| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 678,816 | T→C | 10.2% | A1597A (GCA→GGC) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 678,816 | 0 | T→C | 10.2% | 74.7 ‑0.3 ‑0.3 | 342 | A1597A (GCA→GCG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (18/17): ref base (171/136): total (189/153) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.20e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.22e-01 | ||||||||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
TCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCA > NC_014034/678716‑678916
|
tCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGt < 1:5860979/101‑1 (MQ=255)
ccGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgcc > 1:5223677/1‑101 (MQ=255)
ccATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgcc > 1:3955586/1‑101 (MQ=255)
ccATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgcc < 1:1632994/101‑1 (MQ=255)
ccATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTgccgcc < 2:6548328/101‑1 (MQ=255)
cATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCt > 1:2162106/1‑101 (MQ=255)
agaCCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTg > 2:2438630/1‑101 (MQ=255)
ccGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTc < 1:822271/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCa > 2:4993556/1‑101 (MQ=255)
aaaGCTGTGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAgc > 1:5800819/1‑101 (MQ=255)
aaaGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAgc > 2:1333802/1‑101 (MQ=255)
aaGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAgcg > 1:3027975/1‑101 (MQ=255)
gccgcaccagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGcc > 2:4535340/11‑101 (MQ=2)
gCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGcc > 2:6775805/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGGCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGccg > 2:724085/1‑100 (MQ=255)
cTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCa < 1:6514674/101‑1 (MQ=255)
tGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCAc > 1:2773103/1‑101 (MQ=255)
gggCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACg < 1:5424453/101‑1 (MQ=255)
gggCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACg > 1:4129118/1‑101 (MQ=255)
gggCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACg < 1:6240682/101‑1 (MQ=255)
caccagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGa > 1:1469312/7‑101 (MQ=2)
cGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATg > 1:3724814/1‑101 (MQ=255)
cGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATg > 2:193660/1‑101 (MQ=255)
gATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGt > 1:4641203/1‑101 (MQ=255)
gATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGt > 1:6948964/1‑101 (MQ=255)
cagatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 2:3420637/4‑101 (MQ=2)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc < 1:498704/101‑1 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 1:6616062/1‑101 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc < 2:1986387/101‑1 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 2:6037160/1‑101 (MQ=255)
atatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTc > 2:923265/1‑101 (MQ=255)
agatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 1:6159949/3‑101 (MQ=2)
agatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc < 1:5694129/99‑1 (MQ=2)
agatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGACGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc < 1:1054076/99‑1 (MQ=2)
tatCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:3156803/1‑101 (MQ=255)
gatCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:2516627/2‑101 (MQ=2)
atCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 2:6381093/101‑1 (MQ=2)
atCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAt < 2:4088265/101‑1 (MQ=255)
tcggcgGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGC.GCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAtc < 2:6864422/98‑2 (MQ=9)
tCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAtt < 2:252397/101‑1 (MQ=255)
tCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCAtt < 2:4362564/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTc < 2:5434224/101‑1 (MQ=255)
cgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTg > 1:7108871/1‑101 (MQ=255)
cgGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTg < 1:1985344/101‑1 (MQ=255)
tttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGccc > 1:4743349/1‑101 (MQ=255)
ttCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCa < 2:3574167/101‑1 (MQ=255)
tCCAGGGCCGCGATCTGNGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAg < 2:472821/101‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCACCACGATGTCATTCGTGCCCAg < 1:5946650/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGcc > 1:5261558/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGccc > 1:2056672/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGccc < 1:4921522/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCt < 2:1643832/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCtt < 2:5906340/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCtt < 1:4949747/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCtc > 2:535090/1‑100 (MQ=255)
ccgcGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTc < 1:4291408/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa < 2:1108074/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa < 1:377365/101‑1 (MQ=255)
cgcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCa > 2:2941845/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAg > 2:5085852/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAg > 2:1301541/1‑101 (MQ=255)
cgATCTGCGCCGCGCTCAGCGCCGCGATCTGCGCCGAGCCGAGCC.CGCCGACCGCGGCACTGGCCAGCGCCGCGACCTGATCCGTGCCCAgactggccagc > 2:6707781/1‑91 (MQ=2)
gATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcg > 1:2719439/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcg > 2:3214865/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcg > 2:6604645/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcgc > 2:6237355/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAgcgc > 2:5603079/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgcc > 1:2376506/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGcgccg < 1:6368337/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGCTGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCcgcg > 2:5246317/1‑101 (MQ=255)
gcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGt > 2:3010622/1‑101 (MQ=255)
gcCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGt < 2:3765407/101‑1 (MQ=255)
gTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCt < 2:6948591/101‑1 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTc > 1:3412940/1‑101 (MQ=255)
gCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCa > 1:1797172/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAgc < 1:6808340/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAgcg < 2:1750730/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAgcg > 2:3806788/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAgcgc < 2:5800517/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGcc > 2:3953695/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGcc < 2:2151717/101‑1 (MQ=255)
ccgcGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCg > 1:330540/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGAt < 2:2820666/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGTCGCGCTCAGCGGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATc < 1:4361287/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATc < 1:3889591/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCg > 2:4171550/1‑101 (MQ=255)
cTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGccc < 2:3251282/101‑1 (MQ=255)
gCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCg < 2:2056592/101‑1 (MQ=255)
gTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGt > 2:1492005/1‑101 (MQ=255)
tCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTc < 1:968541/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCg > 1:1186376/1‑101 (MQ=255)
cgcTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGAc < 1:2438724/101‑1 (MQ=255)
cgcTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGAc < 2:3439433/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCTACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCGCCGGTCGACAgc < 1:5119071/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAgc < 1:1920022/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAgc < 1:2941954/101‑1 (MQ=255)
aGCCGTGCCGCCTGG.CCCGTGGTCAGNNCCNCGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAgcgc < 1:5511590/101‑1 (MQ=255)
gTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCNCGGTCGACAGCgccgcc > 2:856078/1‑101 (MQ=255)
gTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCgccgcc < 1:1375046/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCa < 1:5161967/101‑1 (MQ=255)
|
TCCCCGCCATGGCCGAGACCGAAAGCTGGGCGATATCCGCGGTTTCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGATCTGCGTCGCGCTCAGCCGTGCCGCCTGC.GCCGTGGTCAGCGCCACGATGTCATTCGTGCCCAGCCCCTTCAGCGCCGCGGTGCTCAGCGCGCCGATCGCCCCGGTCGACAGCGCCGCCA > NC_014034/678716‑678916
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 30 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|