     <  1:2169398/98‑1 (MQ=2)


                                                                   ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                    <  1:3987975/101‑1 (MQ=255)


                                                                    cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                   >  2:603241/1‑101 (MQ=255)


                                                                    cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                   >  2:4382459/1‑101 (MQ=11)


                                                                       cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                >  2:4452060/2‑101 (MQ=17)


                                                                        ggATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg                               >  1:4070674‑M2/1‑35 (MQ=255)


                                                                         gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggg                              <  2:2978477‑M2/101‑68 (MQ=255)


                                                                           tcggtcggGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                            >  2:220641‑M2/1‑32 (MQ=255)


                                                                           gcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                            >  1:1055934‑M2/2‑32 (MQ=255)


                                                                            cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                           <  1:913768‑M2/101‑71 (MQ=255)


                                                                            cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcg                           <  1:2073037/101‑5 (MQ=14)


                                                                             ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGCTCGGGTCCGTGGGGCtgg                          >  2:837070/1‑101 (MQ=255)


                                                                              gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgttcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                         >  2:750516‑M2/1‑29 (MQ=255)


                                                                              gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgg                         <  2:2356783‑M2/101‑73 (MQ=255)


                                                                                cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcg                       >  2:3987673/1‑93 (MQ=14)


                                                                                 ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatagggcgggtccgtggg                      <  2:1572761‑M2/101‑76 (MQ=255)


                                                                                  ggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggga                     >  1:4144233‑M2/3‑25 (MQ=255)


                                                                                   gtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat                    >  1:3724370‑M2/2‑24 (MQ=255)


                                                                                    tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                   >  2:3883834‑M2/1‑23 (MQ=255)


                                                                                    tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                   >  2:4881359‑M2/1‑23 (MQ=255)


                                                                                     gcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                  >  2:2702724‑M2/2‑22 (MQ=255)


                                                                                     gcgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                  >  1:521453‑M2/2‑22 (MQ=255)


                                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                  <  1:3477608‑M2/101‑80 (MQ=255)


                                                                                     ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                  <  1:611550‑M2/101‑80 (MQ=255)


                                                                                     ccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcc                  >  2:1067565‑M2/1‑22 (MQ=255)


                                                                                      ggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                 >  2:4178339‑M2/2‑21 (MQ=255)


                                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                >  1:3280239‑M2/1‑20 (MQ=255)


                                                                                       gtgagatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                >  2:1275418‑M2/1‑20 (MQ=255)


                                                                                        ggggAGCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc               <  2:466424/100‑1 (MQ=21)


                                                                                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcg              <  1:2594920‑M2/101‑84 (MQ=255)


                                                                                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggat  >  1:2854837‑M2/1‑6 (MQ=255)


GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGT.GGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC  >  NC_014034/221957‑222157

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG