New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NC_014034	= 222009	2142 (4.680)	2 (0.000)	2/196	42.1	0.00	coding (648/2748 nt)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
	?	NC_014034	222019 =	2155 (4.700)					coding (638/2748 nt)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTG..................................................  >  NC_014034/221910‑222009 ....................................................................................................GGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC  >  NC_014034/222019‑222068                                                                                                                                                        CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG                                                   >  1:4101454/1‑101 (MQ=31) CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG                                                   >  1:6609464/1‑101 (MQ=31) CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGG                                                   >  2:3125346/1‑101 (MQ=31)  GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG                                                  >  1:3644717/1‑101 (MQ=32)  GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG                                                  >  1:4170213/1‑101 (MQ=32)  GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG                                                  <  1:6879980/101‑1 (MQ=32)  GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG                                                  <  2:3893058/101‑1 (MQ=32)  GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG                                                  >  2:5896191/1‑101 (MQ=32)   GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGG                                                 >  1:2361337/1‑101 (MQ=32)                                                  TCGGTCGGGTCCGTGGAGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC  <  1:7535939/101‑1 (MQ=255)                                                                                                                                                        CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTG..................................................  >  NC_014034/221910‑222009 ....................................................................................................GGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC  >  NC_014034/222019‑222068 Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 20 ≤  ATCG  < 27 ≤  ATCG  < 33 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG