| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 2,304,900 | 2 bp→CA | 100% | coding (2674‑2675/2808 nt) | RCAP_rcc02139 ← | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 2,304,900 | 0 | A→C | 100.0% | 841.0 | 240 | V892G (GTA→GGA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (103/137): ref base (0/0): total (103/137) | ||||||||||
| * | NC_014034 | 2,304,901 | 0 | C→A | 100.0% | 852.1 | 240 | V892L (GTA→TTA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (103/137): ref base (0/0): total (103/137) | ||||||||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TGATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATG.C.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304807‑2304988
||
aTAATCTTGCGCAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCg < 2:3912859/101‑1 (MQ=255)
aaTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCa > 2:5340021/1‑101 (MQ=255)
aaTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCa > 1:6444052/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGCGCAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g < 1:6547323/101‑1 (MQ=255)
aTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g > 2:3744147/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g > 1:240451/1‑101 (MQ=255)
aTCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g > 1:2210946/1‑101 (MQ=255)
aTCTTCCGCAAACCCCGGCCGGACCCGGCCTGTCGGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g < 1:355281/101‑1 (MQ=255)
aTCTGGCGCAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.g < 2:4753883/101‑1 (MQ=255)
ttGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCC.gggg > 2:2131468/1‑99 (MQ=255)
ttGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggt > 2:2138685/1‑99 (MQ=255)
tGCGAAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtc < 2:758996/101‑4 (MQ=255)
gcgcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.ggggct > 2:6310105/1‑97 (MQ=255)
gcAAACCTCGGCCGGATCGGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgc < 2:1437781/101‑1 (MQ=255)
gcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgc > 1:1824570/1‑101 (MQ=255)
aaacCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgcgc < 1:2992561/101‑1 (MQ=255)
aaaaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgcgc > 2:4634810/1‑101 (MQ=255)
aaccTCGGCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGcc < 2:2831927/98‑1 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGccc > 2:4215215/1‑100 (MQ=255)
ccTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGACGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTc < 1:6374847/100‑1 (MQ=255)
acgcGGCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTc < 1:2642256/98‑1 (MQ=255)
cgccctgctCCGGCCTGCCGCCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGcc < 2:916111/93‑1 (MQ=255)
cGGCCGGACCGGCCCTGTCGGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGcc < 2:3038778/101‑1 (MQ=255)
ggCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc > 1:3235891/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc > 2:6542893/1‑101 (MQ=255)
gCCGGATCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCca < 2:4707219/101‑1 (MQ=255)
gCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCca < 1:6643723/101‑1 (MQ=255)
cGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagc > 2:4250985/1‑101 (MQ=255)
cGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagc < 2:2597330/101‑1 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGAGCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 1:5101889/1‑101 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 1:4046002/1‑101 (MQ=255)
cgacccGCCCTGCCACCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca < 2:2260981/97‑1 (MQ=255)
ccGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcgc > 2:4077851/1‑101 (MQ=255)
ccGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcgc > 2:5739376/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGcc > 1:1357867/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGcc < 1:5037660/101‑1 (MQ=255)
gCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTg < 1:2087102/101‑1 (MQ=255)
ccTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGc > 1:7094569/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGGCTCCGGCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc > 2:1556753/1‑101 (MQ=255)
cggCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc < 2:1978750/99‑1 (MQ=255)
cggCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc < 1:4869510/99‑1 (MQ=255)
cAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc < 1:2332902/101‑1 (MQ=255)
cAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc > 2:5086751/1‑101 (MQ=255)
cAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc > 1:5186159/1‑101 (MQ=255)
cAGCCGGCCTGCCGAAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc < 1:3061666/101‑1 (MQ=255)
aGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgcg > 1:272667/1‑101 (MQ=255)
gCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCgg > 2:6078900/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGcc < 2:1112978/101‑1 (MQ=255)
ggCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcg < 1:622012/101‑1 (MQ=255)
ggCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcg > 1:7041963/1‑101 (MQ=255)
ccTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcgcg < 1:1687403/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCcgcg > 2:6724668/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGtt > 1:3785677/1‑101 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt < 2:1306112/101‑1 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt < 2:1766830/101‑1 (MQ=255)
ccGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGtttt < 1:5540415/101‑1 (MQ=255)
cAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCt < 2:4920229/101‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGGGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTc < 1:5625049/101‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTc < 1:294601/101‑1 (MQ=255)
aCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCg < 1:1008676/101‑1 (MQ=255)
cggcggCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGa > 2:3861333/1‑101 (MQ=255)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc < 2:6119231/101‑1 (MQ=255)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc > 1:6915467/1‑101 (MQ=37)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc < 2:2547241/101‑1 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt < 1:2492493/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACGTc < 1:6188947/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATc < 1:4223455/101‑1 (MQ=25)
cgcCGGTGGCG.CCTGCATGCC.GAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGCTTTCCTCGAACATcg < 1:6849405/101‑1 (MQ=25)
gcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgc > 1:3393547/1‑101 (MQ=25)
gcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgc < 1:4204083/101‑1 (MQ=25)
gcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgc > 2:120584/1‑101 (MQ=25)
ccGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgcc < 1:5949433/101‑1 (MQ=25)
cGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccg < 1:2181545/101‑1 (MQ=25)
cGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccg < 2:2943584/101‑1 (MQ=25)
ggTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccgc > 2:6943210/1‑101 (MQ=25)
gTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 2:5216557/1‑101 (MQ=25)
gTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 1:527195/1‑101 (MQ=25)
tGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAt < 1:949662/101‑1 (MQ=25)
tGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAt > 2:3575119/1‑101 (MQ=21)
gggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAt < 1:5321685/96‑1 (MQ=25)
ggcgccggCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt < 2:2014818/94‑1 (MQ=21)
ggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCCtt > 1:1572485/5‑101 (MQ=25)
ggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt < 1:6079212/97‑1 (MQ=25)
gcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtg < 2:3864899/98‑1 (MQ=25)
cgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgt < 1:4572113/99‑1 (MQ=25)
gccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgtg < 1:3318008/100‑1 (MQ=25)
gccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgtg < 2:2424462/100‑1 (MQ=25)
ccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGc > 2:4120180/1‑101 (MQ=21)
cTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCt < 1:4530002/101‑1 (MQ=25)
tGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTg > 2:1816391/1‑101 (MQ=21)
gCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 1:3189745/1‑101 (MQ=21)
gcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGa < 1:6743600/98‑1 (MQ=25)
cggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 1:2138765/99‑1 (MQ=25)
cggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGAc < 1:4984472/99‑1 (MQ=25)
gAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCt > 1:4691551/1‑101 (MQ=21)
gAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCt < 1:1556813/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCCGCCCCCGCAGGGGCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 2:5404861/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg > 2:5045786/1‑101 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 1:3914971/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 2:3235775/101‑1 (MQ=21)
||
TGATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATG.C.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304807‑2304988
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|