New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221956 =460 (1.310)175 (0.520) 39/190 17.7 0.21 coding (701/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222081 868 (2.430)coding (576/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 1909 total aligned reads displayed.

TTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGG  >  NC_014034/221856‑222056
                                                                                                    |                                                                                                    
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                                                      <  1:6468350‑M1/1‑1 (MQ=255)
 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggg                                                                                                     <  1:1534188‑M1/2‑1 (MQ=255)
 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                                     <  1:3264487‑M1/2‑1 (MQ=255)
   gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                                   <  1:4663579‑M1/4‑1 (MQ=255)
    tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                                                                                                  >  2:1437780‑M1/97‑101 (MQ=255)
     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcc                                                                                                 >  1:5910071‑M1/96‑97 (MQ=255)
       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                                               <  1:620165‑M1/8‑1 (MQ=255)
        tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgcgggatcggtc                                                                                              >  2:653442‑M1/93‑101 (MQ=255)
          gggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg                                                                                            >  1:4278704‑M1/91‑101 (MQ=255)
          ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgg                                                                                            <  1:2484367‑M1/11‑1 (MQ=255)
          ggagcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggttgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                            <  1:5605238‑M1/11‑1 (MQ=255)
           gatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                                           <  1:71679‑M1/12‑1 (MQ=255)
             tcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                         >  1:6621372‑M1/88‑101 (MQ=255)
             tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc                                                                                         <  2:6875531‑M1/14‑1 (MQ=255)
               ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                                                       <  2:6324719‑M1/16‑1 (MQ=255)
                 tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                     <  1:3075571‑M1/18‑1 (MQ=255)
                       ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                               >  2:1832654‑M1/78‑101 (MQ=255)
                        cgtgggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                              <  1:5138489‑M1/25‑1 (MQ=255)
                         gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                             <  1:6759093‑M1/26‑1 (MQ=255)
                         gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggacgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                             <  1:5972708‑M1/26‑1 (MQ=255)
                           gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtggggtcggtcg                                                                           <  2:5008519‑M1/28‑1 (MQ=255)
                            gCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                          >  1:3493538/1‑101 (MQ=255)
                               tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtggggtcgggcggggc                                                                       <  2:445846‑M1/32‑3 (MQ=255)
                               tCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                       <  2:2523702/101‑1 (MQ=255)
                                cggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                      >  2:3431462‑M1/69‑101 (MQ=255)
                                cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                      >  2:562997/1‑101 (MQ=255)
                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                                     <  2:1715052‑M1/34‑1 (MQ=255)
                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                                     >  2:5409920‑M1/68‑101 (MQ=255)
                                  gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                    <  1:526111‑M1/35‑1 (MQ=255)
                                  ggcgggtccgtgggatcggtccggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                    >  1:1246028‑M1/67‑101 (MQ=255)
                                     ttGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                 <  1:88899/101‑1 (MQ=255)
                                      gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtccgcgggatcggtcggatccgtggga                                                                <  1:3691059‑M1/39‑1 (MQ=255)
                                       ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                               <  1:2978748/101‑1 (MQ=255)
                                       atccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                               >  1:4904718‑M1/62‑101 (MQ=255)
                                         tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                             <  1:5019542/101‑1 (MQ=255)
                                         ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg                                                             <  2:2914566‑M1/42‑1 (MQ=255)
                                         ccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                             <  2:1938107‑M1/42‑1 (MQ=255)
                                          cgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                            <  1:318468‑M1/43‑1 (MQ=255)
                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtg                                                          <  2:5543753‑M1/45‑2 (MQ=255)
                                            tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtc                                                          <  1:3574743‑M1/45‑1 (MQ=255)
                                              aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                        <  2:2188533/101‑1 (MQ=255)
                                                 tcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                     >  2:6170883‑M1/52‑98 (MQ=255)
                                                 gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                     >  2:3596500/1‑101 (MQ=255)
                                                 gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                     >  1:7036666/1‑101 (MQ=255)
                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                    <  1:5772780‑M1/51‑1 (MQ=255)
                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTcc                                                    <  2:7089871‑M1/51‑1 (MQ=255)
                                                   ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcgc                                                   <  1:3955719‑M1/52‑6 (MQ=255)
                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                   <  1:1645709‑M1/52‑1 (MQ=255)
                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                   <  1:5488440‑M1/52‑1 (MQ=255)
                                                   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                   <  2:3522869‑M1/52‑1 (MQ=255)
                                                      cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                >  1:4187882/1‑101 (MQ=255)
                                                        ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGATCCGTGGGa                                              <  2:6656190‑M1/57‑1 (MQ=255)
                                                         gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                             >  1:2677504‑M1/44‑101 (MQ=255)
