| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 221,964 | 0 | C→G | 1.5% | 26.5 ‑1.3 ‑2.2 | 1348 | P231P (CCG→CCC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (13/8): ref base (642/684): total (655/693) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.73e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.85e-03 | ||||||||||
Only 100 of 3091 total aligned reads displayed.
TGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAG > NC_014034/221864‑222064
|
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 1:4416835‑M1/92‑101 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:1996212‑M1/10‑1 (MQ=255)
ggatgggtcggatccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 2:2593899‑M1/91‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 2:377164‑M1/11‑1 (MQ=255)
gACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGGCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtc < 2:678497/101‑1 (MQ=255)
cgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg < 1:5250155‑M1/19‑1 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggg < 1:4792462‑M1/21‑2 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga < 1:7121482‑M1/21‑1 (MQ=255)
cGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggat < 2:3963544/101‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccg > 2:2786039‑M1/77‑96 (MQ=255)
gacgCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCACGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 1:5869275/4‑101 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:6207657‑M1/29‑1 (MQ=255)
ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt < 2:633877/101‑1 (MQ=255)
tggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc > 1:5389757‑M1/69‑101 (MQ=255)
cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 2:5360299/101‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 1:243592‑M1/34‑1 (MQ=255)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg < 2:9055818‑M1/34‑1 (MQ=255)
tgtTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg > 2:5532364/1‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 1:6852172‑M1/43‑1 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:4079700‑M1/46‑1 (MQ=255)
cggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:4531407‑M1/46‑1 (MQ=255)
gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt > 2:5844549‑M1/53‑101 (MQ=255)
atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGAt < 1:2787113‑M1/49‑1 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATc < 1:9039897‑M1/50‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTcc < 1:2122663‑M1/51‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGATCGGATCCg < 2:5967596‑M1/52‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:2300342‑M1/50‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:3330911‑M1/52‑1 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:7293395‑M1/50‑101 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCAGTggg < 1:7450249‑M1/56‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:4502957‑M1/63‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:4695134‑M1/39‑101 (MQ=255)
gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtg > 2:4930028/1‑100 (MQ=255)
gcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:3665841/1‑101 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:4779203‑M1/38‑101 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 1:8879027‑M1/64‑1 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:6032070‑M1/65‑1 (MQ=255)
ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:1892943‑M1/65‑1 (MQ=255)
cATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCggg > 2:2424575/1‑101 (MQ=255)
atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgatcggtcggac < 1:1354683‑M1/67‑3 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:3167436‑M1/68‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:8126496‑M1/33‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:3000604‑M1/33‑101 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGtcg < 2:4315092‑M1/69‑2 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:7947811‑M1/33‑101 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggagcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:8226089‑M1/33‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:6497843‑M1/70‑1 (MQ=255)
aCGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgc > 1:5061624/1‑100 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:3934579‑M1/73‑1 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 2:6652716‑M1/28‑101 (MQ=255)
gTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:8552879/1‑101 (MQ=255)
gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa > 2:8360518‑M1/27‑101 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 2:7503517‑M1/26‑101 (MQ=255)
ggccgtgggatccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt > 2:4109857‑M1/26‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg > 2:6928556‑M1/24‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:7255796‑M1/79‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 2:768692‑M1/23‑101 (MQ=255)
cGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:778936/101‑1 (MQ=255)
gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:8267480/1‑101 (MQ=255)
tgggagtggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:961469‑M1/21‑101 (MQ=255)
tgcgATGCGTCGCCTCCCTGGCATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:8684869/98‑1 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcgggtc < 1:1789627‑M1/86‑4 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:6389639‑M1/15‑101 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:7650089‑M1/14‑101 (MQ=255)
cgatcTCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 2:6170414/97‑2 (MQ=11)
gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg < 1:1000386/98‑1 (MQ=11)
gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGGTCGGATCCGTggg < 2:1428570‑M1/92‑1 (MQ=255)
gggtccgggGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:2612961‑M1/10‑101 (MQ=255)
gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:3230299‑M1/94‑1 (MQ=255)
gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCCGGAt > 1:8371923/5‑101 (MQ=11)
tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGggacc < 2:5641603‑M1/95‑3 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcg > 2:1046960/6‑101 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGAtcgg > 2:2246658/1‑101 (MQ=11)
ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 1:6966123/1‑101 (MQ=255)
gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtcggt > 2:465939/10‑101 (MQ=11)
tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:1739039/93‑1 (MQ=14)
gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCCTGGGAtcgggcg > 2:8493712/2‑101 (MQ=11)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGGCGGGTCCGGGGGAtgcgtcg > 2:3057508/2‑101 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:5541720/1‑101 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt < 2:791780/100‑1 (MQ=11)
gtcggtcgggtccgggggagcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggat > 1:6678659‑M2/2‑88 (MQ=255)
gtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggctcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:6511973/97‑1 (MQ=14)
atcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCgggc > 1:1650421/1‑100 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggat > 1:1510716‑M2/1‑88 (MQ=255)
gcggtcggagccgtgggatcgggcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:3501890/100‑1 (MQ=11)
gccgtcggctccgtgggatcggtcggatccgtgcgatggGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:3622128/98‑1 (MQ=14)
tggtcgtgtcctcgggatcgggcggtgcctggagatcGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:4242956/100‑1 (MQ=11)
gggtcgggttcgtggggtcagtcgggtccttgggttcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:3816674/100‑1 (MQ=14)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:209718/101‑1 (MQ=11)
cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:871610/101‑1 (MQ=14)
ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGCGCCGTCGGGCCGGTCGAGTcc > 2:3440298/3‑101 (MQ=11)
ggtcgcgtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:1580533/101‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGATcggc > 1:4917920/1‑98 (MQ=11)
gtcggggccgtggggtccgtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:5650767/101‑1 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGAGGGATCCgg > 2:8866350/1‑100 (MQ=11)
gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtc > 2:808803‑M2/2‑83 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:1170498‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGACGCGACCgggg > 2:1226627/1‑98 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 2:5201140‑M2/101‑3 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 2:7130091/1‑99 (MQ=11)
|
TGCCCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAG > NC_014034/221864‑222064
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|