BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,976	A→G	7.8%	D227D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,976	0	A→G	7.8%	222.0 ‑1.4 ‑1.9	1395	D227D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (49/62): ref base (642/641): total (691/704)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.37e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.30e-02

Only 100 of 3580 total aligned reads displayed.


TCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221876‑222076


 gtcggtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                                     >  1:8519168‑M1/80‑101 (MQ=255)


       gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggggtcggtcg                                                                                               <  2:120975‑M1/28‑1 (MQ=255)


        ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                              <  1:8226438‑M1/29‑1 (MQ=255)


           tCGGTGTTGGGGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGGCGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                           <  1:4100478/101‑1 (MQ=255)


             ggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                         >  1:7872314‑M1/68‑101 (MQ=255)


             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                                         <  1:243592‑M1/34‑1 (MQ=255)


                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggtggggtccgtggg                                                                                     <  2:1856594‑M1/38‑1 (MQ=255)


                  gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                                    <  2:5641312‑M1/39‑1 (MQ=255)


                   gtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                                                   >  1:5777158‑M1/62‑101 (MQ=255)


                   atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtggggtccgtggggc                                                                                   <  2:6181536‑M1/40‑3 (MQ=255)


                     ccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggccgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                                                 >  2:5330570‑M1/60‑101 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                               <  1:7053752‑M1/44‑1 (MQ=255)


                        tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtc                                                                              >  1:3645376‑M1/57‑101 (MQ=255)


                        ggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                              >  1:1957909‑M1/57‑101 (MQ=255)


                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcg                                                                             <  2:8058997‑M1/46‑4 (MQ=255)


                          ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgagtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgg                                                                            <  1:8089125‑M1/47‑1 (MQ=255)


                            gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                                                                          >  2:5844549‑M1/53‑101 (MQ=255)


                             tccgtcgggtctgtgggatcggtcggctccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                         >  2:5505114‑M1/52‑101 (MQ=255)


                              cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                        <  1:4424893‑M1/51‑1 (MQ=255)


                               ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGATCGGATCCg                                                                       <  2:5967596‑M1/52‑1 (MQ=255)


                                 tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTg                                                                     <  1:4722601‑M1/54‑1 (MQ=255)


                                   gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                   <  1:4987413‑M1/56‑1 (MQ=255)


                                    gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                  <  1:4571348‑M1/57‑1 (MQ=255)


                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGgac                                                                 <  1:1138735‑M1/58‑2 (MQ=255)


                                     aTCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                 <  1:146536/101‑1 (MQ=255)


                                      tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                >  2:8816667‑M1/43‑101 (MQ=255)


                                       ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                               <  1:5953277‑M1/60‑1 (MQ=255)


                                        cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                              <  2:6511713‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                            tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                          >  2:4304922/1‑101 (MQ=255)


                                             gatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                         <  1:560873‑M1/66‑1 (MQ=255)


                                                cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      >  1:6643677‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                                cggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                      >  1:1754768‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                                 gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                     >  1:6477842/1‑101 (MQ=255)


                                                   cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                   >  1:3815652/1‑101 (MQ=255)


                                                     ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                 >  2:6652716‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGa                                                <  1:6344391‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtgcgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                               >  1:3295990‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                                        tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              >  1:3158350‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                        ggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  1:2999085/101‑1 (MQ=255)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                             >  1:2120434‑M1/24‑101 (MQ=255)


                                                          cgtgggattggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                            >  1:7572809‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                          cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                            <  1:8348388‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                                            cttccgatctGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                          <  1:1622490/92‑1 (MQ=1)


                                                                  cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                    <  1:8702080‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                                                  cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                    <  2:2457090‑M1/87‑1 (MQ=255)


                                                                    gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                  >  2:6344142‑M1/13‑101 (MQ=255)


                                                                     tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGtc                                 <  1:8852434/101‑2 (MQ=1)


                                                                       gggtcgggcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTcgg                               <  1:1000386/98‑1 (MQ=11)


                                                                       gggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                               <  2:4108302‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                                       gggtccgggGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                               >  1:2612961‑M1/10‑101 (MQ=255)


                                                                         gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                             <  2:3230299‑M1/94‑1 (MQ=255)


                                                                          tccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                            >  1:4826645‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                          tccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                            >  2:8345471‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                                            cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                          <  1:5484569‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                             gtcggcgctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt                         <  2:219131/92‑1 (MQ=11)


                                                                             gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg                         >  2:4480485/1‑100 (MQ=11)


                                                                              tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                        >  2:4751412‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                                                              gcggGTCCGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc                        <  2:2623666/100‑1 (MQ=14)


                                                                               gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGGCGGGCGGCTGCGTGGGGtccgcgg                       >  2:9031657/2‑96 (MQ=11)


                                                                               gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                       >  1:7727580/2‑101 (MQ=14)


                                                                               gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                       <  2:5094469/100‑1 (MQ=11)


                                                                               gggatccgtcgggtccgttggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcg                       <  2:375426/100‑1 (MQ=11)


                                                                               gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                       <  2:7120780‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                               cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                       >  1:1314869/1‑101 (MQ=255)


                                                                               cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggccg                       >  1:4263292/1‑101 (MQ=11)


                                                                                 gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGAtcggtcgga                     >  2:746539/1‑100 (MQ=14)


                                                                                 gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtacggcggg                     >  2:8485001/1‑93 (MQ=11)


                                                                                  ggccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                    <  2:139049/97‑1 (MQ=14)


                                                                                  atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGTCgggg                    >  2:1683549/1‑100 (MQ=11)


                                                                                  atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCgggc                    >  2:3069314/1‑100 (MQ=11)


                                                                                   gtcgtggcgtccttgggattggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                   <  2:8194910/93‑1 (MQ=11)


                                                                                   gcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                   <  2:8658431/100‑1 (MQ=11)


                                                                                    ctgtcgggtccgacggatcagacgtgtcggtcggatctGTCGGGTCAGATGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                  <  2:4879630/99‑1 (MQ=0)


                                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                  >  2:3592206/1‑101 (MQ=11)


                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggtgtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                 <  1:7350778/101‑1 (MQ=14)


                                                                                     cggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                 <  2:103299/98‑1 (MQ=14)


                                                                                      gtccggtccgtcggatctgtcgggtccgtaggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                <  2:3428100/101‑1 (MQ=11)


                                                                                       tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg               >  1:5303347/1‑100 (MQ=11)


                                                                                        cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg              <  2:7268499‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                                        cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGtgg              >  2:6943455/1‑99 (MQ=11)


                                                                                        cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg              <  1:3495287‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                                                         gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg             >  1:7185914‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                                         gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGTCGGTCGGGACCGTGGGGtccgtcggaatcgtggg             >  2:7660211/1‑92 (MQ=11)


                                                                                         ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg             >  1:6900421/4‑101 (MQ=11)


                                                                                           gtccgtgggatcggtggggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt           <  1:3940306/101‑1 (MQ=14)


                                                                                           gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat           >  2:463088‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                                           atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat           <  1:6151295‑M2/100‑6 (MQ=255)


                                                                                            tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgtGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc          >  1:2795121/1‑101 (MQ=11)


                                                                                            tccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc          <  2:281312/101‑1 (MQ=11)


                                                                                            tccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc          >  1:6775867‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                                            gccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc          >  1:9195503‑M2/2‑95 (MQ=255)


                                                                                             ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGAtcg         >  2:6804344/1‑101 (MQ=14)


                                                                                             ccgtgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg         <  1:9031810/101‑1 (MQ=11)


                                                                                              cgtgggatcggccggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtccg        >  2:2045850/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                tgggatcggtcggatccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGCGGGAtcggtc      >  2:3957673/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                 ggggtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg     <  1:2295003/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                 gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg     <  2:7846932‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                                   gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggg   <  1:5115558‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                                                                    atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggg  <  2:2300275‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                                                    atcggtcggctccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat  >  2:1553925‑M2/1‑87 (MQ=255)


TCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221876‑222076

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 17 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 33 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG