New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221986 =1250 (4.310)161 (0.560) 41/162 14.1 0.17 coding (671/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222119 334 (0.930)coding (538/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 2667 total aligned reads displayed.

TTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC  >  NC_014034/221886‑222086
                                                                                                    |                                                                                                     
ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                                       <  2:5402349/101‑1 (MQ=255)
  gggtcggctccctgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                     >  2:2009260‑M1/69‑101 (MQ=255)
  cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                     <  2:158127/101‑1 (MQ=255)
   ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg                                                                                                    <  1:5945435‑M1/34‑1 (MQ=255)
    gtgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                                                   <  1:2991642/101‑1 (MQ=255)
     tcgggtccgtgggatcggtcgggtcggtgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                                                  >  1:3585160‑M1/66‑101 (MQ=255)
       ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                                <  1:3913461‑M1/38‑1 (MQ=255)
         ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggac                                                                                              >  2:1872934/1‑100 (MQ=255)
           tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                            <  1:2176115/101‑1 (MQ=255)
           tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                            <  1:5019542/101‑1 (MQ=255)
            cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcgg                                                                                           <  1:287706‑M1/43‑1 (MQ=255)
             gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt                                                                                          <  1:5797770‑M1/44‑7 (MQ=255)
                 gatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                                      >  2:2960693‑M1/54‑100 (MQ=255)
                   tgggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                    >  2:2509866‑M1/52‑98 (MQ=255)
                   gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                    >  2:3090210/1‑101 (MQ=255)
                   gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                    >  1:7036666/1‑101 (MQ=255)
                        cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                               >  1:1786651/1‑101 (MQ=255)
                             ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTgggagcg                                                                          <  2:1129313‑M1/60‑4 (MQ=255)
                                  ggatcggtcggctccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                     >  2:7019072‑M1/37‑101 (MQ=255)
                                  ggatcggtcggatccgtggggtcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                     >  2:2242367‑M1/37‑101 (MQ=255)
                                    atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                   <  1:3259617‑M1/67‑1 (MQ=255)
                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                <  2:5599705‑M1/70‑1 (MQ=255)
                                           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTggg                                                            <  1:887120‑M1/74‑1 (MQ=255)
                                           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                            >  1:4368270‑M1/28‑101 (MQ=255)
                                           ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                            <  1:1488373‑M1/74‑1 (MQ=255)
                                              tccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                         >  2:6272991‑M1/25‑101 (MQ=255)
                                               gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.g                                                       >  1:4882664/1‑101 (MQ=255)
                                                cgtgtgttcggtcgggtccgtgGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.gg                                                      >  2:6130662‑M1/23‑101 (MQ=255)
                                                  tgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.ggtc                                                    >  2:86373‑M1/21‑101 (MQ=255)
                                                   gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc.ggtcg                                                   >  2:430233‑M1/20‑101 (MQ=255)
                                                    ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.ggtcgg                                                  <  1:6058529/101‑1 (MQ=255)
                                                     gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGa                                                 >  1:5410192/1‑101 (MQ=255)
                                                        ccGTCGGGTCGGTCGCAGCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC.CGTGGGATcg                                              <  2:1022248/100‑2 (MQ=14)
                                                         ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCg                                             <  1:3125359‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                         ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCg                                             <  1:461537‑M1/88‑1 (MQ=255)
                                                            cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTgg                                          <  1:3862490‑M1/91‑1 (MQ=255)
                                                              gatcggtcggGGCCGTTGGATCCGTTGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC.GGTCGGGTCCGTcggg                                        <  2:3359826/99‑2 (MQ=14)
                                                               gtccgtgtgatcggtcggctccgttggatcggtcggggccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAt                                       <  2:3846593/93‑1 (MQ=11)
                                                               gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTG.CGGCGGATCCGTggggc                                       >  2:1749479/8‑99 (MQ=11)
                                                                tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtc                                      <  2:2838957/101‑1 (MQ=255)
                                                                 gcgttgcataggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                     <  2:2092905/91‑1 (MQ=11)
                                                                  tctggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTGGGATCCGTGGGAtcgg                                    <  1:2580879/91‑1 (MQ=14)
                                                                  cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                    <  2:5728254‑M1/97‑1 (MQ=255)
                                                                   gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                   <  1:4739970‑M1/98‑1 (MQ=255)
                                                                    tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATC.GGTGGGGGCGGGGGGGtcggtg                                  >  2:550269/3‑100 (MQ=11)
                                                                    tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTGAGTGGGATC.GGTGGGTTACGGGCGAtcgggg                                  >  1:2310791/3‑99 (MQ=11)
                                                                    tgGGCTCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                  >  2:5979096‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                    tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                  >  2:3675298‑M1/3‑101 (MQ=255)
                                                                    tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                  <  1:6626312‑M1/99‑1 (MQ=255)
                                                                    tcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATC.GGGCGGGTCCGTCGGAtcgggg                                  >  2:6621030/1‑99 (MQ=0)
                                                                    ggggatcgggcgggtccgtgggatccgtgggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                  <  2:4040145/99‑1 (MQ=11)
                                                                     ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcg                                 <  1:3703290/94‑1 (MQ=11)
                                                                      ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg                                >  2:3486457/1‑101 (MQ=11)
