Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_014034 222,063 A→G 100% P198P (CCT→CCC RCAP_rcc00185 ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_014034222,0630A→G100.0% inf 1084P198P (CCT→CCCRCAP_rcc00185hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (194/296):  ref base (196/160):  total (499/585)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.04e-05
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.10e-02

Only 100 of 1335 total aligned reads displayed.

CGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGC  >  NC_014034/221964‑222163
                                                                                                   |                                                                                                    
 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                                    <  1:3577103/101‑1 (MQ=11)
 ggatccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                                                                    <  1:4848484/98‑1 (MQ=11)
  ggtccgtggggtcagtcggcgccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                                   <  2:3481828/101‑1 (MQ=11)
  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGa                                                                                                   >  2:5378989/1‑101 (MQ=14)
  ggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                                   <  1:6909119/101‑1 (MQ=11)
  gatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                                                                                   <  1:1893723/99‑1 (MQ=11)
   gtccgtgtgatcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                  <  2:4377799/101‑1 (MQ=11)
   gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggaccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                  <  1:4967329/101‑1 (MQ=11)
    tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCtc                                                                                                 >  1:1229012/1‑101 (MQ=11)
    tccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                                                 <  2:3626487/101‑1 (MQ=11)
    tccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 <  2:1378068/101‑1 (MQ=11)
    tccgtgggaccggtcggatccgttgggtcgctccgGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                 <  2:3789259/101‑1 (MQ=11)
    ggcgggggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                 <  1:4301255/96‑1 (MQ=11)
    gccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                                                 <  2:6654000/100‑1 (MQ=11)
     gctggggatgggtcgggtccgtcggatcgggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                                                                <  2:410837/97‑2 (MQ=11)
     gcgtgggatgggtggggtccgggggatcggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                <  1:414602/100‑1 (MQ=11)
     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGAGGGGTCCGTGGGGtcg                                                                                                >  2:62296/1‑101 (MQ=11)
     ccgggggatcgttcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                                                                <  2:1695603/101‑2 (MQ=11)
      cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                                                                                               >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)
      cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGTGAtcgg                                                                                               >  1:6515203/1‑101 (MQ=14)
       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGAGGGATCGAGCGGCACCGTGGGAtcggc                                                                                              >  2:265031/1‑100 (MQ=11)
        tgtgacctgtctggcccgtggcgtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  2:6929227/93‑1 (MQ=11)
         tggatcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            <  2:3907086/100‑1 (MQ=14)
         gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            >  2:5868475/1‑101 (MQ=11)
          ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcagatcg                                                                                           >  1:3447946/1‑95 (MQ=11)
             tcggtcggttccgtgggctcggtcggCTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                                        <  2:1857066/101‑1 (MQ=14)
             tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                                        <  2:6122379/101‑1 (MQ=11)
             tcggtcggatccgtgggatccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgcgtc                                                                                        <  1:5596805/101‑1 (MQ=11)
              cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                                                                       <  1:5465166/101‑1 (MQ=255)
              cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGTGGGATCGgcggggtcc                                                                                       >  2:4504377/1‑101 (MQ=14)
                gtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcggatccgt                                                                                     >  1:1125803/1‑101 (MQ=11)
                  cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtgggaag                                                                                   >  2:5275648/1‑95 (MQ=11)
                   gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggggg                                                                                  >  1:786197/1‑97 (MQ=11)
                   gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                                  >  1:2680236/1‑101 (MQ=11)
                   ggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                                  >  1:5320071/4‑101 (MQ=11)
                     gtccgtgggatcgggcggGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                                                                                <  1:3894843/101‑3 (MQ=11)
                      tcggtgggatgggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatc                                                                               <  1:6666546/98‑1 (MQ=14)
                        cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                                                             >  1:5941189/1‑101 (MQ=14)
                        cgtgggctcggtcgtGTGCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                                                             <  2:567979/101‑1 (MQ=11)
                         gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt                                                                            >  1:6775495/1‑101 (MQ=11)
                          gcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTg                                                                           <  1:256659/93‑1 (MQ=11)
                           cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                                                                          >  2:5979086/11‑101 (MQ=11)
                           aggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                                                                          <  1:178635/100‑1 (MQ=14)
                            gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtcggatccgtctg                                                                         >  2:323856/7‑98 (MQ=11)
                            gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                                                                         >  1:6122691/7‑101 (MQ=11)
                            ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                                                         >  1:2017793/1‑101 (MQ=14)
                             ggtcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgggg                                                                        <  2:2851123/99‑2 (MQ=11)
                             ggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                                        >  1:5176349/9‑101 (MQ=11)
                             ggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                                        >  2:2001453/9‑101 (MQ=11)
                             ggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGa                                                                        <  1:5676192/96‑1 (MQ=11)
                              gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGag                                                                       >  1:1707015/5‑100 (MQ=11)
                               tcggtcggGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtc                                                                      <  2:1525950/101‑1 (MQ=11)
                               tccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                                      <  2:2721276/98‑1 (MQ=11)
                               tccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                                                      <  2:7051388/98‑1 (MQ=11)
                                cggtcgtGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     <  2:5519396/101‑1 (MQ=14)
                                cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcg                                                                     >  1:4676487/1‑101 (MQ=14)
                                cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGTCGGGTCGGTgggggcg                                                                     >  2:2929820/1‑97 (MQ=14)
                                ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     <  2:4908699/96‑1 (MQ=14)
                                ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcaggatc                                                                     >  2:2235976/3‑94 (MQ=11)
                                  gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   >  1:7071159/4‑101 (MQ=14)
                                  gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGCCCGTGGGAtgggt                                                                   >  1:2260620/4‑101 (MQ=14)
                                  gtcggGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  1:4017682/101‑1 (MQ=11)
                                  gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                                                                   <  2:3701981/101‑1 (MQ=11)
                                  gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCATCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                                                                   >  2:4235508/1‑101 (MQ=11)
                                  ggcgggggcGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgt                                                                   <  2:5017818/93‑1 (MQ=11)
                                   tgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAacggtc                                                                  >  1:2980436/3‑101 (MQ=14)
                                   gcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                  <  2:6818449/100‑1 (MQ=11)
                                     ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                <  2:6541102/101‑1 (MQ=11)
                                       gtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGAtcggtcgggt                                                              >  2:5154304/2‑99 (MQ=14)
                                          ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                           >  2:757358/5‑101 (MQ=17)
                                           gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                          >  1:2804519/4‑100 (MQ=17)
                                           gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgc                                                          >  2:2408038/4‑100 (MQ=17)
                                                gtccgtggggTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                     <  1:3352681/94‑1 (MQ=18)
                                                cgcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                     <  1:6362794/99‑1 (MQ=255)
                                                atgcgtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     <  2:2145274/97‑1 (MQ=17)
                                                  cgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                   <  1:3147777/101‑1 (MQ=17)
                                                   ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcgg                                                  >  2:4759779/1‑101 (MQ=14)
                                                   cgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  >  1:2480333/5‑101 (MQ=255)
                                                    gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                 >  2:883070/4‑101 (MQ=255)
                                                          gcgctGGGATCGGTCTGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCCTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                           <  2:462340/97‑1 (MQ=18)
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                                                           ccGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGcc                                          >  1:3249893/1‑101 (MQ=17)
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                                                                ggATCGGGCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                     <  1:5833775/101‑1 (MQ=17)
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                                                                 gATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTagga                                    <  1:4505368/101‑2 (MQ=17)
                                                                  aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.TAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGCCGGGTCCGTggggtg                                  >  2:1249489/1‑99 (MQ=18)
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                                                                                                  tAGGAACGGACGGGACCGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATAGGTAGGGGCCGCAGGGCTGAAGGGCACAGTCGAACAGCCGTcgacgcc  >  2:253978/1‑100 (MQ=9)
                                                                                                   |                                                                                                    
CGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGC  >  NC_014034/221964‑222163

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 17 ≤  ATCG  < 24 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG