BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,054	C→G	0.8%	P201P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,054	0	C→G	0.8%	16.3 ‑1.6 ‑0.0	2121	P201P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/16): ref base (900/1198): total (906/1215)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.93e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.95e-01

Only 100 of 2951 total aligned reads displayed.


TCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGT  >  NC_014034/221954‑222154


gggggtcggtcggttccgtgcggtgcggcggggccgggggaTC.GGTCGGAGCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcagtc                                                                                                      <  1:6832698/96‑1 (MQ=2)


 ggggtgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcggtgggatc.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     <  1:836013/95‑1 (MQ=11)


  ggttcggtcggatccggcggatccgtcgggtccgtcggaTC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    <  2:3535218/98‑1 (MQ=14)


  gggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    <  1:2202433/98‑1 (MQ=11)


    gttggtcgggccgggggggtcggtcgggtccgtgggatc.GGGCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                                  <  2:6643769/98‑1 (MQ=14)


    gtcggttgcgtgcgtgggatcggtcgggtccgtgggaTC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                                                  <  2:708691/100‑3 (MQ=11)


    atcggtcgggttcgtaggaccgggcgggtccgtgggAGC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                                                                                  <  2:515142/101‑3 (MQ=11)


    atcaggcgggtccgtggggtccgtcggatacgtgggatc.ggtCGGATCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                                  <  1:4343520/95‑1 (MQ=11)


      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTGGGCCGGGCcc                                                                                                >  2:6196549/1‑101 (MQ=11)


      cggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                <  1:138494/101‑1 (MQ=14)


      cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                <  2:1495739/101‑1 (MQ=11)


       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGATCCg                                                                                               >  1:3730707/1‑101 (MQ=11)


       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTGGGGGCCGGGGGATCGGTCggggcgg                                                                                               >  2:3404555/1‑97 (MQ=11)


        gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.gGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCgg                                                                                              >  2:5431402/1‑100 (MQ=11)


         gcggatccgtgggatcggtcgggtccgggggatc.ggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                             >  2:1653318‑M2/2‑100 (MQ=255)


          tgggtccgttgggtcggtcgggtccgtgggatc.tgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                                            <  1:2666806/100‑3 (MQ=11)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            <  1:4506248‑M2/101‑3 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            <  2:5809328‑M2/101‑3 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                            >  1:6740314‑M2/1‑99 (MQ=255)


          cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGGTAGGGCGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGCCCgcgg                                                                                            >  2:4228251/1‑98 (MQ=11)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                           <  2:633266‑M2/101‑4 (MQ=255)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatc.ggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGgg                                                                                           >  1:3938337/1‑101 (MQ=14)


            ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcgGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGggg                                                                                          >  2:1090386/1‑100 (MQ=14)


            gctccgagggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggatCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                                                                                          >  2:3259501‑M2/3‑97 (MQ=255)


            gatccgtgagatcggtcggatccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                          <  1:1271283/99‑1 (MQ=11)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatc.ggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAt                                                                                         >  2:134465/1‑101 (MQ=14)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATAGGTCCGGTCCGTTgggg                                                                                         >  2:3049999/1‑99 (MQ=11)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggt                                                                                         >  1:5564775/1‑99 (MQ=14)


             atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGgggt                                                                                         >  2:6768645/2‑99 (MQ=11)


              ttcgcgggatcggtcgggtccgtcggctc.ggtcggGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        <  1:7126052/96‑1 (MQ=11)


              tccgtgggatcggtcggatccgtaggatc.ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                                        <  2:3626487/101‑1 (MQ=11)


              gccgtgggatcggtcggatccgtgggatc.ggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                                        >  2:2026446‑M2/2‑95 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTCGGAgcg                                                                                       >  2:2338799/1‑101 (MQ=11)


                ggtgggctccgttggggcggtggggtc.cgtccgCTCCGTGGGATCGATCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccg                                                                                      <  2:1232869/100‑3 (MQ=9)


                cgtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                                                                                      >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)


                cgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggtgcgg                                                                                      <  1:6334123‑M2/101‑9 (MQ=255)


                 gtggggtggggcgggtcccgggggtcggggcgGGT.CGTGGGGTTGGTCGGGTTCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                     <  1:4806847/101‑1 (MQ=2)


                 gtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                                     <  1:111483‑M2/101‑10 (MQ=255)


                  tgtgacctgtctggcccgtggcgtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:6929227/93‑1 (MQ=11)


                  ggggatcggtcggctcggtgggggc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:4107712/100‑1 (MQ=11)


                   gggatcggtcgggtccgtcggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTTGGAACGGACGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   >  2:5945200/1‑101 (MQ=11)


                   gggatcggtcggatccgtgggatc.ggtcggATCCGGGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGATGGGCCGGATCGGTGGGATCGGTGGGGCCCGGGGGGtgggtcg                                                                                   >  2:3147664/1‑101 (MQ=9)


                      gtgtgtggggtccgtggggac.ggcgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                                                <  1:2776283/94‑1 (MQ=11)


                       tcggtcggatccgtgggatc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                                               <  2:56761/101‑1 (MQ=255)


