New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_014034 221953 =457 (1.150)124 (0.310) 45/174 16.3 0.21 coding (704/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
?NC_014034 = 222128 452 (0.990)coding (529/2748 nt) RCAP_rcc00185 hypothetical protein
Rejected: Position hash score below cutoff.

Only 100 of 580 total aligned reads displayed.

GGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221853‑222053
                                                                                                    |                                                                                                    
 gTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggt                                                                                                     >  2:7258439/1‑101 (MQ=255)
   ttCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCtcggtcg                                                                                                   >  1:6190631/1‑101 (MQ=255)
      gCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggat                                                                                                >  1:2100444/1‑101 (MQ=255)
          gTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggt                                                                                            >  1:5573483/1‑101 (MQ=255)
             cccGCCACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGGGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgg                                                                                         <  1:16580/101‑1 (MQ=255)
             cccGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggccgg                                                                                         >  2:8871877/1‑101 (MQ=255)
                 acacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGGGGGGGCTCGGTCggatcgggcgggtcc                                                                                     >  1:6295268/1‑101 (MQ=255)
                 acacCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGATCATCGACGGGGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatgggtcgggtcc                                                                                     >  2:6860260/1‑101 (MQ=255)
                         gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                             <  1:5658817/101‑1 (MQ=255)
                          ccGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                            <  1:5352247/101‑1 (MQ=255)
                            gacgCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCACGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                          >  1:5869275/4‑101 (MQ=255)
                            gAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggt                                                                          >  1:6478024/1‑101 (MQ=255)
                            gAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcggggccgtgggatcggt                                                                          >  2:6633572/1‑101 (MQ=255)
                             aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                         >  2:155510/1‑101 (MQ=255)
                             aGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                         >  2:5933088/1‑101 (MQ=255)
                                cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                      <  1:8516079/101‑1 (MQ=255)
                                 ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                     <  1:8339104/101‑1 (MQ=255)
                                  tCGGTGTTGGGGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGGCGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                    <  1:4100478/101‑1 (MQ=255)
                                   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                   <  2:3190026/101‑1 (MQ=255)
                                   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                   <  1:1096127/101‑1 (MQ=255)
                                   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                   >  2:4415755/1‑101 (MQ=255)
                                    ggTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                  >  1:7988753/1‑101 (MQ=255)
                                       gtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcagatcggaag                                                               >  1:3870224/1‑91 (MQ=255)
                                         tggtggTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                             >  2:1081459/1‑101 (MQ=255)
                                         tggtggTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                             <  1:7043513/101‑1 (MQ=255)
                                               tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                       >  1:9185319/1‑101 (MQ=255)
                                                cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                      >  1:7725133/1‑101 (MQ=255)
                                                 aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggaccggccgggtccgcgggatcggtcgg                                                     >  1:9010341/1‑101 (MQ=255)
                                                  gCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                    <  2:1739347/101‑1 (MQ=255)
                                                   ggTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                   <  2:2293395/100‑1 (MQ=255)
                                                       ggcGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                               <  2:4091764/99‑1 (MQ=255)
                                                          ggATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                            <  2:3893058/101‑1 (MQ=255)
                                                           gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggg                                           >  1:2361337/1‑100 (MQ=255)
                                                                 gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtg                                     >  2:4930028/1‑100 (MQ=255)
                                                                 gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtgggtc                                     >  1:6712186/1‑101 (MQ=17)
                                                                  cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                    >  2:370898/1‑101 (MQ=255)
                                                                   tcagcggtggTGGGCGTCGGATGCGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                   <  2:6711918/93‑1 (MQ=14)
                                                                   tCAGCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                   >  1:8811806/1‑101 (MQ=255)
                                                                    cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                  >  1:5207715/1‑101 (MQ=255)
                                                                       cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                               <  1:6860532/101‑1 (MQ=255)
                                                                        ggcGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGGTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                              <  2:7077052/99‑1 (MQ=18)
                                                                         gcGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                             <  2:3347804/100‑1 (MQ=255)
                                                                           ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                           >  2:203404/1‑99 (MQ=255)
                                                                            gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                          >  1:174172/1‑101 (MQ=255)
                                                                            gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                          <  1:6065900/101‑1 (MQ=255)
                                                                             tGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggt                         >  2:9187951/1‑100 (MQ=255)
                                                                              gtgCGTGGGATGGGTGGGGTCCGTCGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                        <  1:5499083/99‑1 (MQ=11)
                                                                               ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                       >  2:5355372/1‑101 (MQ=255)
                                                                                  gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                    >  1:307924/1‑101 (MQ=255)
                                                                                  gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                    >  1:8267480/1‑101 (MQ=255)
                                                                                  gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                    <  2:7524439/101‑1 (MQ=255)
                                                                                   tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                   <  2:1252707/101‑1 (MQ=255)
                                                                                   tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                   <  1:370906/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                 <  1:149785/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     gcattggTGGGGTCCGTCGGGTCGGGCGGGGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                 <  1:2595269/95‑1 (MQ=11)
                                                                                      gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                >  1:7851159/1‑101 (MQ=255)
                                                                                      gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                <  1:4892871/101‑1 (MQ=255)
                                                                                      gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                >  2:8393073/1‑101 (MQ=255)
                                                                                      caTGCGTGGGTCCCGTGGCATCCGTGGGGTCCGTCGGCTCCGTCGGATCTGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                <  2:5415418/100‑2 (MQ=2)
                                                                                       gtccGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt               <  2:1399593/98‑3 (MQ=11)
                                                                                       agcggTGTGCTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAt               <  2:8270357/97‑1 (MQ=11)
                                                                                       aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt               >  1:4744477/1‑101 (MQ=255)
                                                                                        tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc              <  2:3657783/101‑1 (MQ=255)
                                                                                        tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc              <  2:5869040/101‑1 (MQ=255)
                                                                                        tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc              <  2:2752154/101‑1 (MQ=255)
                                                                                         gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc             <  1:505920/101‑1 (MQ=255)
                                                                                         gCGTGGGATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc             <  1:4232956/101‑1 (MQ=255)
                                                                                         ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc             <  2:4505338/100‑1 (MQ=1)
                                                                                          ggtgccagcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg            <  1:2826597/93‑1 (MQ=255)
                                                                                            ggggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg          <  2:8990829/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             cgggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgg         >  2:1909058/8‑101 (MQ=11)
                                                                                              gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg        <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)
                                                                                               ggtcggtggtATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa       <  1:4654266/99‑1 (MQ=11)
                                                                                                ggcggtcggCTCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt      <  1:6925060/99‑1 (MQ=14)
                                                                                                cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCTTGGGac      >  1:2207557/1‑100 (MQ=255)
                                                                                                cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggt      <  1:8152441‑M2/101‑5 (MQ=255)
                                                                                                atcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGAt      >  2:6313434/2‑101 (MQ=11)
                                                                                                 tcggtgggATCGGACGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     <  1:3181493/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                 tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc     <  2:5573276/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                 tccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     <  2:7895806/98‑1 (MQ=11)
                                                                                                 tccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     >  2:857333/4‑101 (MQ=11)
                                                                                                 tccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     >  2:2868873/4‑101 (MQ=11)
                                                                                                 gcggttggATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc     <  2:2139018/100‑1 (MQ=14)
                                                                                                 gccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc     <  2:306421/98‑1 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcg    >  1:4420920/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                  cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg    <  2:6119490/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                  cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg    <  2:6545620/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                  cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg    <  2:4301543/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ccgtcggGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg    <  2:7740251/99‑1 (MQ=14)
                                                                                                  ccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg    <  1:7371330/99‑1 (MQ=11)
                                                                                                   ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAgcgg   >  2:4731764/1‑101 (MQ=11)
                                                                                                   ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg   >  2:5098531/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                   ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGAGCCGTGgggtcgg   <  2:2488806‑M2/101‑8 (MQ=255)
                                                                                                   cgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg   >  1:3625964/2‑101 (MQ=11)
                                                                                                   cgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg   >  2:3586554/2‑101 (MQ=14)
                                                                                                    gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt  <  1:863427/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGATCGGTCGCGTCCGCGGGCtcggg  >  1:1330125/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGGCGGGGCCGGGGGAtcggg  >  2:8121971/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtcggt  <  1:338467‑M2/101‑9 (MQ=255)
                                                                                                    gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcggg  >  2:8678673/1‑100 (MQ=14)
                                                                                                    |                                                                                                    
GGTTTCGCCGGTGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGT  >  NC_014034/221853‑222053

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 16 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 32 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG