| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 586,502 | +G | 98.7% | intergenic (‑4/+31) | RCAP_rcc00547 ← / ← RCAP_rcc00548 | glutaredoxin family protein/BolA family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 586,502 | 1 | .→G | 98.7% | 7.0 ‑0.4 ‑1.2 | 457 | intergenic (‑4/+31) | RCAP_rcc00547/RCAP_rcc00548 | glutaredoxin family protein/BolA family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (256/195): ref base (4/2): total (260/197) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.03e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.69e-02 | ||||||||||
Only 100 of 510 total aligned reads displayed.
TGGAAAACCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.GGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGCCTT > NC_014034/586402‑586597
|
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gAAAACCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.gg > 2:6703951/1‑101 (MQ=255)
gAAAACCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.gg > 2:6932182/1‑101 (MQ=255)
gAAAACCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.gg < 1:1439682/101‑1 (MQ=255)
gAAAACCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.gg > 2:3608076/1‑101 (MQ=255)
aaaaCCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.ggg > 1:7391393/1‑101 (MQ=255)
aaaaCCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATATAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCATTGATCTAGTCGAGCGCAGTCAT.GGGA.ggg > 1:9146371/1‑101 (MQ=255)
aaaCCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.gggg > 1:2419310/1‑100 (MQ=255)
aaaCCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.gggg > 2:1719216/1‑100 (MQ=255)
ccGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.ggggtcct < 2:4138000/101‑6 (MQ=255)
ccGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.ggggtcct > 2:45266/1‑96 (MQ=255)
cGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCtt < 1:8674881/101‑1 (MQ=255)
cGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCtt > 2:5989187/1‑101 (MQ=255)
gCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCCATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCttt > 2:1682841/1‑101 (MQ=255)
cATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTc > 1:7055890/1‑101 (MQ=255)
aTTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCt < 1:4425052/101‑1 (MQ=255)
tGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGc > 1:4619393/1‑101 (MQ=255)
gCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCg > 1:7811239/1‑101 (MQ=255)
gCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGAGCGGTCAT.GGGAGGGGTCATTTCTGca > 2:8896109/1‑100 (MQ=255)
cATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAAc > 2:5119849/1‑101 (MQ=255)
cATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAAc < 2:508253/101‑1 (MQ=255)
cATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAAc < 1:2468303/101‑1 (MQ=255)
aTTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACg < 2:1382251/101‑1 (MQ=255)
ttCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTg > 2:6532165/1‑101 (MQ=255)
tCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGa < 1:3963469/101‑1 (MQ=255)
ccTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGac > 1:6831186/1‑100 (MQ=255)
ccTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGaa < 2:727763/101‑1 (MQ=255)
tCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACcg > 2:2682964/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACcgc > 1:8455646/1‑101 (MQ=255)
gTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACcgcg > 2:3035477/1‑101 (MQ=255)
gTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACcgcg < 2:7165349/101‑1 (MQ=255)
gCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATGGGCCTTGATCTGGTCGCGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGGGAACCGCGGc > 1:2716837/1‑101 (MQ=255)
gCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGc > 1:6122899/1‑101 (MQ=255)
gCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGc > 2:7107294/1‑101 (MQ=255)
ccTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTc > 1:6773360/1‑101 (MQ=255)
cTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCa > 2:2811152/1‑101 (MQ=255)
cTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCa > 1:2932643/1‑101 (MQ=255)
ttCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCAt < 1:889002/101‑1 (MQ=255)
ttCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCAt < 1:3383300/101‑1 (MQ=255)
tCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCAtt > 2:8743053/1‑101 (MQ=255)
cATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTc > 1:543360/1‑101 (MQ=255)
aTGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCg > 2:196409/1‑101 (MQ=255)
aTGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCg < 2:784227/101‑1 (MQ=255)
tGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCgg > 2:244479/1‑101 (MQ=255)
gTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGc > 1:3258093/1‑101 (MQ=255)
gTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGc < 2:7534097/101‑1 (MQ=255)
aaaGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCt > 1:198005/1‑101 (MQ=255)
aaaGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCt > 1:6548663/1‑101 (MQ=255)
gATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTtggt > 2:7724146/1‑101 (MQ=255)
aTGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTtggtg > 1:5356377/1‑101 (MQ=255)
tGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTtggtgg < 2:3112939/101‑1 (MQ=255)
gACATCGTTTCCGGCGATATAGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTggtggt > 1:8224907/1‑101 (MQ=255)
aCATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTc < 2:3461359/101‑1 (MQ=255)
cATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCa < 1:2140482/101‑1 (MQ=255)
cATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCa < 2:2280899/101‑1 (MQ=255)
aTCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAg > 1:7928525/1‑101 (MQ=255)
aTCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAg < 2:1434378/101‑1 (MQ=255)
tCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAgg > 1:5129031/1‑101 (MQ=255)
gTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGc > 2:8255609/1‑101 (MQ=255)
gTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGc > 2:9158677/1‑101 (MQ=255)
gTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGGCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCTAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGc > 1:183859/1‑101 (MQ=255)
tttCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCa > 2:5528969/1‑101 (MQ=255)
ggATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGt < 2:3214335/100‑1 (MQ=255)
cGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGt > 1:9195633/1‑101 (MQ=255)
gATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTg > 1:7175237/1‑101 (MQ=255)
atatCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGc > 2:9044010/1‑101 (MQ=255)
tatCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCa < 1:3608184/101‑1 (MQ=255)
tatCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCa > 1:371955/1‑101 (MQ=255)
tatCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCa > 2:4346243/1‑101 (MQ=255)
atCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCACGGGCGTGCAg > 2:5766688/1‑101 (MQ=255)
atCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAg < 2:6286648/101‑1 (MQ=255)
cGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAgcg > 1:429724/1‑101 (MQ=255)
ggCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAgcgg > 1:891646/1‑101 (MQ=255)
cTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCATGGGGG.GGGCCCTTCCTGCGAACCGTGAACCCCGGCCCTTTGGGCCTTGGGGGCCGGGCCAAGGCCGGCCAgcgggga > 1:1224140/1‑98 (MQ=255)
cTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGgcgc > 2:4797499/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCAt > 1:4812934/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCAt > 2:4005025/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCAt > 1:6071753/1‑101 (MQ=255)
gATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGGGGGCAGCGGCGCAtt > 2:7359749/1‑101 (MQ=255)
aTCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTc > 1:5594299/1‑101 (MQ=255)
aTCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTc > 2:1302426/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCg > 2:4979640/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGcc > 2:8129451/1‑101 (MQ=255)
tCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCg < 1:5940312/101‑1 (MQ=255)
tCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCg < 1:764132/101‑1 (MQ=255)
tCGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCg > 1:3824960/1‑101 (MQ=255)
cGAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGt < 1:2811251/101‑1 (MQ=255)
gAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTc > 1:5783708/1‑101 (MQ=255)
gAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTc > 1:1716046/1‑101 (MQ=255)
gAGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTc < 2:8480837/101‑1 (MQ=255)
aGTGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTcc < 2:6121584/101‑1 (MQ=255)
tGCGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCAt < 1:6440540/101‑1 (MQ=255)
cGGTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATcg < 2:4676234/101‑1 (MQ=255)
gTCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATcgcg > 1:1023529/1‑101 (MQ=255)
tCAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCgcgc > 1:7695228/1‑101 (MQ=255)
cAT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGcc < 1:4103570/101‑1 (MQ=255)
aT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGCCt > 2:5317609/1‑101 (MQ=255)
aT.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGCCt > 2:3649428/1‑101 (MQ=255)
t.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGCCtt > 1:1558780/1‑101 (MQ=255)
t.GGGAGGGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGCCtt > 2:1059146/1‑101 (MQ=255)
|
TGGAAAACCCGCATTGCGGCATTTCCTTCGTGCCCTTCATGTAAAGGATGACATCGTTTCCGGCGATATCGGCCTTGATCTGGTCGAGTGCGGTCAT.GGGA.GGGTCCTTTCTGCGAAACGTGAACCGCGGCTCATTCGGCCTTGGTGGTCAGGGCAAGGGCGTGCAGCGGCGCATTCGGCCCGTCCATCGCGCCTT > NC_014034/586402‑586597
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|