Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,974,330 | +G | 98.7% | intergenic (‑23/+32) | rpe1 ← / ← cbbM | ribulose‑phosphate 3‑epimerase/ribulose bisphosphate carboxylase large subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,974,330 | 1 | .→G | 98.7% | 5.6 ‑1.0 ‑0.4 | 392 | intergenic (‑23/+32) | rpe1/cbbM | ribulose‑phosphate 3‑epimerase/ribulose bisphosphate carboxylase large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (200/186): ref base (4/1): total (204/188) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.74e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.71e-01 |
Only 100 of 418 total aligned reads displayed.
TTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GGGC..GG.GGT.G.T.CCCCCGCCCGGATAGCACCGGCGTTCAGTTAACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAA > NC_014034/1974235‑1974421
|
ttCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGC..gg.ggg > 1:2729682/1‑100 (MQ=255)
aCGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGC..gg.gggtgt < 1:1970542/101‑5 (MQ=255)
ggCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGC..gg.gggggtcc > 1:6349354/1‑95 (MQ=255)
gCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.ccc < 1:2108033/101‑1 (MQ=255)
gCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGC..gg.gggtggcgc > 1:2912542/1‑94 (MQ=255)
ccGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.cccc < 2:5217556/101‑1 (MQ=255)
gAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.cccccc < 1:2548425/101‑2 (MQ=255)
aaaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.ccccccg < 1:3170549/101‑3 (MQ=255)
aaaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.ccccccg > 2:843760/1‑99 (MQ=255)
aaTCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.ccccccgc > 2:694902/1‑98 (MQ=255)
tCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.T.ccccccgccc < 1:5009754/101‑6 (MQ=255)
cGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCcccgcccg > 2:807352/1‑101 (MQ=255)
cGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCcccgcccg < 2:8350604/101‑1 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAATGTGATGTCGGTCCCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGAt < 1:7507307/101‑1 (MQ=255)
cGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGAt > 1:3945363/1‑101 (MQ=255)
gAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATa < 1:3459793/101‑1 (MQ=255)
aaGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAg < 1:818035/101‑1 (MQ=255)
aaGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAg > 2:7621494/1‑101 (MQ=255)
aGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGc < 1:7324257/101‑1 (MQ=255)
gTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCa < 2:7134194/101‑1 (MQ=255)
gTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCa < 2:3998706/101‑1 (MQ=255)
ggCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcgg > 1:701016/1‑99 (MQ=255)
ggCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcgg > 2:2627251/1‑99 (MQ=255)
gCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcggc > 2:2088685/1‑98 (MQ=255)
gCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCAcggc > 1:5881120/1‑98 (MQ=255)
cAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGC.G.TCCCCCCGCCCGGATAGcgcggcg > 2:4213763/1‑95 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGt > 2:3043215/1‑101 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGt > 1:7984349/1‑101 (MQ=255)
aGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGt > 2:938371/1‑101 (MQ=255)
gAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGGCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGtt > 1:4776013/1‑101 (MQ=255)
aaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCa < 1:1736993/101‑1 (MQ=255)
aaGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCa > 1:5186438/1‑101 (MQ=255)
aGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAg < 1:4568302/101‑1 (MQ=255)
ggATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGt > 1:1862712/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCCCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGACAGCA.CGGCGTTCCGt > 2:8948512/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAGGGGGCGATCGTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGt < 2:7100984/101‑1 (MQ=255)
aTCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttc > 1:8573226/1‑100 (MQ=255)
tCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACTGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttca < 2:7326141/101‑3 (MQ=255)
tCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttca < 1:5094495/101‑3 (MQ=255)
ctgAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGttca < 1:944027/99‑3 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGGGGGGTTGGGGGG..GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGC.CGGGGGTTCAGttcagc > 2:8693252/1‑97 (MQ=255)
gAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACg > 2:7684243/1‑101 (MQ=255)
aGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATCGCA.CGGCGTGCAGTCCACGc > 2:1496893/1‑101 (MQ=255)
aGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGc > 2:3137852/1‑101 (MQ=255)
gggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCa < 1:4161707/101‑1 (MQ=255)
gggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCa < 1:1391578/101‑1 (MQ=255)
ggCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCag > 2:3419576/1‑101 (MQ=255)
gCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCaga > 2:913538/1‑101 (MQ=255)
cGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCagag > 2:4870554/1‑101 (MQ=255)
gATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGc > 1:7618925/1‑101 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc < 2:7930730/101‑1 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc > 1:3472012/1‑101 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc < 1:6738129/101‑1 (MQ=255)
cTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAc < 2:5612566/101‑1 (MQ=255)
ttGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGGGGGGTTG.GGGCG.GG.GGG.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcg > 1:5226584/1‑101 (MQ=255)
ttGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcg > 2:5084334/1‑101 (MQ=255)
tGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgc > 1:1528665/1‑101 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcgcg < 2:9093456/101‑1 (MQ=255)
gATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGAcaga > 2:6631499/1‑98 (MQ=255)
gggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGcc < 2:3807306/100‑1 (MQ=255)
ggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCa < 2:6402645/101‑1 (MQ=255)
ggAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCa > 2:3486810/1‑101 (MQ=255)
aCGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGA.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCCGAGCGACGCGCCAGcc > 2:648391/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGccc > 1:6116947/1‑101 (MQ=255)
cGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GGGCCGGG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCCGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGccc < 1:6523021/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCg > 1:8271375/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCg < 2:4625414/101‑1 (MQ=255)
gTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCgg > 2:1321017/1‑101 (MQ=255)
gTCGAAGGTCATGTCGGGCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTTACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCgg < 1:7820577/101‑1 (MQ=255)
tCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGa > 2:1674245/1‑101 (MQ=255)
ggAAGGTCATGTCGGTTTCCTGAGGGGTTGGGGGG..GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGAt < 1:1028674/100‑1 (MQ=255)
tccgatcttGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATa < 1:4469107/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATa > 2:7436359/1‑101 (MQ=255)
aaGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATag < 2:1976010/101‑1 (MQ=255)
ggTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATagag < 1:1317581/101‑1 (MQ=255)
taTGGCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt < 1:1130839/100‑1 (MQ=255)
cATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGTGG.C.CCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt < 1:2220424/101‑1 (MQ=255)
cATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt > 1:4930499/1‑101 (MQ=255)
cATGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCtt > 1:8904490/1‑101 (MQ=255)
aTGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTg > 2:2207621/1‑101 (MQ=255)
aTGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTg > 1:9142140/1‑101 (MQ=255)
tGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATaagatcgga > 2:4468972/1‑93 (MQ=255)
tGTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGt > 1:9117341/1‑101 (MQ=255)
tGTAGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGt > 1:7234118/1‑101 (MQ=255)
gTCGGTGTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTc < 1:6905783/101‑1 (MQ=255)
gTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTc < 2:5797769/101‑1 (MQ=255)
gTCGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTc < 2:1750465/101‑1 (MQ=255)
cGGTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCgg > 1:3004844/1‑101 (MQ=255)
gTCTCCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCa > 1:1256800/1‑101 (MQ=255)
tctcCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCAt < 1:2399668/101‑1 (MQ=255)
ctcCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATc > 1:4325843/1‑101 (MQ=255)
ctcCTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATc > 1:3693936/1‑101 (MQ=255)
ccTGAGGGGTTG.GGGC..GGAGGA.GCC.CCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGGTAGAGCGTGTCgggcacgt > 2:2895398/1‑95 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt > 1:4257888/1‑101 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt < 2:5381964/101‑1 (MQ=255)
cTGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAATTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGtt > 1:5411474/1‑101 (MQ=255)
tGAGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGGGCGACGCGCCAGCCCCGATAGAGCTGGCCGGCATCGTTc > 2:609579/1‑101 (MQ=255)
aGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCgg > 2:5881876/1‑101 (MQ=255)
aGGGGTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCCCGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCgg > 2:1805977/1‑101 (MQ=255)
ggggTTG.GGGCG.GG.GGT.G.TCCCCCCGCACGGATAGCA.CGGCGTTCAGTTCACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCggg < 1:3823643/101‑1 (MQ=255)
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TTTCACGGCCGAAATCGGCGAAGTCGGCAGAAAGGATCGAGGGGGCGATCTTGATGGAACGGTCGAAGGTCATGTCGGTCTCCTGAGGGGTT..GGGC..GG.GGT.G.T.CCCCCGCCCGGATAGCACCGGCGTTCAGTTAACGCCCAGAGCGACGCGCCAGCCCGGATAGAGCTTGTCGGCATCGTTCGGGAA > NC_014034/1974235‑1974421
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
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