                             ggatccgtgggatc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGACGGGTTCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                                                         >  2:892953/4‑101 (MQ=14)


                               atccgtgggatc.ggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                       >  2:3877837‑M2/2‑78 (MQ=255)


                                    tggggtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtcggtc                                                                  >  1:5072595/1‑100 (MQ=11)


                                     gggatc.ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGTGCGCGgtcgtg.ccctcgggtccggtgc                                                                >  2:2807668/1‑97 (MQ=2)


                                      ggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggctcggtcgg                                                                <  1:4202432‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                       ggtc.ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                               <  2:5306010/99‑1 (MQ=14)


                                       gatc.ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                               >  1:2569182‑M2/1‑70 (MQ=255)


                                        ggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa                                                               <  1:5676192/96‑1 (MQ=11)


                                         tc.ggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                             >  1:6621372‑M2/1‑68 (MQ=255)


                                          c.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                                                            <  2:4595832/101‑2 (MQ=11)


                                           ccgtgggATCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                            <  2:4711708/96‑1 (MQ=17)


                                            ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                           >  1:1942731‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                             gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggt                                                          >  1:2451467/1‑101 (MQ=11)


                                                 ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGGTCGGCTCCGTGGGGGCGGGGGGAtgggacgtg                                                      >  1:1718611/3‑99 (MQ=11)


                                                 gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                      >  1:650149/1‑101 (MQ=11)


                                                  gtcCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                     >  1:2342442‑M2/2‑60 (MQ=255)


                                                   tCCGTGGGGTCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                    >  2:4471708‑M2/1‑59 (MQ=255)


                                                    ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGCGTTGCGTCGGAtcggaggagcgg                                                   >  2:2695519/1‑93 (MQ=11)


                                                     cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                  <  1:466283‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                      gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGCGGGGGCCGTGGGAtcggtcgggcccgg                                                 >  1:184560/1‑95 (MQ=11)


                                                       tGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                <  1:494747‑M2/101‑47 (MQ=255)


                                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcg                                               <  1:5448302‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                         ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                              >  1:5316153/1‑101 (MQ=255)


                                                          ggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                             <  1:2063368/99‑1 (MQ=17)


                                                          gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgga                                             <  2:6529770‑M2/101‑50 (MQ=255)


                                                           aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                            <  1:6181720‑M2/101‑51 (MQ=255)


                                                             cggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                          >  2:1909801‑M2/1‑49 (MQ=255)


                                                             cgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                          <  1:3147777/101‑1 (MQ=17)


                                                                    gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGt                                   >  2:3963780/1‑101 (MQ=14)


                                                                    gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                   >  1:5184274/1‑101 (MQ=11)


                                                                       cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                >  1:975123‑M2/1‑39 (MQ=255)


                                                                          gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggaccggtcg                             <  1:6964456‑M2/101‑66 (MQ=255)


                                                                          gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtag                             >  1:3381069/1‑99 (MQ=17)


                                                                          cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGgg                             >  1:3489249/2‑101 (MQ=17)


                                                                             aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTgggat                          >  2:3759400/1‑99 (MQ=14)


                                                                                ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtgg                       <  1:2877982/101‑1 (MQ=255)


                                                                                ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcgg                       >  2:2152083/1‑96 (MQ=14)


                                                                                 gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                      <  2:2913204/101‑7 (MQ=11)


                                                                                  tcggactggggggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtg                     <  1:6063849/91‑1 (MQ=18)


                                                                                     ggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                  >  1:3589241‑M2/3‑25 (MQ=255)


                                                                                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcggga                  <  1:3001447‑M2/99‑77 (MQ=255)


                                                                                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                 >  1:3870273‑M2/2‑24 (MQ=255)


                                                                                       tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatc                <  2:2595762‑M2/101‑79 (MQ=255)


                                                                                          gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt             <  2:5550263‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                           tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggtc            >  2:180261‑M2/1‑19 (MQ=255)


                                                                                              gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgga         >  1:580793‑M2/1‑16 (MQ=255)


                                                                                               atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcgggt        <  1:3259617‑M2/101‑87 (MQ=255)


                                                                                                tcggtcgtttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc       >  2:2484273‑M2/1‑14 (MQ=255)


                                                                                                tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc       >  2:6065844‑M2/1‑14 (MQ=255)


                                                                                                tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc       >  1:4041490/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc      >  2:5004832‑M2/1‑13 (MQ=255)


                                                                                                 cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc      >  2:4874251‑M2/1‑13 (MQ=255)


                                                                                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg     <  1:1570834‑M2/101‑90 (MQ=255)


                                                                                                   gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg    <  2:4350184‑M2/101‑91 (MQ=255)


                                                                                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg  >  1:5939477‑M2/1‑9 (MQ=255)


                                                                                                     cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGtcgggagggccggccg  >  2:770763/1‑93 (MQ=11)


TCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGT  >  NC_014034/221954‑222154

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG