| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_014034 | 1395500 = | 234 (1.020) | 136 (0.590) | 50/128 | 7.3 | 0.41 | intergenic (+312/‑619) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| ? | NC_014034 | = 1397797 | 157 (0.440) | intergenic (+101/+1797) | RCAP_rcc01307/RCAP_rcc01309 | hypothetical protein/IS66 family transposase | |||||
| Rejected: Position hash score below cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 524 total aligned reads displayed.
ACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCA > NC_014034/1395400‑1395600
|
ccccGCTTGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg < 2:7104532/100‑1 (MQ=255)
ccccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg < 2:4148765/100‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:100025/101‑1 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc < 2:4923194/101‑1 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc < 1:2730487/101‑1 (MQ=255)
cggtgatcggtgatCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCCCgg > 2:1241652/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg > 2:2462775/1‑101 (MQ=255)
tcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt < 2:545073/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:389735/101‑1 (MQ=255)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:832490/92‑1 (MQ=2)
gctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 1:4756516/92‑1 (MQ=2)
tgccgctgcgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACACCCCGAACCTGTCGGCGG.CGA.ATACCGATACCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:5367378/92‑1 (MQ=2)
tgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:3466960/101‑1 (MQ=255)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:1907630/93‑1 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:3242703/8‑101 (MQ=2)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3783938/94‑1 (MQ=2)
tcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:6965490/1‑101 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 1:301048/3‑101 (MQ=2)
gtggTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:1865172/99‑1 (MQ=2)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAATCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:7046811/101‑1 (MQ=255)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:6965863/101‑1 (MQ=255)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:524274/101‑1 (MQ=255)
tggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACag > 1:6718162/2‑100 (MQ=2)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 2:1608689/101‑1 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 2:144898/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:5875851/1‑101 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGGTCGAAACAcct > 2:7043087/1‑101 (MQ=0)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc < 2:6504089/101‑1 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc < 1:608986/101‑1 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctt < 1:2848035/101‑2 (MQ=2)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:6217824/101‑1 (MQ=255)
cGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACC..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 2:2300439/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:1161415/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 2:6698190/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:767812/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 2:4884473/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg < 2:6248931/101‑1 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat > 2:3693916/1‑95 (MQ=0)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatg < 2:335451/101‑8 (MQ=2)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 1:2555820/101‑1 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 2:2004257/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAATCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGt < 1:5604294/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTc < 1:1989498/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc > 2:4425763/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc > 2:5267203/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGCTGCCGTCGCTCgg > 1:5701936/1‑100 (MQ=255)
gCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGGCGCTCgcc > 1:1269924/1‑99 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.Tcc < 1:4589218/101‑1 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.Tcc < 1:7095824/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACC..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCa > 1:6306516/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAg > 1:4167159/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAg > 2:4308110/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGc < 2:2643741/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGCCGCTCG.TCCAGc > 2:3910154/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCAACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.GCCCGc > 1:3448379/1‑101 (MQ=255)
cGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.c > 2:5541647/1‑101 (MQ=255)
aaaCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCt > 1:1817775/1‑101 (MQ=255)
a..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtc > 2:1107579/1‑101 (MQ=255)
agcgccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtc < 2:4670891/99‑1 (MQ=255)
tCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtcg < 1:1748047/101‑1 (MQ=255)
tCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtcg < 1:644849/101‑1 (MQ=255)
cgccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtcgt < 1:1409203/101‑1 (MQ=255)
gccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtcgtc < 2:507478/101‑1 (MQ=255)
gcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCtcgtcaga > 2:6155933/1‑98 (MQ=255)
gcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCt > 2:5677978/1‑101 (MQ=255)
cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTc < 2:2070953/101‑1 (MQ=255)
cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTc > 1:2404489/1‑101 (MQ=255)
ttGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCCGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTccc > 2:2725445/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTcccc > 1:1673338/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTcccc > 1:4654580/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCcg > 1:1491897/1‑101 (MQ=255)
cGGGCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCcg < 1:6767823/101‑1 (MQ=255)
gTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTGGCTCCCCCcgcg < 1:5087399/101‑1 (MQ=255)
gCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 2:217766/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCCCGGGGGCGTg > 1:3290636/1‑101 (MQ=255)
gccctcgcacgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGACGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:901757/91‑1 (MQ=0)
cTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:2289802/101‑1 (MQ=255)
agcggctgcggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAAAAAGCCGCCGACAAACGCGGCAACCGG.CCC.G.GCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:5993045/11‑101 (MQ=0)
tGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:4425985/101‑1 (MQ=255)
ggccggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:192284/93‑1 (MQ=2)
ggccggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt > 2:2983831/9‑101 (MQ=2)
ggccggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGACGTCGCTCCCCCCGCGGGGGTGTgggc > 2:6328645/9‑99 (MQ=2)
ggTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:3156785/101‑1 (MQ=255)
gccggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 1:5587694/8‑101 (MQ=2)
ctcgcacgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGACGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:3397077/94‑1 (MQ=2)
taccgcgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGATGATCAAATCCGCA.ATCGGCCGG.GCTCGATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1040140/95‑1 (MQ=2)
tAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:3203866/101‑1 (MQ=255)
tAACGTGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:5370346/101‑1 (MQ=255)
cggtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:576294/6‑101 (MQ=2)
aaCGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 1:2629332/1‑101 (MQ=255)
aaCGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:6592185/1‑101 (MQ=255)
gtccgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGACGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:1726633/5‑101 (MQ=2)
gcacgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGACGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa > 2:2843722/5‑101 (MQ=2)
gtggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa > 1:3546027/4‑101 (MQ=2)
cGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 2:1817711/101‑1 (MQ=255)
tggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA.CCCGGCGCCGCAGCGAG.TGCGTCTGGAACA.GGATGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAac > 1:159788/3‑101 (MQ=2)
gtgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAac < 1:4346602/101‑1 (MQ=255)
ccgtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAATGCGGCGCGGGC.CTAT.GGCTGACGGACCC.GCCCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAac < 2:3045167/99‑1 (MQ=2)
ggtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAacc < 1:6566372/100‑1 (MQ=255)
gtCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAacca > 1:2180544/1‑101 (MQ=255)
|
ACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCG.TCCAGCCGG.CCT.GCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCA > NC_014034/1395400‑1395600
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|