                                                           ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                           >  1:2589132‑M1/42‑101 (MQ=255)
                                                            gtgcTCAGCGACGGGGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                          <  2:3101648/99‑1 (MQ=255)
                                                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                          <  2:4332338‑M1/61‑6 (MQ=255)
                                                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                          <  1:44609‑M1/61‑6 (MQ=255)
                                                             gtgggatcggtcgggtccgtgcgatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                         >  2:4890647‑M1/40‑101 (MQ=255)
                                                             gccggatcggtcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                         >  2:4200205‑M1/40‑101 (MQ=255)
                                                              tcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                        <  2:1131461‑M1/63‑1 (MQ=255)
                                                              tcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                        <  1:4073779‑M1/63‑1 (MQ=255)
                                                              ggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                        >  2:4562511‑M1/39‑101 (MQ=255)
                                                                  gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                    >  1:2868458‑M1/35‑101 (MQ=255)
                                                                   tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                   >  1:1104265‑M1/34‑101 (MQ=255)
                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                  <  2:1018862‑M1/69‑1 (MQ=255)
                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                  <  2:3788598‑M1/69‑1 (MQ=255)
                                                                    cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                  >  1:3408025‑M1/33‑101 (MQ=255)
                                                                       gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                               >  1:4355251‑M1/30‑101 (MQ=255)
                                                                        ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcagatcggaaa                              >  2:1302533/1‑91 (MQ=255)
                                                                        cgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgtag                              <  1:3886776‑M1/73‑3 (MQ=255)
                                                                           gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                           <  1:4806416‑M1/76‑1 (MQ=255)
                                                                            ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                          >  1:608884/1‑101 (MQ=255)
                                                                            gccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                          >  2:5904649‑M1/25‑101 (MQ=255)
                                                                             cggTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGCGGATCCGTCGGGTCCGTGCGGTCGGGCGGGCCCggcggctcg                         >  2:6005603/3‑93 (MQ=2)
                                                                             ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                         >  1:2786418‑M1/24‑101 (MQ=255)
                                                                             ccgtgggatcggtcgggcccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                         >  2:2048627‑M1/24‑97 (MQ=255)
                                                                             ccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                         >  1:3812460‑M1/24‑97 (MQ=255)
                                                                               gtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                       <  1:1805145‑M1/80‑1 (MQ=255)
                                                                                  gggtgggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                    >  1:6318332‑M1/19‑101 (MQ=255)
                                                                                  ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                    >  2:1571651/1‑101 (MQ=255)
                                                                                     tccGTGGGTTCGGTCGGATCCTTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc                 <  2:2660267/99‑1 (MQ=11)
                                                                                      gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                <  1:1353545/101‑1 (MQ=255)
                                                                                      ccgtcggctccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                >  2:5251311‑M1/15‑101 (MQ=255)
                                                                                         tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc             >  2:2369557/1‑100 (MQ=1)
                                                                                           ggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg           >  2:4708961‑M1/10‑101 (MQ=255)
                                                                                             gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTTGGTCGGATGCGTCGGAt         >  1:5384314/8‑101 (MQ=11)
                                                                                             gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt         >  2:3203599‑M1/8‑101 (MQ=255)
                                                                                             gtccgggggatcgggcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt         <  1:2037349/94‑1 (MQ=11)
                                                                                              tcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc        >  1:100103‑M1/7‑101 (MQ=255)
                                                                                              tccgtcggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc        <  2:6775141/98‑1 (MQ=11)
                                                                                              tccgggGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc        >  1:6884943‑M1/7‑101 (MQ=255)
                                                                                               ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg       <  1:4562750‑M1/96‑1 (MQ=255)
                                                                                               ccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg       <  2:2794577/99‑1 (MQ=255)
                                                                                                   gggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg   <  2:3906948/100‑1 (MQ=11)
                                                                                                   gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg   <  2:850776‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                                   gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg   <  2:5766504‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                                   gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGAtcggtcg   <  1:2211112‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                                   cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcg   >  2:4029492/1‑101 (MQ=14)
                                                                                                    ggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggg  <  1:190883/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                    ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGACTCCTGGGACCGGGCGGGCTCGTGGGCccgctcgg  >  1:2397995/1‑101 (MQ=2)
                                                                                                    |                                                                                                    
TTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGG  >  NC_014034/221856‑222056

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 17 ≤  ATCG  < 24 ≤  ATCG  < 33 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG