| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,958 | 0 | A→G | 4.9% | 85.0 ‑4.9 ‑3.1 | 942 | D233D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (34/14): ref base (457/437): total (491/451) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.66e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 7.82e-04 | ||||||||||
Only 100 of 1900 total aligned reads displayed.
GCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT > NC_014034/221859‑222058
|
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat > 1:281739‑M1/98‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc > 1:3759561‑M1/93‑101 (MQ=255)
ggggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc > 2:1075875‑M1/93‑101 (MQ=255)
cccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgg > 2:6200380/1‑101 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatc > 1:6714087‑M1/88‑98 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc < 1:520491‑M1/14‑1 (MQ=255)
tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc < 2:6875531‑M1/14‑1 (MQ=255)
gACGCCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtc < 1:2900653/101‑1 (MQ=255)
gACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtc < 1:4949506/101‑1 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc > 1:4514654‑M1/87‑101 (MQ=255)
cGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgg < 2:1172255/101‑1 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggct < 1:1526010‑M1/22‑3 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggggtcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggat < 2:853279‑M1/22‑1 (MQ=255)
ccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg < 1:6066156‑M1/24‑1 (MQ=255)
ccGAGGCTTCGGTGGTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcg < 1:4251252/101‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgc < 1:6195600‑M1/26‑7 (MQ=255)
tgggatcgggcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:4619776‑M1/75‑101 (MQ=255)
ggggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 1:4160266‑M1/75‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgga < 2:6062020‑M1/30‑2 (MQ=255)
cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg > 2:3536175/1‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggg < 2:325060‑M1/31‑2 (MQ=255)
gggtcggctccctgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc > 2:2009260‑M1/69‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccg < 1:4853728‑M1/34‑1 (MQ=255)
ggcgggtccgtgggatcggtccggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt > 1:1246028‑M1/67‑101 (MQ=255)
tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtg > 1:2634251/1‑101 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggg < 2:2589036‑M1/37‑4 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 1:3438935‑M1/64‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 1:5887640‑M1/64‑101 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 1:3913461‑M1/38‑1 (MQ=255)
ggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga < 1:2053619‑M1/39‑1 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga > 2:300676‑M1/63‑101 (MQ=255)
tggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtggggtcggtcggggccgggggggcg > 1:5437386/1‑97 (MQ=38)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg > 2:3636082‑M1/60‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtg < 2:2856496‑M1/45‑2 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtggggtcggtcg < 2:2133946‑M1/46‑1 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggttcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 1:4388395‑M1/55‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatctgtcggg < 1:31251‑M1/48‑2 (MQ=255)
gcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATc > 1:3239274‑M1/52‑101 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:5930173‑M1/47‑101 (MQ=255)
cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 1:3601882/1‑101 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGAggg < 1:3318439‑M1/56‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:4260484‑M1/43‑101 (MQ=255)
gcgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:6404096‑M1/42‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc > 1:2240484‑M1/42‑97 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc < 1:4711948‑M1/60‑5 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 1:2423695‑M1/60‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:5728556‑M1/41‑101 (MQ=255)
gtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:6586424‑M1/40‑101 (MQ=255)
gatcggtcggatccgtgggatcggtcggctccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcgga > 2:4103107‑M1/36‑100 (MQ=255)
cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg > 2:3452329/1‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgatcggtcggat < 1:5960859‑M1/67‑3 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat < 1:3019169‑M1/67‑3 (MQ=255)
agcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt > 1:6293182‑M1/35‑101 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:1104265‑M1/34‑101 (MQ=255)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 2:3128864‑M1/34‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 2:3950424‑M1/33‑101 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:7109491‑M1/33‑101 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg < 2:4350184‑M1/71‑2 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 2:1752245‑M1/72‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:4337120‑M1/28‑101 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 1:5328799‑M1/74‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 2:7109892‑M1/28‑101 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:1495042‑M1/75‑1 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 1:16912‑M1/75‑1 (MQ=255)
gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:5284276/1‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:4914565‑M1/25‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:4611217‑M1/25‑101 (MQ=255)
ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 2:1331066/1‑101 (MQ=255)
cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcggggcc > 1:5086008/3‑97 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCAGTGGGatcggc < 2:228479‑M1/80‑2 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcgga < 2:273993‑M1/80‑2 (MQ=255)
gtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:1805145‑M1/80‑1 (MQ=255)
ggcGGATGCGGGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:1915966/99‑1 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggg > 1:2721378/1‑100 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGatcggtg < 2:1627964‑M1/81‑2 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:4743081/1‑101 (MQ=255)
gtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 1:954688‑M1/89‑1 (MQ=255)
tgggagcggtcggATACGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCATCGGGTCCGTGGGATCGGtc > 1:6860707/7‑100 (MQ=14)
tcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg < 2:1867106‑M1/90‑1 (MQ=255)
gggggtccgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 1:6997326‑M1/12‑101 (MQ=255)
ggatcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg > 1:5552399/4‑101 (MQ=11)
gtccgtgtgatcggtcggctccgttggatcggtcggggccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:3846593/93‑1 (MQ=11)
atcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:2512084/100‑1 (MQ=11)
tcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 1:100103‑M1/7‑101 (MQ=255)
tccgtcggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 2:6775141/98‑1 (MQ=11)
gcggtcggGCCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 2:566693/100‑1 (MQ=1)
gccgtaggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:5552109/95‑1 (MQ=11)
cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 2:63362/1‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTAGAATCCGTgggggca > 1:3868550/6‑97 (MQ=11)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGAGGGTCGGCGGGAccgg > 2:6656204/5‑101 (MQ=11)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt > 1:3530342/1‑101 (MQ=14)
ttggatcgttcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:5031177/99‑1 (MQ=14)
tgggattggtcgggtcggtgggatcgggcggatccgtgGTATATGTGGGATCGGTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:5437114/99‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCCGTCGGACACGTggggaccgtg > 1:85551/3‑94 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:448857/99‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgggcg > 2:6537395/2‑101 (MQ=14)
gggaccggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:2438620/100‑1 (MQ=14)
ggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:4013641/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGtccgtcgga > 2:5792580/1‑100 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcggtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:1350961/101‑1 (MQ=11)
|
GCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT > NC_014034/221859‑222058
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|