                                                                      ggatcggtcgggtacgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGCCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                <  1:6196868/101‑1 (MQ=14)
                                                                       gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcggtcgGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                               <  1:734325/101‑1 (MQ=11)
                                                                       gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCggg                               >  1:3346358/1‑101 (MQ=11)
                                                                         tcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                             <  2:6731940/101‑1 (MQ=11)
                                                                         tcggccgggtccggcggatcggtcgggtccgtcggaTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                             <  2:4830454/101‑1 (MQ=11)
                                                                          tggtcgggtccgtggggccggtccggtccgtgggatcCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                            <  2:1422115/100‑1 (MQ=11)
                                                                          cggtgggttccgtcggatcggtcgggtccgtcgggtCCGTCGGATCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                            <  2:6413231/101‑1 (MQ=11)
                                                                          cggtcgggtccgtgggatcgggccggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                            <  2:4385450/101‑1 (MQ=17)
                                                                          cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                            <  1:1324815/101‑1 (MQ=11)
                                                                           ggtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                           <  2:1304529/101‑1 (MQ=11)
                                                                           ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGT.GGATCGGGTCGGATCCGTGGGAT.GGTCGGGACCgg                          >  2:4949991/1‑100 (MQ=14)
                                                                            gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGACCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                          <  2:3937213/101‑1 (MQ=11)
                                                                            gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                          <  1:5666821/101‑1 (MQ=11)
                                                                             tcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                         >  2:3579105‑M2/1‑100 (MQ=255)
                                                                             tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                         <  1:6758226‑M2/101‑2 (MQ=255)
                                                                             taggttccgttggatcgggcgggtccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                         <  2:6829911/96‑2 (MQ=14)
                                                                              ggggtccgtgggatccgtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                        >  1:1880412‑M2/2‑99 (MQ=255)
                                                                              cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                        <  1:4506248‑M2/101‑3 (MQ=255)
                                                                              cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                        >  2:2380389‑M2/1‑99 (MQ=255)
                                                                              cggatgcgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                        >  1:6861588/7‑99 (MQ=11)
                                                                              cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGATCCGtgg                        >  2:7132767/1‑99 (MQ=11)
                                                                                 atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGTGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGAt                     >  1:2036985/2‑101 (MQ=11)
                                                                                  tccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                    <  1:5170871/101‑1 (MQ=11)
                                                                                  tccgtgggggccgtccggtccgtgggatcggtcggTTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtc                    <  2:4184760/101‑1 (MQ=11)
                                                                                   gcgtggggtccgtggggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcg                   <  1:427671/100‑1 (MQ=11)
                                                                                   gcgtgggatgggtggggtccgggggatcggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                   <  1:414602/100‑1 (MQ=11)
                                                                                   ccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                   >  1:122434‑M2/1‑94 (MQ=255)
                                                                                    cgtgggttcggtcggggccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                  <  1:1093753/101‑1 (MQ=14)
                                                                                    cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                  >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)
                                                                                    cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGTGAtcgg                  >  1:6515203/1‑101 (MQ=14)
                                                                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTgggatcggtcg               <  1:1628129‑M2/101‑12 (MQ=255)
                                                                                       gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtctgtcg               >  1:5311154/1‑101 (MQ=11)
                                                                                        ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGAtcggtcgg              >  2:4523372/1‑101 (MQ=14)
                                                                                         gatcggtggggcccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgga             >  2:2728514‑M2/1‑88 (MQ=255)
                                                                                          atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggac            <  1:3471120‑M2/101‑15 (MQ=255)
                                                                                           tccgtcggggacgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc           <  2:5108546/98‑1 (MQ=11)
                                                                                            cggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc          <  2:318984/101‑1 (MQ=14)
                                                                                            cggtcgggtccgtggggtccgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc          <  1:2780094/101‑1 (MQ=11)
                                                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc          >  1:6332909‑M2/1‑85 (MQ=255)
                                                                                            cggtcggagccgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc          >  1:4003247‑M2/1‑85 (MQ=255)
                                                                                              gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtggggtccgt        <  2:5875783‑M2/101‑19 (MQ=255)
                                                                                               tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg       >  1:5521348‑M2/1‑82 (MQ=255)
                                                                                                cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtgggaag      >  2:5275648/1‑95 (MQ=11)
                                                                                                cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg      <  2:2641055‑M2/101‑21 (MQ=255)
                                                                                                 gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg     >  1:2680236/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                 ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg     <  1:2438714‑M2/101‑22 (MQ=255)
                                                                                                 ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg     >  2:4670427/4‑101 (MQ=11)
                                                                                                    |                                                                                                     
TTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTC  >  NC_014034/221886‑222086

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 17 ≤  ATCG  < 24 ≤  ATCG  < 33 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG