| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 682,582 | C→G | 7.8% | G342A (GGG→GCG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 682,582 | 0 | C→G | 7.8% | 28.8 0.0 ‑0.0 | 195 | G342A (GGG→GCG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/9): ref base (74/105): total (81/114) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.92e-01 | ||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCGAGAGCGCCGA > NC_014034/682482‑682682
|
aGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGccc < 1:2995205/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGc > 2:536293/1‑101 (MQ=255)
ccgcGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGcc < 1:4172715/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTCTTGCGCGTGCCCAGACCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCa < 2:896729/101‑1 (MQ=38)
cgcgATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCa < 1:3295986/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTc < 1:2564807/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTc < 1:2473249/101‑1 (MQ=255)
tCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTcc > 2:4155340/1‑101 (MQ=255)
tCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTcc > 2:2849372/1‑101 (MQ=255)
tCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTcc < 1:460444/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCg < 2:1879835/101‑1 (MQ=255)
gCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCg < 2:936180/101‑1 (MQ=255)
cgcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGt < 2:391157/101‑1 (MQ=255)
cgcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGt < 2:730054/101‑1 (MQ=255)
cgcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGt < 1:1128282/101‑1 (MQ=255)
gcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGTCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTc < 2:1514111/101‑1 (MQ=255)
gcgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTc > 1:4530633/1‑101 (MQ=255)
gTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGa > 2:2163579/1‑101 (MQ=255)
gTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGa < 1:3336628/101‑1 (MQ=255)
tGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaa > 1:1021938/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaaa > 2:473556/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaaa < 1:2765948/101‑1 (MQ=255)
gCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaaa > 2:1345404/1‑101 (MQ=255)
cccAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAg < 1:2615838/101‑1 (MQ=255)
aGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGccc > 1:2839268/1‑101 (MQ=255)
aGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGGCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGccc > 1:1940018/1‑101 (MQ=255)
aCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCtt < 1:2639510/101‑1 (MQ=255)
ccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCttg > 1:92107/4‑100 (MQ=37)
ccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCttg < 1:3083497/98‑2 (MQ=37)
cccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTc < 1:1834894/101‑1 (MQ=255)
cgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCttga > 2:1468752/3‑99 (MQ=37)
cgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCttga > 1:3597997/3‑99 (MQ=37)
cgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCttga > 2:3771201/3‑99 (MQ=37)
ccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCa < 2:4902726/101‑1 (MQ=255)
ccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCa < 2:4642083/101‑1 (MQ=255)
ccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TG..CAGCTCGGTCATGTCATAGATCGGAAgagcacacgtc > 1:432844/1‑91 (MQ=25)
cccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAg < 1:4723506/101‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAgc < 1:1611283/101‑1 (MQ=25)
cAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAgcg > 1:853404/1‑101 (MQ=25)
aGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAgcgc > 1:2389598/1‑101 (MQ=255)
aGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAgcgc < 2:2466930/101‑1 (MQ=25)
gCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGcgcg > 2:2495135/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGcgcgc > 1:4754103/1‑100 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc > 2:4359047/1‑101 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc > 2:4998914/1‑101 (MQ=255)
ggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGACCGGCCATGTCCTAGGACGAAAGCCCCTTCAGCGcggcgg > 1:2937639/1‑101 (MQ=255)
gCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGt > 2:1687509/1‑101 (MQ=255)
gCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAGcgcgccact < 2:2368605/101‑6 (MQ=21)
ccGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTg < 2:2592166/101‑1 (MQ=255)
cGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAGcgcgccactgg < 2:1053054/101‑8 (MQ=25)
gTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGcc < 2:3169182/101‑1 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCCATCTTCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCg > 2:3738516/1‑101 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCg > 1:436853/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATc < 1:1774271/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcg > 2:3056828/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcg > 2:4244930/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgcc < 2:4579640/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCACCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCGTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcccc > 2:297821/1‑101 (MQ=255)
cgccgcCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccg < 1:2660942/101‑1 (MQ=255)
ccggcATCCGCGCCCCGGCCCGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCa < 1:3564818/101‑1 (MQ=255)
ccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCa < 1:1590026/101‑1 (MQ=255)
ccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCa < 1:716736/101‑1 (MQ=255)
ccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCa < 1:3424451/101‑1 (MQ=255)
gccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCaaa > 1:3684156/1‑101 (MQ=255)
gccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCaaa < 2:4210620/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg > 1:4852117/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg < 1:3166726/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg > 1:3456272/1‑101 (MQ=255)
cccGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCgg < 2:2645882/101‑1 (MQ=255)
cGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGaa < 1:629904/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGaaa > 2:4468637/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAgg > 2:1705666/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAgg > 2:3138130/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGgc < 1:2053398/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGgc < 2:3403013/101‑1 (MQ=255)
gccgccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGcc < 1:5024800/101‑1 (MQ=255)
ccgccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCg < 2:1133609/101‑1 (MQ=255)
ccgccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCg < 1:305085/101‑1 (MQ=255)
gccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGAt < 1:1345525/101‑1 (MQ=255)
gccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGAt < 1:3738794/101‑1 (MQ=255)
gccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGAt < 2:1342505/101‑1 (MQ=255)
ccAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATc < 2:3049152/101‑1 (MQ=255)
aGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCGGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTg < 1:3991324/101‑1 (MQ=255)
aGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTg > 2:3861406/1‑101 (MQ=255)
ttCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCt < 2:579389/101‑1 (MQ=255)
tCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTc < 1:536372/101‑1 (MQ=255)
tCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTc > 1:1587873/1‑101 (MQ=255)
tCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTc < 1:3861691/101‑1 (MQ=255)
tCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTc < 2:3290996/101‑1 (MQ=255)
tCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGANCTGCTc > 1:2079579/1‑101 (MQ=255)
aTCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGc > 1:153150/1‑101 (MQ=255)
aTCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGc > 2:4219784/1‑101 (MQ=255)
aTCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGc > 2:4859325/1‑101 (MQ=255)
cG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCg < 2:799925/101‑1 (MQ=255)
g.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCga < 2:4530313/101‑1 (MQ=255)
gCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCgaga > 1:4946052/1‑101 (MQ=255)
gCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCgaga < 1:2495309/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCGAGAgc < 1:4999244/101‑1 (MQ=255)
gCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCGAGAGCGcc > 1:1652843/1‑101 (MQ=255)
ccGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCGAGAGCGCCGa > 1:2175233/1‑101 (MQ=255)
|
CAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCGGAAAAGGCGCCGATCTGCTCGGCCGAGAGCGCCGA > NC_014034/682482‑682682
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|