| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,018 | 0 | C→G | 2.6% | 106.9 ‑5.7 ‑2.0 | 2538 | P213P (CCG→CCC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (46/24): ref base (1178/1286): total (1227/1311) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.44e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.80e-03 | ||||||||||
Only 100 of 3076 total aligned reads displayed.
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
|
tgggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:6451763‑M1/39‑101 (MQ=255)
gggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:6571148‑M1/37‑101 (MQ=255)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGggtccgtcggat < 1:3019169‑M1/67‑3 (MQ=255)
tCGACGGTGGGGGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:4701319/101‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:1798244‑M1/33‑101 (MQ=255)
gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:5684440/1‑101 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:4003072‑M1/76‑1 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:554523‑M1/25‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:2682905‑M1/25‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 1:2786418‑M1/24‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:3187428‑M1/21‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:6692328‑M1/21‑101 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATcg > 1:5133287/2‑100 (MQ=14)
gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:6374959‑M1/13‑101 (MQ=255)
ggggGTCGGGCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 1:3523097/100‑2 (MQ=11)
gtccgtgGGATCGGTCGGGTGCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 1:2884531‑M1/8‑101 (MQ=255)
gtccgggggatcgggcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2037349/94‑1 (MQ=11)
ggccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 1:3884720/97‑1 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggattggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:6094914/94‑1 (MQ=11)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:23257/101‑1 (MQ=255)
tcctgcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:6932484/96‑1 (MQ=11)
ccctgcggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:6901368/93‑1 (MQ=14)
cccggggctcggtcggctccgtggggtctggcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:678038/93‑1 (MQ=14)
tctggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcgg < 1:2580879/91‑1 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGAGGGTCGGCGGGAccgg > 2:6656204/5‑101 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggt < 2:2145006‑M1/98‑1 (MQ=255)
gtgGGATCGGGCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:2458246‑M1/4‑101 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:5280758‑M1/99‑1 (MQ=255)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGggatcgggcg < 2:190880‑M1/100‑4 (MQ=255)
cggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtccgccg > 2:3569390/1‑96 (MQ=11)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg > 1:1793955/1‑101 (MQ=14)
gggtcggtcggagccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:6178179/98‑1 (MQ=11)
ggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggg < 1:190883/101‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTAGCGGCCGTGGGACCGGGAGGGCCCGGGGGAtcgtgccg > 2:414598/1‑96 (MQ=9)
ggatcgggcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1703200/101‑1 (MQ=11)
ggatcgggcgggtccgtggggtccgtcggagccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:6802889/101‑1 (MQ=11)
gtccgtcgtgtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat < 1:823907/97‑3 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcggat > 1:6321174/1‑99 (MQ=11)
tcggtgcgatccgttggctcggtcgggtgcgggggatctgtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:3312059/92‑1 (MQ=11)
ctgtcgggtccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:1374880/99‑1 (MQ=11)
cggtcgtctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:1241692/101‑1 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:4307749/1‑101 (MQ=11)
ggtggggtccgttggatcgggcgggtccgtggggtcCGTCTGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:1104417/101‑1 (MQ=14)
ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:4576705/101‑1 (MQ=11)
cgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGCTCGGTCGGGGCCg > 2:751003/2‑101 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt < 1:4072895/101‑1 (MQ=11)
tcgggtgcgtggaatcggacgaatccgtgggatcggGCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 1:7094536/101‑2 (MQ=11)
tcgggtccgtgtgatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg > 2:3075458‑M2/1‑100 (MQ=255)
tcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCggg > 2:6533513/1‑99 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:7063233‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:459572‑M2/1‑99 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:5809328‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtcg > 2:345610/1‑99 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg > 1:4709201/4‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGgg > 2:2036954/4‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGggg > 2:1090386/1‑100 (MQ=14)
gtccttgcgatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:3799172/101‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 1:3289305/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGACCGCGGGATCGGTCGGGACCATGGGATCGTTCAGGACGGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 2:2808456/1‑101 (MQ=2)
tccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATGGGTCGGGTCGGTGGAAtc > 1:2169352/1‑101 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:5787590/101‑1 (MQ=11)
ccgttggagcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:5001459/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGAGGGGTCCGTGGGGtcg > 2:62296/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg > 1:1000254/1‑96 (MQ=11)
cggggtatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg > 2:269816‑M2/1‑93 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:4477228/101‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 2:4272499‑M2/101‑11 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTTGGAACGGACGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:5945200/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggg > 2:2328914/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtggggtccgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc < 1:6053641/101‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg > 1:5521348‑M2/1‑82 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggccggtcgggtccgtgg < 1:5926748‑M2/101‑21 (MQ=255)
cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg < 1:4443203/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccgtggg < 1:1534188‑M2/101‑22 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGGCCGTCGGATCCGGGGGATAGGTCGGGTCCGGGGGACCGggcgggaccggggg > 1:3947655/1‑97 (MQ=2)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGACGGGTTCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg > 2:892953/4‑101 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 2:1509109‑M2/101‑27 (MQ=255)
gtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:5001711‑M2/101‑28 (MQ=255)
tcggatcggtgggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 2:165045‑M2/3‑73 (MQ=255)
cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg < 1:3158466/91‑1 (MQ=11)
cggatcggtgggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 1:4185926‑M2/2‑72 (MQ=255)
gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGCCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg > 1:538289/10‑101 (MQ=14)
gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGa < 1:5649722/101‑1 (MQ=11)
gatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGCTCCGTgggg > 1:1369259/1‑100 (MQ=11)
atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggc > 2:3663463/1‑99 (MQ=11)
tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:527405/101‑1 (MQ=14)
cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGTCGGGTCGGTgggggcg > 2:2929820/1‑97 (MQ=14)
ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:3902590/96‑1 (MQ=14)
ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc < 2:5138229/99‑2 (MQ=11)
tcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCTGTCGGTTGCGGGGGGTCGGGGGGAtcggcg > 2:54120/1‑99 (MQ=2)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 1:1234295/101‑1 (MQ=14)
ggggccgtcgGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg > 2:2595537‑M2/5‑62 (MQ=255)
ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTCGGATCGGTggggttcgcggg > 2:4353006/1‑92 (MQ=11)
cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:3780433‑M2/101‑45 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:3416553‑M2/101‑46 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg < 1:963444‑M2/101‑49 (MQ=255)
gATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 2:485667/101‑1 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 1:4869335‑M2/101‑53 (MQ=255)
cggtcggGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:3619652/101‑1 (MQ=17)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg > 2:2477395‑M2/1‑45 (MQ=255)
|
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|