Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 2,757,444 | +C | 1.6% | intergenic (+321/‑248) | RCAP_rcc02566 → / → RCAP_rcc02567 | reverse transcriptase catalytic domain‑containing protein/resolvase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 2,757,444 | 1 | .→C | 1.6% | 6.8 0.0 ‑0.9 | 312 | intergenic (+321/‑248) | RCAP_rcc02566/RCAP_rcc02567 | reverse transcriptase catalytic domain‑containing protein/resolvase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/2): ref base (163/144): total (166/146) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.18e-01 |
Only 100 of 389 total aligned reads displayed.
AGGCCGCCCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCTCTCC > NC_014034/2757344‑2757544
|
ggCCGCCCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.c > 2:4731607/1‑101 (MQ=255)
gccgccCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cc < 2:1720202/101‑1 (MQ=255)
ccgcccgcACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccc < 2:6961312/101‑1 (MQ=255)
cgcccgcACGGCAAGCCCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cccc < 2:8638835/101‑1 (MQ=255)
cccgcACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.cccccc > 1:6618763/1‑101 (MQ=255)
ccgcGCGGCAAGCCCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccc < 2:4051275/101‑1 (MQ=255)
gcACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccccc < 1:1741694/101‑1 (MQ=255)
gcACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.ccccccccc > 2:7895433/1‑101 (MQ=255)
cACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCg < 1:9033017/101‑1 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAGGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt > 1:8217553/1‑101 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCggg > 2:4119940/1‑100 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt > 2:9126162/1‑101 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt > 2:8429838/1‑101 (MQ=255)
cGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGAGCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGt < 2:5082455/101‑1 (MQ=255)
ggCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTg > 2:7540930/1‑101 (MQ=255)
accgcCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGgccg < 2:3080009/99‑1 (MQ=255)
aGCGCCAGCCGCAAAACCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGgccg < 2:6252307/101‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCAGATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGccgccc < 1:6401429/100‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGGGGccgcccg > 1:671617/1‑101 (MQ=255)
cAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGccgcccgc > 2:3199784/1‑101 (MQ=255)
aGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCcgcccccc > 1:5878560/1‑101 (MQ=255)
ccGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATTTTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCCCCCCCCCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.GCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCt < 2:2821695/101‑1 (MQ=255)
cGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTg < 2:8220786/101‑1 (MQ=255)
cGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTg < 1:8689828/101‑1 (MQ=255)
cGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTGGGCGGAAAAACCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAGCCCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCt < 2:6069354/101‑1 (MQ=255)
cAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTggg > 1:3944648/1‑101 (MQ=255)
aaaaGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGc > 1:465401/1‑101 (MQ=255)
aGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCg < 1:4743699/101‑1 (MQ=255)
gCGATGGGGGCCGCATATTTTGCCGGAAAAATCCGAGCCACCACCCCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGt < 2:1100367/101‑1 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCgct > 2:5890366/1‑99 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt > 1:8031473/1‑101 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt > 1:7338169/1‑101 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt < 2:5393405/101‑1 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt > 1:1114457/1‑101 (MQ=255)
cGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGtt > 1:4292152/1‑101 (MQ=255)
gATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTc < 1:4158292/101‑1 (MQ=255)
gATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTc < 1:5340128/101‑1 (MQ=255)
gATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTc < 1:6078066/101‑1 (MQ=255)
gATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGGGGCCGCCACCACTGGACCCGtcc > 1:7524626/1‑99 (MQ=255)
aTCGGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAACCCGAGCCACCCCCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCa < 2:3569614/101‑1 (MQ=255)
aTCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCa > 1:3493891/1‑101 (MQ=255)
tCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGCGGCCGCCCCCCCCGGGCACGTTCac > 2:197646/1‑100 (MQ=255)
cggggCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAgg < 1:5072537/99‑1 (MQ=255)
cAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAgg < 1:5586471/101‑1 (MQ=255)
aGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAggc > 1:4950568/1‑100 (MQ=255)
gggCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTc > 1:3041067/1‑101 (MQ=255)
ggCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCg > 2:808559/1‑101 (MQ=255)
ccGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGcc < 2:3395428/101‑1 (MQ=255)
gCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCTCGTTCAGGTCGCCCa < 1:7643498/101‑1 (MQ=255)
gCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCa > 2:5302046/1‑101 (MQ=255)
cATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAg > 2:7646763/1‑101 (MQ=255)
atatTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCCGGTCGCCCAGc > 2:2313531/1‑101 (MQ=255)
atTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCAc < 1:6248023/101‑1 (MQ=255)
atTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCAc > 2:7184521/1‑101 (MQ=255)
atTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGGCGCCCAGCAc > 1:3674825/1‑101 (MQ=255)
ttttGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACg < 2:2028039/101‑1 (MQ=255)
tttGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGATCCGGTCGCCCAGCACGc > 1:456556/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGGGGCCCCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCCCGCTc > 1:3248423/1‑101 (MQ=255)
tGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG..CCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTcc < 2:1563292/101‑1 (MQ=255)
gCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTccc > 1:2398595/1‑101 (MQ=255)
gCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTccc < 1:3982651/101‑1 (MQ=255)
gCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTccc > 2:3698335/1‑101 (MQ=255)
ggAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGa > 1:7106289/1‑101 (MQ=255)
gAAAAACCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAg < 1:1187068/101‑1 (MQ=255)
aaaaTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgc > 1:8971577/1‑101 (MQ=255)
aaaTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGGTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCCAGgcc > 2:1860287/1‑101 (MQ=255)
aTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgccgc < 2:2468250/101‑1 (MQ=255)
aTCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGgccgc > 2:5708890/1‑101 (MQ=255)
ccGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGccc < 2:4529351/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGCGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGccc > 2:4257534/1‑101 (MQ=255)
gacccaccaCCTCGACCGAAGTCCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa < 2:4625920/98‑1 (MQ=255)
gAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCTCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa < 2:3944533/101‑1 (MQ=255)
gAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCa < 2:4897772/101‑1 (MQ=255)
aGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAg > 2:6759109/1‑101 (MQ=255)
aGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAg < 1:8430201/101‑1 (MQ=255)
gCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCCGGGCCCGTTCAGGGCGCCCAGCCCGCTCCCGAGGCCGCCCCAgc > 2:6839878/1‑101 (MQ=255)
caccacCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAgcgc > 1:7031933/1‑101 (MQ=255)
caccacCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAgcgc > 1:3771065/1‑101 (MQ=255)
caccacCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAgcgc > 1:4415372/1‑101 (MQ=255)
accaccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCGCCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGGCGCCCAGCACGCTCCCCTGGCCGCCCCCGggcc > 2:2547660/1‑101 (MQ=255)
ccTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGccc > 1:2084244/1‑101 (MQ=255)
tCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGccccc > 1:7189833/1‑100 (MQ=255)
gACGGAAGTGCAGCCGCGCCG.CCCCCCCCCGGTGCCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTcc < 2:2950489/101‑1 (MQ=255)
gACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTcc < 1:1417078/101‑1 (MQ=255)
gACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTcc < 1:9143062/101‑1 (MQ=255)
aCCGAAGTGCCGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTccc < 1:8327994/101‑1 (MQ=255)
aGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCCCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAc > 1:7970129/1‑101 (MQ=255)
tGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAccc < 1:6115490/101‑1 (MQ=255)
gCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAcccc < 2:1377242/101‑1 (MQ=255)
gCAGCCGCGCAC.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCAcccc < 2:9061258/101‑1 (MQ=255)
aGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCgg > 2:2673475/1‑101 (MQ=255)
gcgcgCAC.CCCCCCCCCGGCGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCa < 1:577889/100‑1 (MQ=255)
ccGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGcc > 2:59700/1‑100 (MQ=255)
cgcgCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCAc < 2:5558487/101‑1 (MQ=255)
cgcAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACct < 1:2855408/101‑1 (MQ=255)
cgcAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACct > 1:8889187/1‑101 (MQ=255)
cAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACctct < 2:8842978/101‑1 (MQ=255)
aG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCtctc > 1:2689446/1‑101 (MQ=255)
aG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCtctc > 2:3367266/1‑101 (MQ=255)
g.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCTCTcc < 2:6549798/101‑1 (MQ=255)
|
AGGCCGCCCGCACGGCAAGCGCCAGCCGCAAAAGCGATCAGGGCCGCATATTTTGGCGGAAAAATCCGAGCCACCACCTCGACCGAAGTGCAGCCGCGCAG.CCCCCCCCCGGTGGCCGCCCGCCCTGGGCCCGTTCAGGTCGCCCAGCACGCTCCCGAGGCCGCCCCAGCGCCGCCCCTCCCGCCACCCCGGCACCTCTCC > NC_014034/2757344‑2757544
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|