Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 681,481 | C→A | 21.2% | G709V (GGC→GTA) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 681,481 | 0 | C→A | 21.2% | 177.4 ‑2.7 ‑0.1 | 302 | G709V (GGC→GTC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/37): ref base (132/106): total (159/143) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.73e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.20e-01 |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
CCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAC > NC_014034/681381‑681581
|
cGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCg > 1:175494/1‑101 (MQ=255)
ggCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGa > 2:2623441/1‑101 (MQ=255)
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAt < 1:4650493/101‑1 (MQ=255)
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAt < 1:2263511/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTg > 1:4124744/1‑101 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTg > 1:362498/1‑101 (MQ=255)
cGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTgcg > 2:1328201/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGcc > 2:6584258/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCg > 1:5745233/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCg > 1:4052557/1‑101 (MQ=255)
ccGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAg < 1:4209453/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGc > 2:4129041/1‑101 (MQ=255)
agcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGccc > 2:3579797/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCa < 1:4406728/101‑1 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAg < 1:1044410/101‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc < 1:2626774/101‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc < 2:5468187/101‑1 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc > 1:6106615/1‑101 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc < 2:2083177/101‑1 (MQ=255)
tcctcggtgcTGATCTGCGCCAGATTCGCCGGCTCGAGCGCCGCGACCTGCGTGCTGTTCAGCGCGCAGAT.CTGCGCCCAGCCGAGATGCGCTGCCTgctc > 2:3516807/9‑99 (MQ=255)
gcCGTCGCGCTGATCTGCGCCGGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcgc < 2:5858508/101‑1 (MQ=255)
gcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcgc < 2:538015/101‑1 (MQ=255)
gTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgt < 2:2749130/101‑1 (MQ=255)
gTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgt > 1:1665798/1‑101 (MQ=255)
gTCCCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgt < 2:2953302/101‑1 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc > 1:3846750/1‑101 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc > 2:211815/1‑101 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 1:5917029/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa < 1:2979479/101‑1 (MQ=255)
cTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAg > 2:3337847/1‑101 (MQ=255)
cTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAg > 2:4017661/1‑101 (MQ=255)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:5049895/92‑1 (MQ=2)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCGGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 1:1267621/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 1:4533028/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 1:5960451/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:1639376/101‑1 (MQ=255)
gccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:1785488/95‑1 (MQ=2)
ccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 1:6327368/96‑1 (MQ=2)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 2:4971896/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 2:3422750/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 1:3963508/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:747290/101‑1 (MQ=255)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:231204/97‑1 (MQ=2)
gcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:529540/101‑1 (MQ=255)
cAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGTTGt > 2:3771676/1‑101 (MQ=2)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc < 1:2743221/101‑1 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGGCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTTCGCCGTCGCACGCGTCTCGATGTc > 2:1110867/1‑101 (MQ=25)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGATGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 1:3713877/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 2:3034504/101‑1 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:3313505/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 2:1715029/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 2:6004962/1‑101 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:7017639/101‑1 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:6444442/101‑1 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 2:4879981/11‑101 (MQ=9)
gccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGt > 2:421249/1‑101 (MQ=255)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:1037426/9‑101 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 1:7097368/7‑101 (MQ=9)
gccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:6257624/101‑1 (MQ=255)
tttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg < 1:6054484/96‑2 (MQ=9)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa > 1:2363580/1‑101 (MQ=255)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccga > 1:5463988/5‑99 (MQ=2)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag < 2:4850458/98‑4 (MQ=9)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag < 1:6960136/98‑4 (MQ=9)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 1:3451612/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 2:2378513/1‑101 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg < 2:3254667/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg > 2:1899488/1‑101 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 1:6724316/101‑1 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 1:2767272/101‑1 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc < 2:6281244/100‑6 (MQ=9)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:3190736/2‑96 (MQ=2)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc < 1:2644158/101‑1 (MQ=9)
gcgcCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcg < 1:5642217/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGCGCCGAGGccc < 1:6624869/101‑2 (MQ=9)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct < 1:5089339/101‑3 (MQ=9)
ccgcAACCTGCGTGCTCGCCAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 2:6839919/101‑5 (MQ=2)
cgcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGa > 1:4432873/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 2:6428237/101‑1 (MQ=255)
tgtCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:6922615/99‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 2:4611648/1‑101 (MQ=255)
tCTGCTTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc < 2:592949/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc > 2:4371042/1‑101 (MQ=255)
ccTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGTCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCACCTGATcgca > 2:2222327/2‑100 (MQ=2)
cTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccg < 1:4957250/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCACCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgcattg < 2:1259152/101‑5 (MQ=0)
gggCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 1:131929/99‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 2:5580703/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:5198170/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc > 2:2543454/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCNNNcn > 1:6741340/1‑100 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:3065129/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg < 2:1503239/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg > 2:1781979/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGACAAAGCAGCGGATCGCCGCCGTGccagatc > 1:1222562/1‑96 (MQ=255)
aGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc > 1:1886389/1‑101 (MQ=255)
aGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc > 1:919335/1‑101 (MQ=255)
cgcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCgccgcc < 2:5744931/101‑1 (MQ=255)
gcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa < 2:632945/101‑1 (MQ=255)
ccGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAc > 2:7046074/1‑101 (MQ=255)
|
CCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAC > NC_014034/681381‑681581
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|